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玉米温敏型核雄性不育基因的差异表达
作 者: 刘艳鸣
导 师: 张银东
学 校: 华南热带农业大学
专 业: 作物遗传育种
关键词: 琼42Qms 琼42 温敏型核雄性不育 抑制扣除杂交 差异片段
分类号: S513
类 型: 硕士论文
年 份: 2002年
下 载: 92次
引 用: 1次
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内容摘要
玉米是我国三大粮食作物之一,由于我国玉米种植面积不可能进一步扩大,玉米增产只能靠单产产量的增加。就研究现状而言,利用雄性不育系生产杂交种是进一步提高单产的主要途径。由于目前对玉米雄性不育的遗传机理缺乏足够的了解,使得对玉米雄性不育系的利用往往会碰到一些致命性问题。本研究旨在分离与核雄性不育相关的差异cDNA片段,为克隆全长基因、分析其功能及遗传机理奠定基础。 本研究首先对琼42Qms和琼42各分化时期的雄穗进行跟踪解剖、显微观察,并观察相应植株的叶片数,最后确定当可见叶为11-13片叶,展开叶为7.5-8.8片时琼42Qms和琼42的雄穗处于小花分化期,取材即依据以上数据进行。 提取琼42Qms和琼42小花分化期雄穗的总RNA,纯化得mRNA,以琼42Qms的mRNA作检测样本(Tester)、琼42的mRNA作参照样本(Driver)进行抑制扣除杂交,其产物进行克隆得差减文库。 从文库中挑取22个白色菌落,提质粒、酶切鉴定,其中有20个菌落中有插入片段,为阳性菌落。从20个阳性菌落中取10个提质粒、酶切,用低熔点琼脂糖凝胶回收酶切片段,DIG标记,作探针;与琼42Qms和琼42的小花分化期雄穗总RNA进行杂交,获得—个仅在琼42Qms中特异表达的差异cDNA片段。以该片段作探针与琼42Qms小花分化期、抽穗成熟期的叶片和雄穗的总RNA进行杂交,结果表明,该片段只在小花分化期的雄穗中表达,说明该片段可能与育性有关。 对该片段进行测序,所得序列在Genebank库中进行同源性检索,得知该序列在Genebank库中无同源序列,用PC-gene软件分析得知该片段包含一个基因的部分阅读框架,是个新基因片段。
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全文目录
中文摘要 6-7 1 前言 7-26 1.1 玉米雄性不育在育种中的应用及前景 8-13 1.1.1 细胞质雄性不育 8-11 1.1.2 核雄性不育 11-13 1.2 玉米雄穗的分化过程 13-15 1.3 差异表达基因(片段)的分离 15-24 1.3.1 示差筛选和扣除杂交 15-16 1.3.2 mRNA差异显示技术 16-17 1.3.3 RNA指纹技术 17 1.3.4 代表性差示分析 17-18 1.3.5 基因表达序列分析 18-19 1.3.6 抑制扣除技术 19-23 1.3.6.1 SSH技术的基本原理 19 1.3.6.2 SSH技术的主要过程 19-21 1.3.6.3 SSH技术的优缺点评析 21-22 1.3.6.4 SSH技术的最新研究进展 22-23 1.3.7 交互扣除RNA差别显示技术 23-24 1.4 本研究的目的、意义及研究技术路线 24-26 1.4.1 本研究的目的、意义 24-25 1.4.2 研究技术路线 25-26 2 材料与方法 26-43 2.1 材料 26-27 2.1.1 试验材料 26-27 2.1.2 菌种 27 2.1.3 试剂 27 2.2 方法 27-42 2.2.1 玉米雄穗分化过程中各时期形态的显微观察 27 2.2.2 近等位基因系琼42Qms和琼42小花分化期雄穗总RNA提取及mRNA纯化 27-30 2.2.2.1 小花分化期雄穗总RNA提取 27-28 2.2.2.2 mRNA的纯化 28-30 2.2.3 近等位基因系42Qms和琼42差异表达分析 30-39 2.2.3.1 cDNA第一链合成 30 2.2.3.2 cDNA第二链合成 30-31 2.2.3.3 RsaⅠ酶切 31-32 2.2.3.4 连接接头 32-33 2.2.3.5 第一次杂交 33 2.2.3.6 第二次杂交 33-34 2.2.3.7 PCR扩增 34-36 2.2.3.8 PCR扩增产物的克隆及重组子的筛选 36-39 2.2.3.8.1 连接 36 2.2.3.8.2 宿主菌E.coli DH5α感受态细胞的制备 36-37 2.2.3.8.3 连接产物转化宿主菌E.coli DH5α感受态细胞 37 2.2.3.8.4 质粒的微量提取 37-38 2.2.3.8.5 重组子的酶切鉴定 38-39 2.2.4 Northen杂交分析 39-42 2.2.4.1 琼42和琼42Qms小花分化期、抽穗成熟期的叶片、雄穗总RNA的提取 39 2.2.4.2 DNA探针的制备 39-40 2.2.4.2.1 利用低熔点琼脂糖凝胶回收目的片段 39 2.2.4.2.2 DIG树己DNA 39-40 2.2.4.3 RNA的印迹转移 40-41 2.2.4.3.1 RNA甲醛电泳的准备 40 2.2.4.3.2 RNA电泳 40 2.2.4.3.3 凝胶印迹转移 40-41 2.2.4.4 预杂交和杂交 41 2.2.4.5 杂交后洗膜 41-42 2.2.4.6 免疫检测 42 2.3 测序 42-43 3 结果与分析 43-48 3.1 玉米雄穗各分化时期形态的观察 43 3.2 小花分化期雄穗总RNA的提取 43-44 3.3 mRNA的纯化 44 3.4 近等位基因系琼42和琼42Qms的差异表达分析 44-45 3.5 PCR扩增产物的克隆及重组子筛选 45-46 3.6 Northern杂交分析 46-47 3.7 序列分析 47-48 4 讨论 48-51 4.1 玉米雄穗各分化时期的显微观察 48-49 4.2 琼42和琼42Qms小花分化期雄穗总RNA的提取 49-50 4.3 PCR产物的克隆 50 4.4 近等位基因系琼42和琼42Qms差异表达分析 50 4.5 差异片段的序列测定及分析 50-51 5 结论 51-52 6 参考文献 52-61 7 英文摘要 61-63 8 附图 63-66 9 致谢 66
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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 禾谷类作物 > 玉米(玉蜀黍)
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