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水稻黄单胞菌致病性效应分子的基因克隆与功能研究
作 者: 武晓敏
导 师: 陈功友
学 校: 南京农业大学
专 业: 植物病理学
关键词: 水稻 水稻白叶枯病菌 水稻细菌性条斑病菌 致病性 无毒性 克隆
分类号: S435.111
类 型: 硕士论文
年 份: 2006年
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内容摘要
稻黄单胞菌种下的水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)和水稻细菌性条斑病菌(X.oryzae pv.oryzicola,Xooc),分别引起水稻白叶枯病和水稻条斑病,在生产上造成较大危害。水稻黄单胞菌—水稻互作系统是研究植物—病原物互作的理想模式系统。白叶枯病菌与水稻互作符合基因对基因关系,但基因-基因互作特异性的本质并不十分不明确。本研究以avrBs3基因家族中高度保守的酸性转录激活域的359 bp EcoRI-BamHI DNA片断为探针,扫描日本系统Ⅲ小种JXOⅢ和菲律宾系统6号小种PXO99~A菌株基因组,发现JXOⅢ菌株特有5.0 kb和1.8 kb的avrBs3/PthA家族基因。菌落原位杂交JXOⅢ菌株的基因文库,经限制性酶切分析和Southern杂交归类,获得了共含有17个avrBs3/PthA家族基因的7个克隆,众多avrBs3/PthA基因在基因组中单独存在,或者2个和2个以上串联排列。将获得的阳性克隆导入PXO99~A菌株中,成株期致病性测定结果显示,JXOⅢ菌株中可能存在与Xa2、Xa3、xa5、xa8等匹配的avr基因,p54克隆中含有1.8 kb的avrBs3/PthA基因,在IBBB3水稻品种上显示为无毒性。比对avrBs3家族无毒基因重复单元中的12-13位氨基酸残基,初步揭示Xoo基因组中avr/pth基因的重组特征。本研究还提示,作为水稻近等基因系轮回亲本的IR24,可能存在多个R基因。avrBs3/PthA家族基因的获得以及与水稻互作的对应关系为加快水稻抗白叶枯病R基因克隆提供了科学线索。水稻黄单胞菌的avrBs2、pga和popC基因的启动子区域存在PIP-box,推测其表达受HrpX调控,然而其在致病性中的作用还不清楚。本研究根据植物病原黄单胞菌中报道的相应基因序列设计兼并引物,PCR方法从水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae, Xoo)和水稻条斑病菌(X.oryzae pv.oryzicola, Xooc)基因组中分别克隆了avrBs2、pga和popC基因。序列比较发现,从Xoo中克隆的该3个基因与已知基因组测序的菌株中的基因相同。从Xooc中克隆该3个基因尚属首次。蛋白质水平上比较发现,水稻黄单胞菌中的该3个蛋白与其它黄单胞菌中的相应蛋白具有74%—98%的同源性。依据同源交换原理,本研究分别对水稻黄单胞菌的该3个基因进行了突变。水稻苗期water soaking、成株期致病性和非寄主烟草过敏反应测定发现,avrBs2、pga和popC突变体与野生菌一样,并不改变在水稻上的water soaking症状和在烟草上激发过敏反应。有意义的是,Xooc的pga突变体在水稻中的繁殖能力和致病性得到了加强。这提示,编码多聚半乳糖醛酸酶的pga基因可能是致病性的抑制因子。
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全文目录
中文摘要 6-8 英文摘要 8-10 文献综述 10-29 第一章 水稻白叶枯病菌avrBs3/pthA家族基因研究进展 10-29 1.无毒基因产物是一类三型泌出通道分泌的致病性效应分子 11-12 2.avrBs3/pthA家族基因 12-18 3.AvrBs3家族基因重组变异 18-20 4.AvrBs3蛋白形成二聚体 20-22 5.avrBs3/pthA家族基因与抗病基因作用的模式 22-23 6.展望 23-25 参考文献 25-29 研究报告 29-78 第一章 水稻白叶枯病菌日本系统JXOⅢ菌株avrBs3/PthA家族基因的克隆 29-50 摘要 29-30 第一节 白叶枯病菌PX099~A和JXOⅢ菌株中avrBs3/PthA家族基因数量比较 30-34 1 材料与方法 30-33 2 结果与分析 33-34 第二节 白叶枯病菌JXOⅢ菌株avrBs3/PthA家族基因无毒性测定 34-40 1 材料与方法 34-36 2 结果与分析 36-40 第三节 白叶枯病菌JXOⅢ菌株avrBs3家族基因的鉴别 40-47 1 材料与方法 40-41 2 结果与分析 41-44 3 结论与讨论 44-47 参考文献 47-50 第二章 水稻黄单胞菌avrBs2、pga和popC基因的克隆和功能分析 50-78 摘要 50-52 第一节 avrBs2、pga和popC基因的克隆和序列分析 52-62 1 材料与方法 52-56 2 结果与分析 56-62 第二节 avrBs2、pga和popC基因突变体的构建 62-69 1 材料与方法 62-66 2 结果分析 66-69 第三节 水稻黄单胞菌avrBs2、pga和popC基因的致病性作用 69-75 1 材料与方法 69-70 2 结果与分析 70-73 3.讨论与讨论 73-75 参考文献 75-78 全文结论 78-79 发表的论文目录 79-80 附录 80-88 致谢 88
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中图分类: > 农业科学 > 植物保护 > 病虫害及其防治 > 农作物病虫害及其防治 > 禾谷类作物病虫害 > 稻病虫害 > 病害
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