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西施舌和大黄鱼遗传多样的ISSR分析

作　者: 孙中响
导　师: 陈葵；陈淑吟
学　校: 苏州大学
专　业: 水产养殖
关键词: 西施舌 大黄鱼 ISSR 遗传距离 遗传分化
分类号: S917.4
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
下　载: 55次
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内容摘要


本文通过简单重复序列区间标记技术,即ISSR标记分别分析西施舌(Coelomactra antiquate)和大黄鱼(Pseudosciaena crocea Richardson)的群体遗传特性。为西施舌和大黄鱼的系统发育研究、种质资源调查、遗传多样性的保护以及品系培育和品种改良提供分子生物学依据。利用ISSR分子标记技术分析西施舌种群的遗传多样性和遗传分化。用17个引物对江苏赣榆(GY)、启东(QD)及福建长乐(CL)3个种群共68个个体进行扩增,共测到236个位点,其中多态位点234个,每个引物扩增条带数为8～20之间,片段长度200～3000bp。GY、QD和CL各种群的多态位点百分率(PPL)分别为;94.92%,86.86%和90.25%,GY、QD和CL种群的Shannon’s信息指数分别为:0.5419,0.4918和0.4895,Nei’s基因多指数分别为:0.3700,0.3361和0.3301。研究表明:西施舌各种群均具有很高的遗传多样性水平;聚类分析显示GY群体和QD群体先聚一起后,再与CL群体构成姐妹支。利用ISSR分子标记技术分析大黄鱼种群的遗传多样性和遗传分化。用7个引物对江苏(JS)、浙江(ZJ)及福建(FJ)3个种群共72个个体进行扩增,共测到78个位点,其中多态位点74个,每个引物扩增条带数为8～14之间,片段长度200～3000bp。JS、ZJ和FJ各种群的多态位点百分率(PPL)分别为;75.64%,65.38%和80.77%,JS、ZJ和FJ种群的Shannon’s信息指数分别为:0.4610,0.3909和0.4758,Nei’s基因多指数分别为:0.3183,0.2697和0.3592。研究表明:大黄鱼各种群均具有较高的遗传多样性水平;聚类分析显示JS群体和FJ群体先聚一起后,再与ZJ群体构成姐妹支。

全文目录


摘要  4-5
Abstract  5-9
前言  9-10
文献综述  10-21
  一、西施舌的生物学特性及研究现状  10-12
    1、西施舌的生物学特性  10-11
    2、西施舌的研究现状  11-12
  二、大黄鱼的生物学特性及研究现状  12-14
    1、大黄鱼的生物学特性  12
    2、大黄鱼的研究现状  12-14
  三、DNA 分子标记研究概述  14-19
  四、海洋动物遗传多样性概述  19-20
  五、本研究的目的与意义  20-21
第一章 西施舌不同群体遗传多样性分析  21-29
  1. 材料与方法  21-22
    1.1 西施舌样品采集与基因组DNA 提取  21
    1.2 PCR 反应体系  21-22
    1.3 PCR 产物检测及数据分析  22
  2. 结果与分析  22-27
    2.1 ISSR 反应体系的优化  22-23
    2.2 引物筛选  23-25
    2.3 西施舌的群体遗传多样性  25-26
    2.4 西施舌的群体间遗传距离  26-27
  3. 讨论  27-29
    3.1 西施舌3 个自然群体的种质资源状况  27-28
    3.2 西施舌3 个自然群体的遗传分化  28-29
第二章 大黄鱼不同群体的遗传多样性分析  29-36
  1. 材料与方法  29-30
    1.1 大黄鱼样品采集与基因组DNA 提取  29
    1.2 大黄鱼PCR 反应体系  29
    1.3 大黄鱼PCR 产物检测及数据分析  29-30
  2. 结果与分析  30-35
    2.1 大黄鱼ISSR 反应体系的优化  30
    2.2 大黄鱼引物筛选  30-33
    2.3 大黄鱼群体遗传多样性  33-34
    2.4 大黄鱼群体间遗传距离  34-35
  3. 讨论  35-36
本文小结  36-37
参考文献  37-44
附录1  44-56
附录2  56-61
攻读学位期间公开发表的论文  61-62
致谢  62-63

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中图分类: > 农业科学 > 水产、渔业 > 水产基础科学 > 水产生物学 > 水产动物学
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