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中国部分地区彝族及汉族人群中HLA-B*5701阳性率的研究

作　者: 李星美
导　师: 姚均
学　校: 中国疾病预防控制中心
专　业: 病原生物学
关键词: 凉山静脉吸毒人群男男性行为人群 HLA-B*5701 阿巴卡韦超敏反应
分类号: R394
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

研究背景：HLA-B*5701是经典HLA I类基因在B座位上众多基因型中的一个等位基因,由于它与HIV感染的疾病进程及治疗有密切的关系,因此近年来在HIV研究领域被加以关注。阿巴卡韦(ABC)是一种核苷类逆转录酶抑制剂,服用阿巴卡韦后的六周内,大约会有5-8%的人发生严重的超敏反应(ABC HSR),在一些临床研究中,HLA-B*5701等位基因与ABC HSR的发生具有密切的相关性。PREDICT实验中即表明,发生免疫超敏反应的患者中(利用皮肤斑贴实验验证是否发生免疫超敏反应),100%为HLA-B*5701阳性。因此美国等西方国家已经要求对即将接受治疗的HIV感染者进行药前HLA-B*5701等位基因筛查,以避免ABC HSR的发生。HLA-B*5701与HIV的密切相关不能不引起我们的重视,国外的相关研究显示,不同地区不同种族中HLA-B*5701的阳性率及药物毒性反应均具有较大差异,但是在我国目前很少有针对于HLA-B*5701的研究,我国人口中HLA-B*5701的阳性率尚无相关数据。研究目的：得出四川凉山州汉族及彝族静脉吸毒人群(IDUs)的HLA-B*5701阳性率；我国部分地区汉族MSM人群中HLA-B*5701的阳性率；比较汉族与彝族人口中HLA-B*5701阳性率的差异；比较我国不同民族中HLA-B*5701的阳性率与其他人种间研究所得阳性率的差异。研究方法：1.采集四川凉山州静脉吸毒人群(IDUs)HIV感染者(包括813名彝族,230名汉族)以及我国西宁、呼和浩特、南京、长春、荆州、海口、河北、牡丹江、太原9个地区汉族MSM人群共计1856名受试者的血液,利用EDTA抗凝,分离血浆及血球,从血球中提取人基因组DNA。2.利用序列特异性引物聚合酶链式扩增(SSP-PCR)技术,对HLA-B*5701特异性片段进行扩增。3.进行琼脂糖凝胶电泳,凝胶成像仪保存电泳结果,并判读该份样本是否为HLA-B*5701阳性。4.实验所得的HLA-B*5701阳性样本送到北京博富瑞基因诊断有限公司进行HLA-B位点分型测序,以验证该份样本为HLA-B*5701阳性。5.用SAS9.1软件进行统计分析。研究结果：1.本研究共检测样本1856份,其中凉山彝族静脉吸毒(IDUs)人群样本813份,汉族样本1043份(包括汉族MSM人群及凉山汉族IDUs的样本),发现彝族HLA-B*5701阳性2例,阳性率为0.246%,汉族HLA-B*5701阳性34例,阳性率为3.26%。对这两个民族进行统计学分析,卡方检验得,X2=21.8180,p<0.0001,本研究中全国汉族人群中HLA-B*5701的阳性率高于凉山彝族IDUs人群中的HLA-B*5701阳性率。2.在凉山地区1043份IDUs人群样本中(包括凉山汉族与彝族IDUs),通过SSP-PCR检测共发现5例HLA-B*5701阳性,四川凉山IDUs HIV感染者中的HLA-B*5701的阳性率为0.479%(5/1043),其中彝族人群中发现2例(均为男性),HLA-B*5701的阳性率为0.246%(2/813)；汉族3例(1例女性),汉族人群中HLA-B*5701的阳性率为1.30%(3/230)。凉山彝族IDUs与汉族IDUs之间比较,fisher精确概率值为p=0.0740,以现有数据,尚不能认为两者之间有统计学差异。3.在我国813份汉族未感染HIV的MSM人群中,共发现31例HLA-B*5701阳性,阳性率为3.81%。