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利用F_2群体构建不结球白菜遗传连锁图谱及抽薹性QTL定位

作　者: 班青宇
导　师: 侯喜林
学　校: 南京农业大学
专　业: 蔬菜学
关键词: 不结球白菜 F2群体 遗传连锁图谱 QTL定位 抽薹性状
分类号: S634.3
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
下　载: 43次
引　用: 1次
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内容摘要


本文构建了一张不结球白菜连锁遗传图谱,并在此基础上对不结球白菜抽薹性状进行了QTL分析。其主要内容如下：首先,本文以不结球白菜N29和N14为亲本,构建了包括300个单株的F2作图群体,并应用SSR分子标记,通过Joinmap3.0软件分析,得到一张不结球白菜分子遗传图谱。图谱总长度604.7 cM,包括11个连锁群,72个多态性标记,其中偏分离标记32个,占44%。每个连锁群上的标记数在2-21之间,连锁群长度在22.1-138.7 cM的范围内,平均图距在6.6-19.4 cM之间,总平均距离8.4cM。在本研究结果的基础上可继续增加分子标记数目来不断完善不结球白菜遗传连锁图谱,更好地服务于农艺性状的定位工作。其次,利用已构建的包括72个分子标记的不结球白菜分子遗传图谱,采用复合区间作图法(CIM)对不结球白菜抽薹性状进行了QTL定位和遗传效应分析,共得到与和抽薹日数相关的QTL4个,与开花日数相关的QTL5个,用六级分级方法检测到QTL4个,用四级分级方法检测到QTL2个。这将为不结球白菜抽薹性状分子标记辅助选择育种奠定基础。最后,以包括186个分子标记的不结球白菜遗传连锁图谱为框架,对由112个不结球白菜株系组成的‘暑绿’双单倍体(DH)群体,采用复合区间作图法,检测了控制不结球白菜叶片脯氨酸含量和可溶性蛋白含量的数量性状基因位点(QTL)。检测到1个控制不结球白菜叶片脯氨酸含量的QTL,位于第5连锁群上,与分子标记C20相距7.2cM,LOD值为2.04,加性效应和贡献率分别为8.32%和0.37。检测到1个控制不结球白菜叶片可溶性蛋白含量的QTL,位于第3连锁群上,与分子标记AE15—3相距0.8cM,LOD值为2.43,加性效应为8.12%,贡献率为0.004。

全文目录


摘要  6-7
ABSTRACT  7-9
英文缩略词  9-10
引言  10-12
第一部分 文献综述  12-35
  第一章 不结球白菜遗传图谱构建、QTL定位及抽薹性状的研究进展  12-35
    1.1 芸薹属作物遗传图谱研究进展  12-26
      1.1.1 遗传标记研究进展  12-15
      1.1.2 分子标记技术的类型及其原理  15-21
      1.1.3 分子遗传图谱构建的理论和方法  21-26
    1.2 芸薹属作物数量性状位点(Quantitative Trait Loci QTL)定位的方法、原理及研究进展  26-32
      1.2.1 QTL定位的方法与原理  26-28
      1.2.2 QTL定位的研究概况  28-29
      1.2.3 白菜类QTL定位研究进展  29-32
    1.3 芸薹属作物抽薹特性研究进展  32-34
      1.3.1 芸薹属作物晚抽薹育种  32
      1.3.2 芸薹属作物抽薹期的遗传规律  32-33
      1.3.3 芸薹属作物抽薹性遗传标记  33-34
    1.4 展望  34-35
第二部分 研究报告  35-72
  第二章 利用F_2群体构建不结球白菜遗传连锁图谱  35-52
    2.1 材料与方法  37-43
      2.1.1 作图群体的构建  37-38
      2.1.2 基因组DNA的提取、纯化与检测  38-39
      2.1.3 SSR扩增条件及序列  39-41
      2.1.4 PCR产物检测  41-43
      2.1.5 数据整理和连锁分析  43
    2.2 结果与分析  43-48
      2.2.1 基因组DNA的提取  43-44
      2.2.2 SSR分析  44-45
      2.2.3 F2群体连锁图谱的特征分析  45
      2.2.4 遗传图谱的构建  45-48
    2.3 讨论  48-52
  第三章 不结球白菜抽薹性状QTL定位  52-63
    3.1 材料与方法  53-56
      3.1.1 材料  53-54
      3.1.2 方法  54-56
    3.2 结果与分析  56-61
      3.2.1 抽薹性状的次数分布及其变异  56-57
      3.2.2 抽薹性状的QTL分析  57-61
    3.3 讨论  61-63
  第四章 不结球白菜叶片脯氨酸与可溶性蛋白含量的QTL分析  63-72
    4.1 材料与方法  64-65
      4.1.1 材料  64
      4.1.2 方法  64-65
    4.2 结果与分析  65-69
      4.2.1 叶片脯氨酸含量表型值及其遗传变异  65-66
      4.2.2 叶片可溶性蛋白含量表型值及其遗传变异  66-67
      4.2.3 QTL检测  67-69
    4.3 讨论  69-72
全文结论  72-74
参考文献  74-82
在读期间发表相关学术论文  82-84
致谢  84

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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 蔬菜园艺 > 白菜类 > 白菜（小白菜）
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