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大针茅质膜水通道蛋白基因（SgPIPs）全长cDNA序列的克隆及序列分析

作　者: 于涛
导　师: 韩冰
学　校: 内蒙古农业大学
专　业: 生物化学与分子生物学
关键词: 大针茅 水通道蛋白 cDNA 3′RACE 5′RACE
分类号: Q943.2
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
下　载: 42次
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内容摘要


水通道蛋白不但为水分跨细胞膜的运输提供了一条选择性通道,而且水通道蛋白在植物种子萌发、细胞伸长、气孔运动、受精及植物逆境应答中起重要作用。研究以亚洲中部特有的典型草原种大针茅(Stipa grandis P.Smirn)为材料,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和快速分离cDNA末端技术(RACE),克隆得到大针茅的质膜水通道蛋白基因(SgPIPs)的全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析。主要结果如下:共获得SgPIPs的9个中间片段cDNA序列,22个3′端cDNA序列,9个5′端cDNA序列。克隆到3个SgPIPs的cDNA全长序列,分别为SgPIP1-1、SgPIP1-2和SgPIP1-3。SgPIP1-1全长cDNA序列为991bp,包含15bp的5′非翻译区,870bp的开放阅读框,106bp的3′非翻译区,编码289个氨基酸。SgPIP1-2全长cDNA序列为1248bp,包含15bp的5′非翻译区,870bp的开放阅读框,363bp的完整3′非翻译区,编码289个氨基酸;SgPIP1-3全长cDNA序列为1068bp,包含58bp的5′非翻译区,867bp的开放阅读框,143bp的完整3′非翻译区,编码288个氨基酸。SgPIP1-1、SgPIP1-2、SgPIP1-3推导氨基酸序列表明:它们不但具有MIP家族的信号序列SGXHXNPAVT,而且具有质膜水通道蛋白的特征信号序列GGGANXXXXGY和TGI/TNPARSI/FGAAI/VI/VF/YN。同时具有水通道蛋白典型的6个跨膜区和两个NPA盒单元。SgPIP1-1、SgPIP1-2、SgPIP1-3的核苷酸序列和禾本科物种构建的系统进化树表明:SgPIP1-1和SgPIP1-3进化关系最近,之后与玉米、甘蔗、水稻聚为一类。SgPIP1-2与大麦、小麦的进化关系最近。SgPIP1-1、SgPIP1-2、SgPIP1-3推导的氨基酸序列和大麦PIPs基因家族的PIP1和PIP2构建系统进化树,结果表明:SgPIP1-1、SgPIP1-2、SgPIP1-3均为PIP1类基因亚家族成员。

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中图分类: > 生物科学 > 植物学 > 植物细胞遗传学 > 植物基因工程
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