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细胞抗病毒天然免疫信号转导的调控机制
作 者: 李颖
导 师: 舒红兵
学 校: 武汉大学
专 业: 细胞生物学
关键词: 干扰素 信号转导 核酸识别 LSM14A ISG56 MITA 负反馈调节
分类号: R392.1
类 型: 博士论文
年 份: 2011年
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内容摘要
长期以来,病毒感染诱导Ⅰ型干扰素表达的过程一直是细胞抗病毒天然免疫研究的热点。宿主细胞通过自身的模式识别受体(pattern recognition receptors, PRRs)识别病原微生物的病原相关分子模式(pathogen-associated molecular patterns, PAMPs),从而启动下游信号级联反应,诱导Ⅰ型干扰素(typeⅠinterferons)、促炎症细胞因子(proinflammatory cytokines)和趋化因子等的产生。在病毒感染宿主细胞的过程中,病毒的核酸可以被Toll样受体(Toll-likereceptors, TLRs)(如TLR3、7和9)、RIG-I样受体(RIG-I like receptors, RLRs)(如RIG-I和MDA5)和近年来发现的DNA受体(如DAI和IFI16)识别。其中RIG-I和MDA5识别病毒RNA后,招募其下游接头蛋白VISA(也叫MAVS、IPS-1和Cardif),一方面通过招募TRAF2/6活化IKK激酶复合物,激活转录因子NF-κB;另一方面通过招募TRAF3和TBK1,促进IRF3的磷酸化激活。活化的转录因子NF-κB和IRF3进入细胞核后,协同促进Ⅰ型干扰素基因的表达。MITA(也叫STING)是近年来发现的RLRs介导的抗病毒信号转导中另一个重要的接头蛋白,它通过与VISA相互作用,病毒感染后招募TBK1,通过自身寡聚化形成VISA-MITA-TBK1-IRF3复合物,促进TBK1对IRF3的磷酸化激活,从而介导Ⅰ型干扰素的表达。细胞抗病毒天然免疫中,宿主细胞对病毒感染的识别一直是研究的热点问题。尽管近十几年来的研究发现了许多PRRs,揭示了天然免疫中宿主对病原微生物的识别机制,但许多问题仍然需要进一步的研究。为了寻找参与病毒诱导的Ⅰ型干扰素信号转导的未知信号分子,我们以pGL3-ISRE为报告基因,进行了基因筛选。我们的研究发现,LSM14A能有效激活ISRE和IFN-p启动子,并显著协同仙台病毒(Sendai virus,SeV)和单纯疱疹病毒(herpes simplex virus type, HSV)感染诱导的Ⅰ型干扰素的表达。下调内源性LSM14A的表达显著抑制SeV感染早期诱导的Ⅰ型干扰素表达,同时,也抑制胞质dsRNA和dsDNA诱导的IFN-p启动子的激活。水疱性口炎病毒(vesicular stomatitis virus,VSV)空斑实验和新城疫病毒(Newcastle Disease virus, NDV)复制水平检测实验表明,LSM14A有效抑制病毒在细胞内的复制。此外,我们还发现LSM14A可以直接结合病毒RNA和DNA,作为一种新型胞质病毒核酸受体,通过与RIG-I或VISA相互作用,介导病毒感染诱导的Ⅰ型干扰素的表达。为了进一步研究MITA在RLRs介导的抗病毒信号转导中的调控机制,我们进行了Flag-亲和层析实验,通过质谱分析鉴定得到了MITA相互作用蛋白ISG56。ISG56是最早被鉴定出可被病毒和Ⅰ型干扰素诱导表达的蛋白之一。我们的研究发现,过量表达ISG56抑制SeV感染诱导的IRF3、NF-κB和IFN-p启动子的激活;下调内源性ISG56的表达则得到相反的结果。同样的,过量表达ISG56抑制poly(I:C)诱导的抗病毒反应,促进VSV的复制;而下调内源性ISG56的表达则抑制VSV的复制。竞争性免疫共沉淀实验表明,ISG56通过与MITA结合,阻断MITA与其上游分子VISA和下游分子TBK1的相互作用。我们的研究表明,ISG56负反馈调控病毒感染诱导的Ⅰ型干扰素表达和细胞抗病毒反应。我们的研究发现,LSM14A可能作为一种新型病毒核酸受体,参与病毒感染诱导的Ⅰ型干扰素表达的信号转导,这将为细胞抗病毒天然免疫提供一种新的病原分子识别机制。此外,我们还发现了ISG56作为Ⅰ型干扰素诱导蛋白,负反馈调节病毒感染诱导Ⅰ型干扰素的表达,此项研究揭示了一种新的抗病毒天然免疫信号转导负反馈调控机制。
