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大豆细胞质雄性不育系与保持系基因差异表达的cDNA-AFLP分析及atp6基因RNA编辑研究
作 者: 韩利涛
导 师: 杨守萍
学 校: 南京农业大学
专 业: 遗传学
关键词: 大豆 细胞质雄性不育 差异表达 cDNA-AFLP RNA编辑
分类号: S565.1
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
下 载: 8次
引 用: 2次
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内容摘要
细胞质雄性不育在作物杂种优势利用中起重要作用,研究其遗传基础和机制具有重要的理论和实践意义。本文以大豆细胞质雄性不育系NJCMS1A、NJCMS2A及其保持系NJCMS1B、NJCMS2B为材料,开展大豆细胞质雄性不育相关基因差异表达的cDNA-AFLP分析及atp6基因RNA编辑研究,获得如下结果:1.参考多个物种中cDNA-AFLP实验方法,并对具体过程进行改进和优化,建立了大豆cDNA-AFLP差异显示技术体系。从聚丙烯酰胺凝胶电泳结果可以看出,本实验所得到的条带清晰、丰富,结果理想,说明经过改进和优化的cDNA-AFLP差异显示技术完全可以应用于大豆研究。2.采用cDNA-AFLP差异显示技术对大豆细胞质雄性不育系NJCMS1A、NJCMS2A及其保持系NJCMS1B、NJCMS2B的基因差异表达进行研究,分离得到一个差异表达片段2A-2,RT-PCR结果表明2A-2在NJCMS2A花蕾中高表达,对2A-2片段进行同源性比对分析,发现2A-2与MADS-box基因保守区有很高的同源性,进一步对2A-2氨基酸序列进行同源性比对分析、结构功能预测,证实2A-2编码的蛋白是一个MADS-box基因转录因子,可能与大豆细胞质雄性不育有关。3.以大豆细胞质雄性不育系NJCMS1A及其保持系NJCMS1B为材料,对大豆线粒体功能基因atp6基因的RNA编辑进行研究,结果发现大豆atp6-3基因保守区的RNA编辑位点较少,mtDNA序列分析表明atp6-3基因保守区在NJCMS1A与NJCMS1B间存在一个碱基的差异,另外还发现atp6-1、atp6-2和atp6-3的表达在NJCMS1A与NJCMS1B间存在明显差异,至于atp6基因与大豆细胞质雄性不育之间的关系尚需要进一步研究。
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全文目录
摘要 6-7ABSTRACT 7-8缩略词表 8-9第一部分 9-28 文献综述 10-28 1 植物雄性不育 10-13 1.1 植物雄性不育概述 10-11 1.2 植物雄性不育类型 11-13 2 大豆雄性不育研究 13-16 2.1 大豆细胞质雄性不育 13-14 2.2 大豆核雄性不育 14-15 2.3 大豆雄性不育的利用 15-16 3 细胞质雄性不育败育机制 16-19 3.1 线粒体嵌合基因与CMS 16 3.2 RNA编辑与CMS 16-19 4 雄性不育相关基因的克隆 19-26 4.1 功能克隆 20 4.2 转座子标签法 20-21 4.3 定位克隆技术 21 4.4 同源序列克隆方法 21-22 4.5 mRNA差异显示技术 22 4.6 cDNA-AFLP技术 22-26 5 本研究的目的和意义 26-28第二部分 28-64 第一章 大豆细胞质雄性不育系与保持系花发育期基因差异表达的cDNA-AFLP分析 29-52 1 材料和方法 29-39 1.1 实验材料 29-30 1.2 实验方法 30-39 2 结果与分析 39-49 2.1 总RNA的提取与检测 39 2.2 总RNA的DNaseI消化 39-40 2.3 cDNA-AFLP多态性分析 40-43 2.4 差异片段的回收与克隆 43-44 2.5 差异片段的测序和比对 44-46 2.6 差异片段的序列分析 46-47 2.7 RT验证 47-48 2.8 2A-2的功能分析 48-49 3 讨论 49-52 3.1 提高RNA质量的措施 49 3.2 cDNA混合池的构建 49-50 3.3 cDNA-AFLP差异显示方法的有效性和改进 50 3.4 MADS-box基因片段2A-2与大豆雄性不育 50-52 第二章 大豆细胞质雄性不育系与保持系atp6基因的RNA编辑研究 52-64 1 材料和方法 52-55 1.1 实验材料 52 1.2 实验方法 52-55 2 结果与分析 55-62 2.1 mtDNA的质量检测 55 2.2 atp6基因扩增 55-56 2.3 片段回收、转化、克隆 56-57 2.4 atp6-3基因RNA编辑 57-62 3 讨论 62-64 3.1 大豆mtDNA的提取 62 3.2 atp6基因RNA编辑与大豆雄性不育 62-63 3.3 ap6基因与大豆雄性不育 63-64全文结论 64-65参考文献 65-72致谢 72
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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 经济作物 > 油料作物 > 大豆
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