以西宁(6例/65)及呼和浩特(7例/84)所发现的HLA-B*5701的阳性例数最高,牡丹江及海口MSM人群中所抽取的共计200份的样本中,未发现HLA-B*5701阳性样本。西宁及呼和浩特的合计的HLA-B*5701阳性率为8.72%(13/149),除西宁及呼和浩特地区外我国其他7个地区汉族MSM人群中HLA-B*5701的阳性率为2.71%(18/672)。两者间进行统计学分析,卡方检验结果χ2=12.0006,p=0.0005,p<0.05,在本研究中,西宁及呼和浩特地区的汉族MSM人群中的HLA-B*5701阳性率高于其他7个地区的汉族MSM人群中的阳性率。4.中国9个地区汉族MSM人群的HLA-B*5701阳性率与凉山汉族IDUs人群间进行比较,结果无统计学差异,高于凉山彝族IDUs人群中的HLA-B*5701阳性率。5.将本研究中所采集汉族样本的10个地区按照地理位置分为中国南方与北方,南京、荆州、海口、凉山汉族作为南方地区,西宁、呼和浩特、太原、长春、河北、牡丹江归为北方地区,南方地区汉族人群中HLA-B*5701阳性率为1.73%(9/519),北方地区汉族人群中阳性率为4.78%(25/524),南方地区与北方地区HLA-B*5701阳性率做卡方检验,统计结果为χ2=7.6255,p=0.0058,依据α=0.05的检验水平,南方地区汉族人群中的HLA-B*5701的阳性率低于北方地区汉族人群中的阳性率。如果不考虑西宁及呼和浩特,北方地区只包括太原、长春、河北、牡丹江,其阳性率为3.2%(12/375),则南北方统计学结果为χ2=2.0394,p=0.1533,p>0.05,认为剔除西宁及呼和浩特后,在本研究中,HLA-B*5701的阳性率在南方地区与北方地区的汉族人群中无统计学差异。6.本研究中,利用SSP-PCR法未发现HLA-B*57其他亚型。研究结论：一、我国四川省凉山州彝族人口中的HLA-B*5701的阳性率低于国外在白种人及黑种人中进行研究的阳性率,同时低于本研究中的中国部分地区汉族人群中的HLA-B*5701的阳性率。中国部分地区汉族人群中的HLA-B*5701的阳性率低于国外在白种人中进行研究,与黑种人中的HLA-B*5701阳性率无统计学差异。二、在未进行进一步研究之前,不建议现阶段立即在西宁及呼和浩特的HIV治疗人群中应用阿巴卡韦,如需服用,应该进行HLA-B*5701药前筛查。三、在我国其他地区汉族人口中应用阿巴卡韦药物时,建议在服药前先进行HLA-B*5701筛查。四、在凉山州彝族地区应用该药物时,鉴于该地区人群中较低的HLA-B*5701的阳性率,可以不进行HLA-B*5701药前筛查。

全文目录

英文缩略语  5-6
论文摘要  6-9
ABSTRACT  9-13
前言  13-16
材料与方法  16-27
  1. 实验材料  16-20
  2. 实验技术路线  20
  3. 实验操作  20-27
研究结果  27-34
  一、凉山IDUs HIV感染者中及9地区汉族MSM人群中HLA-B~*5701阳性率  27-29
  二、HLA-B~*5701筛查阳性样本测序结果  29-31
  三、凉山IDUs HIV感染者中及汉族MSM人群中HLA-B~*5701阳性率的统计学分析  31-34
研究讨论  34-38
  一、不同民族(种族)中HLA-B~*5701阳性率差异统计分析  34-35
  二、存在问题及建议  35-38
研究结论  38-39
参考文献  39-43
致谢  43-44
附录  44-67
  附录1 作业指导书  44-51
  附录2 已发表的论文-综述  51-60
    参考文献  57-60
  附录3 已发表的论文-论著  60-67

中国部分地区彝族及汉族人群中HLA-B*5701阳性率的研究

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