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全文目录
摘要 5-7 Abstract 7-12 第一章 研究背景 12-42 第一节 天然免疫对病原微生物的识别 12-24 一、天然免疫概述 12-13 二、天然免疫的模式识别受体 13-24 第二节 抗病毒天然免疫的信号转导及其调控机制 24-36 一、抗病毒天然免疫信号转导概述 24-25 二、Ⅰ型干扰素基因转录调控机制 25-27 三、模式识别受体介导的天然免疫信号转导 27-33 四、模式识别受体介导的信号转导中的调控机制 33-36 第三节 病毒诱导Ⅰ型干扰素表达的早、晚期事件和干扰素效应因子 36-42 一、病毒诱导Ⅰ型干扰素基因表达的早、晚期事件 36-39 二、干扰素诱导的效应因子 39-42 第二章 实验材料和实验方法 42-53 第一节 实验材料 42-44 一、细胞系、细胞培养和细胞因子 42 二、病毒 42 三、抗体 42-43 四、表达载体 43 五、核酸操作及检测试剂盒 43 六、其它试剂 43-44 七、耗材 44 八、特殊仪器和设备 44 第二节 实验方法 44-53 一、表达载体构建和质粒纯化 44-45 二、细胞培养和瞬时转染 45-46 三、原代细胞的分离培养和转染 46-47 四、荧光素酶报告基因实验 47 五、蛋白复合物的纯化和质谱鉴定 47-48 六、免疫共沉淀和Western Blot检测 48-49 七、非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 49 八、RT-PCR 49-50 九、VSV空斑实验 50 十、体外结合核酸实验 50-51 十一、通过逆转录病毒载体构建稳定表达细胞系 51 十二、细胞核质分离和亚细胞器分离 51-52 十三、免疫荧光和激光共聚焦显微镜观察 52-53 第三章 实验结果和讨论一:新型核酸受体LSM14A的鉴定及其功能研究 53-87 第一节 研究背景与立项依据概述 53-54 第二节 实验结果 54-84 一、基因库筛选 54-56 二、过量表达LSM14A激活ISRE、NF-κB和IFN-β启动子 56-59 三、下调内源性LSM14A表达抑制病毒感染诱导的Ⅰ型干扰素表达 59-67 四、LSM14A参与细胞抗病毒反应 67-68 五、LSM14A参与SeV感染早期Ⅰ型干扰素的表达 68-71 六、人肠癌HCT116细胞LSM14A-Flag-Knock-in细胞系的构建 71-72 七、LSM14A定位于细胞质 72-73 八、LSM14A结合poly(I:C)和poly(dA:dT) 73-75 九、LSM14A与RIG-I、VISA相互作用 75-78 十、LSM14A介导Ⅰ型干扰素表达需要RIG-I的参与 78-80 十一、LSM14A、RIG-I、VISA与P-bodies的共定位 80-84 第三节 小结和讨论 84-87 第四章 实验结果和讨论二:1SG56负反馈调节病毒诱导的Ⅰ型干扰素表达 87-107 第一节 研究背景与立项依据概述 87-88 第二节 实验结果 88-104 一、ISG56和ISG54是MITA相互作用蛋白 88-91 二、过量表达ISG56抑制病毒诱导的ISRE和IFN-β的激活 91-96 三、内源性ISG56的表达下调促进病毒感染诱导的IFN-β激活 96-100 四、ISG56负调控细胞抗病毒反应 100-101 五、1SG56阻断MITA-VISA和MITA-TBK1的相互作用 101-104 第三节 小结和讨论 104-107 第五章 研究总结和展望 107-109 参考文献 109-120 缩略词表 120-122 作者简历 122-124 致谢 124-125
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中图分类: > 医药、卫生 > 基础医学 > 医学免疫学 > 免疫生物学
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