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山西省华北落叶松天然种群遗传多样性的AFLP分析

作　者: 李晓楠
导　师: 王孟本
学　校: 山西大学
专　业: 生态学
关键词: 华北落叶松 遗传多样性 AFLP 遗传距离
分类号: S791.22
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要


华北落叶松(Larix principis-rupprechtii Mayr.)是我国华北地区寒温性针叶林中的主要树种之一。其天然林主要分布在河北和山西两省,具有改良土壤,涵养水源等作用。本研究以山西省的6个华北落叶松天然种群为研究对象,采用AFLP分子标记技术,对其遗传多样性和空间遗传结构特征进行研究。主要研究结果如下：1)建立了华北落叶松AFLP反应体系和程序,并优化了影响AFLP反应的5个主要因素(酶切时间、内切酶用量、DNA用量、连接产物和预扩增产物的稀释倍数),即在反应体系均为20μL的条件下,酶切时间为7h (37℃3.5h; 65℃3.5h), Eco I内切酶和MseⅠ内切酶用量均为1U, DNA用量为3μL (50ng/μL),连接产物稀释10倍取5μL用于预扩增,预扩增产物稀释70倍取4gL用于选择性扩增。2)用筛选出的8对引物组合对6个华北落叶松天然种群的144个个体进行AFLP分析,共扩增出402条谱带,其中289条为多态性带,多态性带占71.89%。恒山张家洼种群(HS)的多态位点百分率和遗传多样性指数最高(PPB=55.97%,h=0.2065,I=0.3047)；关帝山庞泉沟种群(GD)的多态位点百分率和遗传多样性指数最低(PPB=44.53%,h=0.1519,I=0.2284)。3)华北落叶松总基因多样性(Ht)为0.2245,种群内基因多样性(Hs)为0.1810。遗传分化系数(Gst)为0.1936,表明在总的遗传变异中有19.36%的变异存在于种群间,80.64%的变异存在于种群内,说明华北落叶松的遗传变异主要存在于种群内,且种群内个体间的遗传分化程度较高。基因流(Nm)为2.0821,表明种群间基因交流较频繁。4)6个华北落叶松种群间遗传一致度(I)在0.9269-0.9677之间,平均为0.9409；遗传距离(D)在0.0328-0.0759之间,平均为0.0610。表明这6个华北落叶松天然种群间的亲缘关系很近,但又不是完全一致,各种群间存在着一定的遗传变异。其中关帝山庞泉沟种群(GD)和芦芽山荷叶坪种群(LY)的亲缘关系最近(I=0.9677；D=0.0328),而六棱山桦林背种群(LL)和恒山张家洼种群(HS)的亲缘关系最远(I=0.9269；D=0.0759)。用UPGMA法进行聚类分析,可将6个种群分为三组：五台山茂材林种群(WT)和六棱山桦林背种群(LL)为一组；芦芽山荷叶坪种群(LY)和关帝山庞泉沟种群(GD)为一组；恒山张家洼种群(HS)和太岳山好地方种群(TY)为一组。

全文目录


中文摘要  8-10ABSTRACT  10-12第一章 引言  12-22  1.1 分子标记概述  12-17    1.1.1 RFLP  14    1.1.2 RAPD  14-15    1.1.3 SSR  15    1.1.4 ISSR  15-16    1.1.5 AFLP  16    1.1.6 SCAR  16    1.1.7 STS  16    1.1.8 CAPs  16-17  1.2 AFLP分子标记简介  17-18  1.3 华北落叶松概述  18-20    1.3.1 生物学特性  18-19    1.3.2 地理分布特点  19-20    1.3.3 经济与科研价值  20  1.4 本研究的目的和意义  20-22第二章 材料与方法  22-32  2.1 供试材料  22  2.2 仪器与试剂  22-23    2.2.1 主要仪器  22-23    2.2.2 主要试剂  23  2.3 实验方法  23-30    2.3.1 DNA的提取与检测  23-25    2.3.2 AFLP反应体系  25-29    2.3.3 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳  29-30  2.4 数据统计与分析  30-32    2.4.1 数据统计  30-31    2.4.2 多态性分析  31    2.4.3 聚类分析  31-32第三章 结果与分析  32-39  3.1 DNA的提取与检测  32  3.2 AFLP反应体系的优化  32-34    3.2.1 酶切体系的优化  32-33    3.2.2 连接产物稀释倍数的优化  33-34    3.2.3 预扩增产物稀释倍数的优化  34  3.3 引物筛选结果  34-35  3.4 遗传多样性  35-39    3.4.1 扩增结果  35-36    3.4.2 遗传多样性分析  36-38    3.4.3 聚类分析  38-39第四章 讨论与结论  39-44  4.1 讨论  39-42    4.1.1 DNA的提取  39    4.1.2 酶切和连接  39-40    4.1.3 电泳和银染  40    4.1.4 华北落叶松天然种群的遗传多样性  40    4.1.5 华北落叶松天然种群的空间遗传结构  40-42    4.1.6 资源保护策略和合理利用  42  4.2 结论  42-44参考文献  44-51发表文章目录  51-52致谢  52-53个人简况及联系方式  53-55

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中图分类: > 农业科学 > 林业 > 森林树种 > 针叶树类 > 落叶松
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