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水稻ω-3脂肪酸脱氢酶的基因克隆和功能研究
作 者: 王敬文
导 师: 沈大棱
学 校: 复旦大学
专 业: 遗传学
关键词: 脂肪酸 原位杂交 Osfad8 水稻 ω-3脂肪酸脱氢酶 转基因烟草 类黄酮-3’5’-羟化酶 同源摸拟 分子对接 蝴蝶兰
分类号: Q943.2
类 型: 博士论文
年 份: 2006年
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内容摘要
1水稻是我国最主要的粮食作物之一,水稻的播种主要分布于热带和亚热带地区,其地理分布主要受温度的影响。不饱和脂肪酸是植物膜系统的重要组份之一,它的含量的变化是植物缓解外界温度压力的一种重要手段。本论文中用RT-PCR的方法从水稻Oryza sativa L.中克隆到编码水稻叶绿体ω-3脂肪酸脱氢酶的开放读框,命名为Osfad8。Southern杂交显示水稻中的Osfad8基因至少有两个拷贝,或者是由紧密连锁的一个小的基因家族组成。RT-PCR和原位杂交显示,Osfad8主要在叶中转录,而在根中几乎检测不到任何mRNA的积累。较低温度下(15-20℃)Osfad8的转录水平较常温(25℃)明显增高。原位杂交显示当水稻在15℃下低温处理5天和10天后,在叶片栅栏组织和海绵组织中的能检测到较明显的Osfad8的转录信号。为了进一步研究此基因的功能,我们分别正向和反向将Osfad8的ORF转入烟草中,产生8S-52和8S-101两个正向的转化品系,以及8A-35反向转化品系。在正向转化品系中,Osfad8的ORF以正向插入到CaMV 35S启动子的下游,导致16:3和18:3三烯酸的含量显著增高。低温2℃处理7天发现,对照烟草(pBI 121空载转化植株)的叶片已经明显受到伤害,并且已经萎缩,而在8S-52和8S-101中并没有明显的叶片损伤。在8A-35中,三烯脂肪酸的含量较对照相比降低约40.2%,44℃高温处理3天后,对照植株已经枯萎死亡,而8A-35仍能正常存活。以上数据显示Osfad8为编码低温诱导型的叶绿体ω-3脂肪酸脱氢酶。2蝴蝶兰又名蝶兰,原产亚洲热带和澳大利亚,为热带兰中之珍品被益为热带兰皇后。类黄酮-3’5’-羟化酶(F3’5’H)是合成3’,5’-带羟基的花色素(例如翠雀素)的关健酶,此色素是蓝花和紫花色素形成的前体。本研究从蝴蝶兰花瓣中克隆到了类黄酮-3’5’-羟化酶的cDNA,命名为Phf35h,序列号为DQ148458 in GenBank/EMBL/DDBJ。Phf35h的DNA克隆是通过基于PCR的一系列方法获得的。对Phf35h进行序列分析表明,该基因的DNA序列含有一个内含子,两个外显子,含有一个编码507个氨基酸残基的开放读框。Southern杂交表明在蝴蝶兰中只存在一个拷贝的f35h基因。通过RT-PCR的方法发现Phf35h的mRNA是在花朵发育的中期开始转录,和花青素的积累保持一致;在紫色花瓣中有较高的mRNA的积累,在根中和叶中没有检测到转录。同源模拟PhF3’5’H蛋白的三维结构表明此蛋白主要含有两个结构域:α结构域(含有大量的α螺旋和三个小的β折叠)和β结构域(含有很多β折叠和三个α螺旋)。PhF3’5’H蛋白与底物二氢黄酮醇dihydrokaempferol的结合位点通过分子对接的手法进行分析表明,在此蛋白中存在这一个高度保守的HPPTPLSLPH氨基酸序列,可能和二氢黄酮醇的芳香环相互作用。
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全文目录
中文摘要 6-8 英文摘要 8-10 第一章 水稻ω-3脂肪酸脱氢酶的分子生物学研究进展 10-30 1 脂肪酸脱氢酶分类与生物学功能 10-17 1.1 脂肪酸脱氢酶的种类和分布 10-15 1.2 脂肪酸脱氢酶序列分析 15-16 1.3 脂肪酸脱氢酶的生物学作用 16-17 2 编码ω-3脂肪酸脱氢酶的三个基因 17-19 3 植物脂肪酸的生理功能 19-21 3.1 脂肪酸与温度耐受性 20-21 3.2 脂肪酸与植物抗病 21 3.3 植物脂肪酸的食用及工业价值 21 4.水稻中ω-3脂肪酸脱氢酶的研究现状 21-23 参考文献 23-29 研究思路和技术路线 29-30 第二章 温度依赖型的水稻Osfad8基因的克隆和功能分析 30-64 1.1 前言 30 2.材料 30-31 2.1 植物材料 30-31 2.2 细菌载体与主要试剂 31 2.3 主要的仪器设备 31 3 方法 31-48 3.1 水稻ω-3脂肪酸脱氢酶Osfad8ORF的克隆 31-35 3.2 Southern杂交 35-38 3.3 RT-PCR 38-39 3.4 原位杂交 39-44 3.5 Osfad8 ORF的载体构建 44-45 3.6 农杆菌介导的烟草的转化 45-46 3.7 转基因烟草的鉴定 46-48 4 结果和讨论 48-59 4.1 水稻ω-3脂肪酸脱氢酶基因ORF的克隆和序列分析 48-51 4.2 Southern杂交分析 51-52 4.3 水稻ω-3脂肪酸脱氢酶不同温度下的时空表达模式 52-53 4.4 转基因烟草的鉴定 53-57 4.5 转基因烟草对不同温度的耐受性 57-59 5 小结 59-61 参考文献 61-64 第三章 蝴蝶兰类黄酮-3’5’-羟化酶基因cDNA的克隆,表达分析和同源建模 64-86 1.前言 64-66 2.材料 66-78 2.1 植物材料 66 2.2 细菌载体与主要试剂 66-67 2.3 蝴蝶兰DNA和RNA的提取 67-68 2.4 蝴蝶兰F35H基因组克隆和cDNA克隆的分离 68-72 2.5 蝴蝶兰F35H基因的Southern杂交 72-75 2.6 RT-PCR检测蝴蝶兰F35H基因的表达模式 75-76 2.7 蝴蝶兰PhF3’5’H三维模型的建立 76 2.8 PhF3’5’H与底物的分子对接 76-78 3.结果与讨论 78-86 3.1 F35H DNA和cDNA克隆的获得 78-81 3.2 RT-PCR研究蝴蝶兰Phf35h基因的表达模式 81-82 3.3 三维模型的构建及Phalaenopis F3’5’H蛋白与底物相互作用的研究 82-86 参考文献 86-88 发表的论文 88-89 申请专利 89-90 致谢 90-91
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中图分类: > 生物科学 > 植物学 > 植物细胞遗传学 > 植物基因工程
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