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膀胱肿瘤蛋白质表达谱及生物标记发现

作　者: 李超群
导　师: 邵世修
学　校: 青岛大学
专　业: 外科学
关键词: 膀胱肿瘤间质生物通路基因本体论生物标记
分类号: R737.14
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

目的总体描述浅表膀胱肿瘤蛋白质表达谱的特点,并探讨膀胱肿瘤-间质相互作用,在总体描述基础上探讨膀胱癌尿液蛋白质芯片的发现。方法前瞻性收集浅表膀胱移行细胞癌标本4例,激光捕获显微切割获得纯化的浅表膀胱肿瘤细胞以及间质细胞。2维液相色谱分离多肽混合物,电喷雾串联质谱鉴定蛋白质。生物信息学方法分析鉴定蛋白质。与已发表文献进行比对。结果4例浅表膀胱移行细胞癌标本中775个蛋白质共同表达。612个蛋白质具有基因本体论(GO)生物学途径注解。40、25个GO生物学途径术语为浓集、缺失表达。表达谱浓集表达蛋白质集中于代谢途径。117个蛋白质共同表达于肿瘤细胞以及间质细胞,其中73个定位于已知生物通路。属于细胞粘附、细胞增殖、细胞分化类别的蛋白质是尿液中检测肿瘤的良好的生物标记候选蛋白。结论：浅表膀胱肿瘤蛋白质表达谱研究对理解肿瘤细胞生物学,肿瘤间质相互作用提供了理论基础,并为从尿液中发现生物标记提供了候选蛋白。

全文目录

Abstract  2-3
中文摘要  3-6
第一章纯化浅表膀胱癌蛋白质表达谱构建  6-20
  前言  6-8
  实验材料  8-11
    1 膀胱移行细胞癌及对应癌旁正常组织样本来源  8
    2 主要试剂  8-9
    3 实验试剂配置  9
    4 仪器设备  9-11
  实验方法  11-15
    1 切片制备与HE染色  11
    2 激光捕获显微切割  11-12
    3 总蛋白质的提取  12
    4 BCA(二喹啉甲酸)法样本蛋白浓度的检测  12-13
    5 胰蛋白酶酶解蛋白  13
    6 二维液相色谱电喷雾串联质谱  13-14
    7 搜索多肽及蛋白组数据库进行蛋白质属性分析  14-15
  实验结果  15-16
    1 激光捕获显微切割  15
    2 质谱鉴定结果  15-16
  讨论  16-20
    1 蛋白质组学技术在膀胱癌研究中的必要性以及意义  16
    2 激光捕获显微切割在膀胱癌研究中的意义  16-17
    3 质谱鸟枪法蛋白组学技术在膀胱癌基因研究意义  17
    4 间质蛋白质表达谱在膀胱癌研究中的意义  17-18
    5 实验方法学特点与经验心得  18-20
第二章纯化浅表膀胱移行细胞癌蛋白质表达谱GO分析及尿液生物标记发现  20-27
  前言  20-21
  材料与方法  21
    GO检索软件平台  21
  实验方法  21-24
    1. GO功能聚类分析软件的使用  21-22
    2 GO浓集/缺失表达分析  22
    3 蛋白质表达谱GO分析以及尿液中生物标记的发现  22-24
  结果  24-25
    1. 肿瘤蛋白质表达谱功能分类结果  24
    2. 与尿液蛋白质表达谱分析比对  24-25
  讨论  25-27
参考文献  27-28
附图及表格  28-31
膀胱肿瘤生物标记及靶向治疗  31-43
  参考文献  37-43
在读期间发表的文章及科研成果  43-44
致谢  44-45

膀胱肿瘤蛋白质表达谱及生物标记发现

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