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苜蓿中华根瘤菌中参与丙二酸代谢的matPQMAB操纵子的研究
作 者: 王永宝
导 师: 孙杰;王彦章
学 校: 石河子大学
专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: TRAP转运系统 胞外溶质受体 苜蓿中华根瘤菌 凝胶滞后实验
分类号: S541.9
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
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内容摘要
TRAP转运体(tripartite ATP-independent periplasmic)是一类依赖胞外溶质受体(extracytoplasmic solute receptor, ESR)特异性吸收胞外游离溶质的二级主动转运系统。该转运体通过离子电化学梯度而不是ATP水解为溶质运输提供能量,广泛存在于细菌(bacteria)和古生菌(archaea)等原核生物中。TRAP转运体是一种新型的溶质转运系统,主要由三个部分组成,即一个吸收胞外溶质的ESR和两个大小不同的内膜蛋白。本文初步研究了苜蓿中华根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)Rm1021中matPQMAB基因簇的功能及其表达调控。通过生物信息学分析S.meliloti Rm1021基因组序列,发现在共生大质粒A(pSymA)上含有四个连续的基因SMa0157、SMa0155、SMa0151、SMa0150,它们构成一个操纵子,可能编码一个丙二酸盐TRAP转运系统,分别命名为matP、matQ、matMA、matB。在该操纵子的下游有一个转录调控因子GtrA,可能调节matPQMAB操纵子的表达。为了验证matPQMAB操纵子编码丙二酸盐TRAP转运体并受GtrA表达调控,我们构建了gtrA、matP、matQ、matMA、matB的质粒插入突变体,并进行了自生和共生表型分析。在以丙二酸盐为唯一碳源的基本培养基中野生型Rm1021能正常生长,而matP、matQ、matMA、matB突变体不能生长,说明matPQMAB操纵子编码一个丙二酸盐转运系统,并且是唯一转运途径。gtrA突变体在相同培养条件下生长略微缓慢。此外,gtrA突变体接种宿主植物紫花苜蓿,结瘤固氮效率低下。通过凝胶阻滞实验初步结果发现,GtrA蛋白能够与matPQMAB操纵子的启动子区域直接结合,说明GtrA直接调节matPQMAB操纵子的表达。另外,我们对matPQMAB操纵子的matB基因产物的功能进行了分析研究。从Rm1021基因组中克隆出matB基因,并在大肠杆菌(Escherichia coli)中进行了体外诱导表达和纯化。纯化的MatB蛋白具有丙二酸单酰辅酶A合成酶的活性,测定的Km值是710μmoL,Vmax是0.209μmoL/min/mg。
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全文目录
摘要 5-6 Abstract 6-9 第一章 细菌中 TRAP 转运系统的研究进展 9-30 1.1 引言 9 1.2 TRAP 的含义 9-11 1.3 ESR 的含义和功能 11-15 1.4 TRAP 转运体的功能特征 15-18 1.5 TRAP 的转运机制 18-20 1.6 TRAP 转运体基因结构和亚基组成的多样性 20-21 1.7 TRAP 的转运体家族的组成 21-26 1.8 其它相关的TRAP 转运体 26-28 1.9 结论 28-29 1.10 本课题的研究意义 29-30 第二章 GtrA 调控matPQMAB 操纵子的研究 30-54 1 材料与方法 30-43 1.1 植株材料 30-31 1.2 菌株 31-32 1.3 培养基、抗生素及菌体的培养 32 1.4 酶及生化试剂 32 1.5 质粒制备及转化 32-34 1.6 DNA 片段的纯化回收 34-35 1.7 竞争性结瘤的测定 35 1.8 固氮酶活的测定 35-36 1.9 生长曲线的测定 36 1.10 三亲本杂交实验 36 1.11 噬菌体转导实验 36-37 1.12 蛋白表达载体的诱导表达和纯化 37-38 1.13 NTA 树脂的再生 38-39 1.14 凝胶阻滞实验 39-43 2 结果与讨论 43-53 2.1 gtrA 与matPQMAB 基因簇的序列分析 43-44 2.2 突变体的构建 44 2.3 gtrA 与matPQMAB 操纵子对共生的影响 44-48 2.4 竞争性结瘤实验 48-49 2.5 matPQMAB 操纵子参与丙二酸盐的吸收和利用 49-51 2.6 凝胶阻滞实验 51-53 3 本章小结 53-54 第三章 matPQMAB 操纵子中matB 基因的功能研究 54-62 1 材料与方法 54-56 1.1 菌株与质粒 54-55 1.2 培养基、抗生素及菌体的培养 55 1.3 MatB 与MatA 蛋白的诱导表达与纯化浓缩 55 1.4 MatB 蛋白酶活力单位的测定 55 1.5 MatB 的米氏常数(km)和最大反应速率(Vmax)的测定 55-56 2 结果与分析 56-61 2.1 MatB 表达蛋白的检测 56 2.2 MatB 表达蛋白的纯化与浓缩 56-58 2.3 MatB 蛋白的酶活性检测 58-59 2.4 MatA 蛋白的纯化与浓缩 59-61 3 讨论 61-62 总结与展望 62-63 参考文献 63-70 附录 70-78 致谢 78-79 作者简介 79-80 附件 80
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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 饲料作物、牧草 > 多年生豆科牧草 > 其他
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