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犬科及猫科野生动物寄生蛔虫核糖体基因ITS区和线粒体COXⅠ、COXⅡ、ND1、ND4基因序列分析及种系发生研究

作　者: 陈志港
导　师: 杨光友
学　校: 四川农业大学
专　业: 预防兽医学
关键词: 犬科及猫科野生动物蛔虫 ITS基因 ND4基因 COXⅠ基因 COXⅡ基因 ND1基因序列分析系统进化
分类号: Q75
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

犬科和猫科野生动物大都是珍稀保护动物,是我国宝贵的自然资源,保护野生动物是全人类的共同责任。蛔虫是这些动物体内最常见、危害最严重的寄生虫,野生和圈养种群均可感染与发病。因此,搞好这些珍稀野生动物蛔虫病的防治是保护野生动物的一项重要技术措施。开展野生动物蛔虫的分类鉴定是进行蛔虫生物学、流行病学和防治等研究的基础性工作。过去对野生动物蛔虫的分类鉴定主要采用形态与生物学方法,但由于宿主与地理环境等因素所导致的遗传变异,传统的形态与生物学分类研究方法在一些蛔虫近缘种的分类鉴定中的局限性日益明显,并且对于野生动物蛔虫的种群遗传和系统进化关系也尚缺乏系统研究。为此,本研究扩增出了11种犬科和猫科野生动物蛔虫核糖体基因ITS区和线粒体基因COX I、COXⅡ、ND1、ND4并进行了序列分析和种系发生研究,从而为以形态学为基础的传统分类提供分子依据。1. 11种犬科及猫科野生动物蛔虫的核糖体ITS区基因和线粒体ND4基因序列分析及系统进化分析为了探讨寄生于蓝狐、银狐、豹猫、丛林猫、金猫、狼、东北虎、非洲狮、盂加拉虎、华南虎和猞猁体内蛔虫的分类地位和种群遗传变异,在形态鉴定的基础上,本实验采用PCR技术扩增了11种犬科及猫科野生动物的寄生蛔虫的核糖体rDNA的ITS基因全序列和线粒体DNA的ND4基因的部分序列,并分别与GenBank中已登录的相关基因序列进行了比对分析。结果显示：犬弓首蛔虫在不同宿主间的种内有一定差异(1.5%-2.5%),变异很小；猫弓首蛔虫在不同宿主间的种内差异较大(8.0%-12.5%)；狮弓蛔虫在犬科动物群体变异很小(0-0.5%),在猫科动物群体较小(0-3.5%),但在犬科动物和猫科动物这两种动物群体间的狮弓蛔虫的种内差异稍大(9.5%-10.3%)。犬弓首蛔虫、猫弓首蛔虫和狮弓蛔虫的种间差异(13.6%-36.8%)明显高于其种内差异(0-12.5%)。构建的进化树显示：采自蓝狐和银狐体内的犬弓首蛔虫与犬体内寄生的犬弓首蛔虫首先聚类形成犬弓首蛔虫分支；采自豹猫、丛林猫和金猫体内的猫弓首蛔虫与猫体内寄生的猫弓首蛔虫聚类,构成猫弓首蛔虫分支；犬弓首蛔虫和猫弓首蛔虫共同构成弓首属蛔虫的独立支系。采自狼体内的狮弓蛔虫与犬体内寄生的狮弓蛔虫首先聚类,采自东北虎、非洲狮、孟加拉虎、华南虎和猞猁体内的狮弓蛔虫聚类,然后共同形成狮弓蛔虫独立支系。2. 11种犬科及猫科野生动物蛔虫的线粒体COXⅠ、COXⅡ和ND1基因序列分析及系统进化分析为了探讨寄生于蓝狐、银狐、豹猫、丛林猫、金猫、狼、东北虎、非洲狮、孟加拉虎、华南虎和猞猁体内蛔虫的分类地位和种群遗传变异,在形态鉴定的基础上,本实验采用PCR技术扩增了11种犬科及猫科野生动物的寄生蛔虫的线粒体中3个基因COXⅠ、COXⅡ和ND1的基因序列,并分别与GenBank中已登录的相关基因序列进行比对分析。分析结果显示：扩增的COXⅠ基因序列均为393bp, COXⅡ基因序列均为582bp,ND1的基因序列均为366bp。序列分析显示采自不同宿主的犬弓首蛔虫种内差异很小(0-3.0%)；采自不同宿主的猫弓首蛔虫的种内差异较大(6.5%-11.5%)；狮弓蛔虫在犬科动物群体和猫科动物群体之间的变异稍大(5.1%-8.2%),但在犬科动物群体内和猫科动物群体内的种内差异都较小(0-3.0%)；犬弓首蛔虫、猫弓首蛔虫和狮弓蛔虫的种间差异(11.9%-24.9%)明显高于其种内差异(0-11.5%)。构建的进化树显示：采自蓝狐和银狐体内的犬弓首蛔虫与犬体内寄生的犬弓首蛔虫首先聚类形成犬弓首蛔虫分支；采自豹猫、丛林猫和金猫体内的猫弓首蛔虫与猫体内寄生的猫弓首蛔虫聚类,构成猫弓首蛔虫分支；犬弓首蛔虫和猫弓首蛔虫共同构成弓首属蛔虫的独立支系。采自狼体内的狮弓蛔虫与犬体内寄生的狮弓蛔虫首先聚类,采自东北虎、非洲狮、孟加拉虎、华南虎和猞猁体内的狮弓蛔虫聚类,然后共同形成狮弓蛔虫独立支系。

全文目录

摘要  4-6
英文摘要  6-11
第一部分文献综述  11-22
  一、犬科及猫科动物寄生蛔虫研究进展  11-15
    1 犬科和猫科动物寄生蛔虫的分类学地位  11-12
    2 流行病学调查  12-13
    3 弓首蛔虫的生物学特性  13-14
    4 弓首蛔虫及狮弓蛔虫的形态学特征  14
    5 致病作用和症状  14-15
    6 蛔虫病的防治  15
  二、分子系统进化研究方法及常用的遗传标记基因  15-21
    1 分子系统进化的研究方法  15-16
    2 分子系统进化常用的遗传标记基因  16-21
  三、本研究的目的和意义  21-22
第二部分研究内容  22-53
  第一章犬科及猫科野生动物寄生蛔虫核糖体基因ITS区和线粒体基因ND4的序列分析及系统进化分析  22-36
    1 材料与方法  23-26
    2 结果  26-32
    3 讨论  32-34
    4 小结  34-36
  第二章犬科及猫科野生动物寄生蛔虫线粒体基因COXⅠ、COXⅡ、ND1的序列分析及系统发生研究  36-53
    1 材料与方法  37-41
    2 结果  41-49
    3 讨论  49-51
    4 小结  51-53
第三部分结论与创新点  53-55
  3.1 结论  53-54
  3.2 创新点  54-55
参考文献  55-61
致谢  61

犬科及猫科野生动物寄生蛔虫核糖体基因ITS区和线粒体COXⅠ、COXⅡ、ND1、ND4基因序列分析及种系发生研究

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