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3-羟基丁酸乙酯及3-(2,2,2-三氟乙酰氧基)丁酸乙酯和PMBCD手性拆分机理的理论研究
作 者: 胡樱
导 师: 施介华
学 校: 浙江工业大学
专 业: 药物分析
关键词: 全甲基-β-环糊精 3-羟基丁酸乙酯 3-(2,2,2-三氟乙酰氧基)丁酸乙酯 手性识别 PM3 ONIOM NBO
分类号: O621.25
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
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内容摘要
本论文应用分子模拟方法研究环糊精主-客体的手性识别机理,即采用半经验PM3方法、ONIOM方法和NBO分析,从分子水平上阐明手性识别机理和主-客体相互作用力等。采用半经验PM3方法,模拟研究了全甲基-β-环糊精(PMBCD)与3-羟基丁酸乙酯((R/S)-EHB)的手性识别过程。接着用双层的ONIOM方法对PM3方法所得的最低能量结构((R/S)-EHB/PMBCD)进行更精确的计算,其中PMBCD在PM3水平优化,而EHB在B3LYP/6-31g(d)水平优化。结果表明,(R/S)-EHB对映体与PMBCD形成稳定结合物的结合方式完全不同,(S)-EHB位于PMBCD的大端口形成缔合物,(R)-EHB的酯基插入PMBCD的空腔形成包结物,可知(R)-EHB与PMBCD之间的疏水作用要强于(S)-EHB与PMBCD,且(R)-EHB与PMBCD结合稳定能比((S)-EHB与PMBCD的结合稳定能低。在(R/S)-EHB/PMBCD结合物中,(R/S)-EHB中的手性碳接近葡萄糖单元C(2)和C(3),葡萄糖中的C(2),C(3)为主客体的识别提供手性环境。自然键轨道分析(NBO)的研究表明,在结合过程中,弱的氢键作用和电荷转移对主客体之间的手性识别起到重要的作用。采用PM3方法模拟研究了全甲基-p-环糊精(PMBCD)和3-(2,2,2-三氟乙酰氧基)丁酸乙酯主客体相互作用,结果表明,(R/S)-ETB均插入PMBCD的空腔形成包结物,但最稳定包结物的结构有很大的差异,(S)-ETB与PMBCD结合稳定能比((R)-ETB与PMBCD的结合稳定能低。在(R/S)-ETB/PMBCD结合物中,(R/S)-ETB的手性碳接近葡萄糖单元的C(2)和C(3)。用NBO分析得到,(S)-ETB/PMBCD的氢键及超共轭作用要强于(R)-ETB/PMBCD。则ETB与PMBCD之间的手性识别与葡萄糖单元的C(2)和C(3)所提供的手性环境和ETB和PMBCD结合形成的氢键及超共轭作用相关。
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全文目录
摘要 4-6 ABSTRACT 6-11 前言 11-12 第一章 绪论 12-26 1.1 环糊精的概述 12-17 1.1.1 环糊精的结构和性质 12-14 1.1.2 环糊精与客体分子的包结机理 14-15 1.1.3 环糊精包结作用的应用 15-17 1.2 分子模拟技术在环糊精化学中的应用 17-21 1.2.1 量子化学计算方法 18-19 1.2.2 分子力学计算方法 19 1.2.3 分子动力学计算方法 19 1.2.4 量子力学和分子力学的组合方法 19-20 1.2.5 自然键轨道分析 20-21 1.3 分子模拟在环糊精包结物方面的应用 21-24 1.3.1 包结物结合能的计算 21-22 1.3.2 主-客体分子识别的研究 22-24 1.5 本论文研究的主要内容及意义 24-26 1.5.1 本课题的研究意义 24-25 1.5.2 本课题的主要研究对象 25 1.5.3 本课题的主要研究方法 25-26 第二章 3-羟基丁酸乙酯和全甲基-β-环糊精包结过程的理论研究 26-40 2.1 前言 26-27 2.2 计算方法 27-29 2.3 结果与讨论 29-38 2.3.1 模拟EHB和PMBCD的结合过程 29-33 2.3.2 包结物的结构参数 33-35 2.3.4 NBO分析 35-38 2.4 本章小结 38-40 第三章 3-(2,2,2-三氟乙酰氧基)丁酸乙酯和全甲基-β-环糊精包结过程的理论研究 40-52 3.1 计算方法 40-41 3.2 结果与讨论 41-51 3.2.1 模拟ETB和PMBCD的结合过程 41-45 3.2.2 结合物的结构参数 45-47 3.2.3 NBO分析 47-51 3.3 本章小结 51-52 第四章 3-(2,2,2-三氟乙酰氧基)丁酸乙酯和3-羟基丁酸乙酯模拟结果的比较 52-58 4.1 生成热和结合能的比较 52 4.2 最稳定化合物构型的比较 52-53 4.3 PMBCD的结构参数 53-54 4.4 手性识别环境的比较 54-55 4.5 形成氢键的比较 55-56 4.6 本章小结 56-58 第五章 结论与展望 58-60 5.1 结论 58-59 5.2 展望 59-60 参考文献 60-69 致谢 69
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中图分类: > 数理科学和化学 > 化学 > 有机化学 > 有机化学一般性问题 > 有机化合物性质 > 化学性质、有机化学反应
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