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两种双生病毒伴随的卫星启动子的鉴定
作 者: 张馨月
导 师: 周雪平;钱亚娟
学 校: 浙江大学
专 业: 植物病理
关键词: 赛葵黄脉病毒 中国番茄黄化曲叶病毒 βC1基因 启动子
分类号: Q939.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
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内容摘要
DNAβ是与某些单组份双生病毒相伴随的卫星分子,能在自然寄主上引起典型侵染症状。迄今发现的所有DNAβ分子在互补链上都编码一个大小和位置保守的βCl基因,它是一种致病决定因子。关于βCl基因启动子的研究,目前的研究报道还很少。赛葵黄脉病毒(MYVV)和中国番茄黄化曲叶病毒(TYLCCNV)均是本实验室鉴定的伴随有DNAβ分子的单组份双生病毒,为了进一步明确它们伴随的卫星DNA启动子对病毒症状的调节作用,本论文分离并鉴定了TYLCCNV Y25分离物(TYLCCNV-Y25)和MYVV Y47分离物(MYVV-Y47)DNAβ分子上βCl基因的启动子。利用根癌土壤杆菌介导的方法鉴定了MYVV-Y47 DNAβ分子上βCl基因的启动子。用GUS和GFP基因做为报告基因,通过组织化学法和荧光光度法测定启动子的活性。瞬时表达结果表明,MYVV-Y47βCl基因翻译起始位点上游的991核苷酸(nt)片段具有启动子活性;5’端缺失的片段以及A-rich区缺失的片段均保留了启动子活性;与花椰菜花叶病毒(CaMV)35S启动子相比,991 nt片段的启动子活性最高,是35S启动子活性的28.05%。对启动子进行遗传转化后进行组织化学检测表明,翻译起始位点上游的991 nt和214 nt片段均能够驱动GUS基因在转基因普通烟植株中组成型表达。利用根癌土壤杆菌介导的方法鉴定了TYLCCNV-Y25 DNAβ分子上βCl基因的启动子。用GUS基因做为报告基因,通过组织化学法和荧光光度法测定启动子的活性。瞬时表达结果表明,TYLCCNV-Y25βCl基因翻译起始位点上游的982 nt片段具有启动子活性,其活性是CaMV 35S启动子活性的46.23%。5’端以及A-rich区都缺失的206 nt片段保留有启动子活性并且其活性与982 nt片段的启动子活性没有显著性差异。
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全文目录
致谢 5-6 摘要 6-7 Abstract 7-8 目录 8-10 1.文献综述 10-31 1.1 高等植物启动子的研究进展 10-19 1.1.1 启动子的基本结构 10-12 1.1.2 植物启动子的分类 12-19 1.2 启动子的研究方法 19-24 1.2.1 启动子的分离克隆和活性检测 19-22 1.2.2 启动子数据库资源和电子预测 22-24 1.3 双生病毒启动子研究进展 24-31 1.3.1 双生病毒的分类及基因组结构 24-27 1.3.2 双生病毒启动子调控 27-31 2.赛葵黄脉病毒Y47分离物伴随的卫星启动子活性检测 31-60 2.1 材料与方法 31-46 2.1.1 病毒毒源和供试植物 31 2.1.2 菌株和质粒 31-32 2.1.3 试剂与仪器 32 2.1.4 PCR技术 32-33 2.1.5 DNA克隆技术 33-35 2.1.6 电击法 35-36 2.1.7 植物总DNA的制备 36 2.1.8 βC1 ORF启动子表达载体的构建 36-39 2.1.9 启动子的序列分析 39-40 2.1.10 瞬时表达 40 2.1.11 烟草的转化 40-41 2.1.12 转基因植物总DNA提取(CTAB法) 41-42 2.1.13 转基因烟草的PCR鉴定 42 2.1.14 转基因植物总RNA提取 42-43 2.1.15 Real time PCR检测植物基因的表达量 43-44 2.1.16 GUS活性的组织化学染色 44-45 2.1.17 GUS荧光活性分析 45-46 2.2 实验结果 46-58 2.2.1 βC1 ORF全长启动子的序列分析 46 2.2.2 βC1 ORF启动子表达载体的构建 46-49 2.2.3 瞬时表达中GUS荧光活性分析 49-50 2.2.4 瞬时表达中GFP荧光活性分析 50-51 2.2.5 转基因烟草的获得和分子鉴定 51-53 2.2.6 转基因普通烟中的GUS荧光活性分析和Realtime PCR分析 53-55 2.2.7 转基因普通烟中GUS活性的组织化学分析 55-58 2.3 讨论 58-60 3.中国番茄黄化曲叶病毒Y25分离物伴随的卫星启动子活性检测 60-67 3.1 材料和方法 60-62 3.1.1 病毒毒源和供试植物 60 3.1.2 菌株和质粒 60 3.1.3 Y25 βC1 ORF启动子表达载体的构建 60-62 3.1.4 瞬时表达和GUS活性检测、分析 62 3.2 实验结果 62-66 3.2.1 TYLCCNV-Y25β启动子的序列分析 62-63 3.2.2 TYLCCNV-Y25β启动子的克隆与表达载体的构建 63-65 3.2.3 瞬时表达中GUS荧光活性分析 65-66 3.3 讨论 66-67 4.全文小结 67-68 5.参考文献 68-78 6.附录 78-82 附录A 常用生化及分子生物学试剂与仪器 78-79 附录B 常用缓冲液及培养基配方 79-82
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中图分类: > 生物科学 > 微生物学 > 微生物分类学(系统微生物学) > 病毒(滤过性病毒)
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