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塔玛亚历山大藻的遗传多样性及分子系统进化研究

作　者: 叶吉龙
导　师: 刘洁生
学　校: 暨南大学
专　业: 动物学
关键词: 塔玛亚历山大藻核糖体序列微卫星标记遗传多样性系统进化
分类号: Q943
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要

塔玛亚历山大藻(Alexandrium tamarense)是一种分布广泛且能产生麻痹性贝毒(Paralytic Shellfish Poisoning, PSP)的赤潮甲藻,是我国沿岸海域有毒有害赤潮藻的典型代表。本研究选取不同海域采集的塔玛亚历山大藻,对其种内遗传多样性进行分析,以了解不同种群之间的遗传结构,确定其种内的遗传变异程度。研究首先采用核糖体标记方法,分析了11株塔玛亚历山大藻5.8S rDNA及转录内间隔区(ITS)、LSU rDNAD1-D2区两组序列信息,结果显示：(1)CCMP116序列与相关亚历山大藻同源性更高,应将其鉴定为相关亚历山大藻；(2)其余10个藻株之间的遗传差异很小；(3)所研究的10株塔玛亚历山大藻至少可分为3个遗传型,即西欧型、温带亚洲型、热带亚洲型,中国沿海的6株藻属于热带亚洲型。之后,我们借助灵敏度更高的微卫星标记技术对10株塔玛亚历山大藻进行了遗传多样性分析,并探讨不同地理藻株之间的遗传分化程度和基因流水平。结果表明：(1)10株塔玛亚历山大藻共检测出37个等位基因,12个微卫星标记中有11个位点具有多态性,多态位点比率达91.67%。11个多态性位点的有效等位基因数为1～5.3333,平均2.5798。塔玛亚历山大藻种内基因多样性为0.2778～0.8125,平均为0.5125；(2)所研究塔玛亚历山大藻大致可以分为4个进化枝。进化枝与藻株的地理位置相关联。不同地理分布的塔玛亚历山大藻的遗传分化水平较高,达0.6056；(3)种群间的基因流估算水平较低,3个种群之间可能不存在基因交流。不同地理分布的塔玛亚历山大藻的遗传分化水平较高,可能是不同地理种群长时间的独自进化,和它们之间缺乏基因流导致的。研究表明,在塔玛亚历山大藻种内遗传多样性的研究上,微卫星标记技术更为有力,能够反应出塔玛亚历山大藻种内的遗传差异；中国沿海的塔玛亚历山大藻并非是单一的进化系,可能存在至少3个进化支。

全文目录

摘要  4-5
Abstract  5-7
1 前言  7-25
  1.1 赤潮及其成因、危害  7-9
  1.2 赤潮生物遗传多样性及分子系统进化的研究  9-12
  1.3 赤潮生物分子生态学的常用研究方法  12-20
  1.4 塔玛亚历山大藻赤潮  20-23
  1.5 本研究的目的及意义  23-24
  1.6 本研究的创新点  24-25
2 不同海域塔玛亚历山大藻rDNA的部分序列分析  25-48
  2.1 材料与方法  25-31
  2.2 结果与分析  31-44
  2.3 讨论  44-47
  2.4 小结  47-48
3 不同海域的塔玛亚历山大藻遗传多样性的微卫星分析  48-62
  3.1 材料与方法  48-52
  3.2 结果与分析  52-58
  3.3 讨论  58-61
  3.4 小结  61-62
4 结论  62-63
参考文献  63-69
附录1.rDNA部分序列测序图谱和拼接序列  69-102
附录2.毛细管电泳检查图谱  102-122
致谢  122

塔玛亚历山大藻的遗传多样性及分子系统进化研究

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