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1,3-丙二醇氧化还原酶和醛还原酶基因的克隆与表达
作 者: 张乐
导 师: 修志龙;王风刚
学 校: 大连理工大学
专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: Klebsiella pneumoniae 1,3-丙二醇氧化还原酶 醛还原酶 NADPH NADH
分类号: Q78
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
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内容摘要
1,3-丙二醇具有广泛的应用,特别是在聚酯合成工业上。微生物转化法生产1,3-丙二醇与化学法相比,具有明显的优点。近年来,微生物转化法越来越受到人们的重视。甘油歧化的氧化途径提供的NADH的量是有限的,从而限制了1,3-丙二醇的合成。代谢流分析表明,如果1,3-丙二醇氧化还原酶既能利用NADH,又能利用NADPH,将会增加1,3-丙二醇的产量。根据计算机模拟的结果,通过定点突变的方法将Asp41突变为甘氨酸,来改变该酶结合辅酶的特异性。酶活测定结果显示,突变酶分别以NADH和NADPH为辅酶时比酶活分别为629.38 U/mg和277.35 U/mg,而原始酶分别为706.90U/mg和20.95 U/mg。原始酶对NADH的米氏常数(Km)和转换数(kcat)分别为0.015mmol/L和90.64 1/s。突变酶对NADH的Km和kcat分别为0.48 mmol/L和411.61 1/s,对NADPH的Km和kcat分别为0.14 mmol/L和187.35 1/s。虽然突变酶利用两种辅酶的Km都有所增加,但是利用NADH的kcat比原始酶提高3.54倍,利用NADPH的kcat比原始酶提高1.07倍。以Klebsiella pneumoniae DSM2026基因组为模板,利用PCR技术扩增得到醛还原酶的基因yqhD,将其连接到表达载体pET23a(+)上,重组质粒在E.coli BL21(DE3)中得到了高效表达。经过Q-Sepharose和Sephacryl S-300两步柱层析纯化后,得到电泳条带单一的纯酶。以3-羟基丙醛为底物,测得该酶的比活力为3.8 U/mg,而以1,3-丙二醇为底物时,检测不到酶活力。该酶的最适pH为5.8,最适温度为60℃。该酶可利用多种底物,对丁醛的酶活力最高,其次是3-羟基丙醛。该酶对NADPH和NADH的Km值分别为0.07 mmol/L和1.42 mmol/L,表明它依赖辅酶的灵活性。在前期工作的基础上,构建了三个重组质粒pDK6-dhaT,pDK6-dhaT’和pDK6-yqhD,分别将三个重组质粒转化入Klebsiella pneumoniae DSM2026。在摇瓶培养实验中,甘油的初始浓度为50 g/L,构建的三株重组Klebsiella pneumoniae DSM2026(pDK6-OX)的1,3-丙二醇产量均比对照有了明显的提高。
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全文目录
摘要 4-5 Abstract 5-10 引言 10-11 1 文献综述 11-24 1.1 1,3-丙二醇的介绍 11-12 1.1.1 1,3-丙二醇的性质与应用 11 1.1.2 1,3-丙二醇的市场需求及生产状况 11-12 1.1.3 1,3-丙二醇的生产方法 12 1.2 微生物转化法生产1,3-丙二醇 12-14 1.2.1 生产菌种 12-13 1.2.2 甘油的代谢途径 13-14 1.3 基因工程菌生产1,3-丙二醇的研究 14-19 1.3.1 基因工程菌的构建策略 14-15 1.3.2 通过基因敲除的方法构建合成1,3-丙二醇的基因工程菌 15-16 1.3.3 在Saccharomyces cerevisiae中构建合成1,3-丙二醇的基因工程菌 16-17 1.3.4 在Klebsiella