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苏云金芽孢杆菌010菌株chi36基因克隆、表达和活性测定
作 者: 谢宇飞
导 师: 黄志鹏
学 校: 福建农林大学
专 业: 农药学
关键词: 苏云金芽孢杆菌 几丁质酶 chi36基因 酶学性质
分类号: S476
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
下 载: 26次
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内容摘要
以苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis, Bt)010菌株总DNA为模板,通过PCR方法扩增几丁质酶chi36基因,将PCR回收产物与pMD18-T载体连接,构建克隆重组菌pMD-chi36,经核苷酸及氨基酸序列分析,chi36基因ORF 1083 bp,编码360个氨基酸,预测其蛋白分子量约为39.0 kDa,等电点为6.52。通过在线软件分析比对表明其核苷酸序列与Bt 15A3、Bc CH、Bc 28-9以及Bc 6E1的几丁质酶基因同源性分别为97%、99%、99%、93%。在线ScanProsite软件分析表明该几丁质酶属于18家族几丁质酶,在线软件推导出其属于一种胞外酶,蛋白质一级结构只含有几丁质酶催化区,缺少粘蛋白Ⅲ型同源区(fibronectin-like domains,FLDs)和几丁质结合区(chitin-binding domain,CBD)。将pMD-chi36与pGEX-KG表达载体连接,构建重组表达载体pGEX-chi36,并成功转入大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)。SDS-PAGE分析表明表达的融合蛋白为65 kDa左右,其中包含26 kDa GST标签。提取pGEX-chi36的粗酶液,研究表明该酶对几丁质平板有降解作用。用DNS方法测定酶的活性,最适作用温度55℃,酶活为488.21 U?mL ,最适pH值5.0,酶活为170.43 U?mL。
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全文目录
摘要 7-8 Abstract 8-9 引言 9-18 1 苏云金芽孢杆菌 9 2 几丁质酶 9-15 2.1 几丁质酶概述 9 2.2 几丁质酶分类 9-10 2.3 几丁质酶来源 10-15 2.3.1 植物几丁质酶 10-11 2.3.2 动物几丁质酶 11-13 2.3.3 微生物几丁质酶 13-15 2.3.3.1 微生物几丁质酶理化性质 13 2.3.3.2 微生物几丁质酶氨基酸序列 13-14 2.3.3.3 微生物几丁质酶应用 14-15 3 Bt chi36 基因分子生物学研究 15-17 4 本研究的目的及意义 17-18 材料与方法 18-30 1 材料 18-20 1.1 菌株 18 1.2 培养基 18 1.3 试剂盒 18 1.4 酶类 18 1.5 其他试剂 18-20 2 方法 20-30 2.1 总DNA 的提取 20 2.2 Bt 几丁质酶基因克隆 20-25 2.2.1 几丁质酶基因引物设计 20-21 2.2.2 PCR 反应体系 21 2.2.3 PCR 循环条件 21 2.2.4 PCR 产物回收 21-22 2.2.5 连接反应 22 2.2.6 大肠杆菌感受态细胞的制备 22 2.2.7 转化和筛选 22-23 2.2.8 提取重组质粒pMD-chi36 23 2.2.9 重组质粒PCR 鉴定 23-24 2.2.10 重组质粒酶切鉴定 24-25 2.2.11 基因片段测序 25 2.3 几丁质酶蛋白的原核表达 25-28 2.3.1 表达菌的构建 25-27 2.3.1.1 质粒的提取 25 2.3.1.2 质粒双酶切 25 2.3.1.3 琼脂糖凝胶中酶切产物回收 25-26 2.3.1.4 酶切回收产物连接 26 2.3.1.5 大肠杆菌感受态的制备 26 2.3.1.6 转化和筛选 26 2.3.1.7 重组质粒DNA 的提取 26 2.3.1.8 重组质粒的PCR 鉴定 26 2.3.1.9 重组质粒的酶切验证 26-27 2.3.2 目的蛋白的诱导表达 27-28 2.3.2.1 IPTG 诱导 27 2.3.2.2 样品的制备 27 2.3.2.3 SDS-PAGE 27-28 2.4 胶体几丁质平板降解 28 2.5 几丁质酶酶活测定 28-30 2.5.1 温度对酶活的影响 28 2.5.2 pH 对酶活的影响 28-30 结果与分析 30-41 1 几丁质酶基因的克隆及序列分析 30-37 1.1 PCR 扩增及重组质粒酶切验证 30-31 1.2 序列分析 31-37 1.2.1 核苷酸序列同源性分析 31-32 1.2.2 氨基酸序列分析 32-35 1.2.3 蛋白质功能区的预测 35 1.2.4 跨膜信号分析 35-37 2 原核表达 37-39 2.1 原核表达菌的构建 37-39 2.2 目的蛋白诱导表达 39 3 胶体几丁质降解 39-40 4 几丁质酶酶活测定 40-41 4.1 温度对酶活的影响 40-41 4.2 pH 对酶活的影响 41 小结与讨论 41-43 1 表达载体的选择 42 2 融合蛋白的纯化 42 3 展望 42-43 参考文献 43-50 致谢 50
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中图分类: > 农业科学 > 植物保护 > 各种防治方法 > 生物防治
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