pneumoniae中构建合成1,3-丙二醇的基因工程菌 17-18 1.3.5 在E.coli中表达dha操纵子相关基因 18 1.3.6 在E.coli中构建利用葡萄糖合成1,3-丙二醇的基因工程菌 18-19 1.4 1,3-丙二醇生物合成途径中的关键酶 19-23 1.4.1 甘油脱水酶 19-20 1.4.2 1,3-丙二醇氧化还原酶 20-21 1.4.3 醛还原酶 21-23 1.5 本研究的目的及意义 23-24 2 1,3-丙二醇氧化还原酶的辅酶特异性改造 24-39 2.1 引言 24 2.2 实验材料和仪器 24-26 2.2.1 菌株、质粒和试剂 24-25 2.2.2 培养基 25 2.2.3 仪器 25-26 2.3 实验方法 26-31 2.3.1 Klebsiella pneumoniae基因组DNA的提取 26-27 2.3.2 1,3-丙二醇氧化还原酶基因dhaT的克隆 27-28 2.3.3 1,3-丙二醇氧化还原酶基因dhaT的定点突变 28-29 2.3.4 1,3-丙二醇氧化还原酶及其突变酶在大肠杆菌中的表达 29 2.3.5 1,3-丙二醇氧化还原酶及其突变酶的酶活力测定 29-30 2.3.6 1,3-丙二醇氧化还原酶及其突变酶的纯化 30-31 2.4 实验结果与讨论 31-38 2.4.1 1,3-丙二醇氧化还原酶基因dhaT的克隆 31-32 2.4.2 1,3-丙二醇氧化还原酶基因dhaT的定点突变 32-33 2.4.3 1,3-丙二醇氧化还原酶及其突变酶在大肠杆菌中的表达 33-34 2.4.4 1,3-丙二醇氧化还原酶及其突变酶的纯化和酶活力测定 34-38 2.5 小结 38-39 3 醛还原酶的克隆、表达与表征 39-53 3.1 引言 39 3.2 实验材料和仪器 39 3.2.1 菌株、质粒和试剂 39 3.2.2 培养基 39 3.2.3 仪器 39 3.3 实验方法 39-42 3.3.1 醛还原酶基因yqhD的克隆 39-40 3.3.2 序列测定 40 3.3.3 醛还原酶在大肠杆菌中的表达 40-41 3.3.4 醛还原酶的酶活力测定 41 3.3.5 醛还原酶的纯化与表征 41-42 3.4 实验结果与讨论 42-51 3.4.1 醛还原酶基因yqhD的克隆 42-43 3.4.2 重组质粒双酶切鉴定结果 43-44 3.4.3 测序结果 44-45 3.4.4 醛还原酶在大肠杆菌中的表达 45-46 3.4.5 醛还原酶的纯化与表征 46-51 3.5 小结 51-53 4 基因工程菌发酵甘油生产1,3-丙二醇的研究 53-69 4.1 引言 53-54 4.2 实验材料和仪器 54-55 4.2.1 菌株、质粒和试剂 54 4.2.2 培养基 54-55 4.2.3 仪器 55 4.3 实验方法 55-59 4.3.1 重组质粒的构建与双酶切检验 55-57 4.3.2 重组K.pneumoniae DSM2026(pDK6-OX)的构建及检验 57-58 4.3.3 重组K.pneumoniae DSM2026(pDK6-OX)发酵甘油生产1,3-丙二醇 58-59 4.4 实验结果与讨论 59-67 4.4.1 重组质粒的构建与双酶切检验 59-61 4.4.2 重组K.pneumoniae DSM2026(pDK6-OX)的构建及检验 61-62 4.4.3 重组K.pneumoniae DSM2026(pDK6-OX)发酵甘油生产1,3-丙二醇 62-67 4.5 小结 67-69 结论 69-70 参考文献 70-74 附录A 序列 74-75 附录B Marker 75-76 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 76-77 致谢 77-78
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中图分类: > 生物科学 > 分子生物学 > 基因工程(遗传工程)
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