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自然发酵酸粥和泡菜中芽孢杆菌的分离及16SrDNA序列分析

作　者: 王彦彦
导　师: 孙天松
学　校: 内蒙古农业大学
专　业: 食品科学
关键词: 酸粥泡菜芽孢杆菌分离鉴定 16S rDNA序列分析
分类号: TS255.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要

本研究对采集自内蒙古地区的16份酸粥样品和四川地区14份泡菜样品中的芽孢杆菌进行了分离和16S rDNA序列分析。对了解酸粥和泡菜中芽孢杆菌的组成提供了基础数据,也为进一步研究、开发和利用芽孢杆菌资源奠定了基础。酸粥和泡菜共30份样品中分离出51株芽孢杆菌,革兰氏染色呈阳性。其中从16份内蒙古酸粥样品中分离出33株芽孢杆菌,通过16S rDNA序列分析将其鉴定为9个种,分别为:Bacillus cereus (20.59%,7株)、Bacillus subtilis (20.59%,7株)、Bacillus fusiformis (15.15%,5株)、Bacillus flexus (12.12%,4株)、Bacillus licheniformis (12.12%,4株)、Bacillus pumilus (9.09%,3株)、Bacillus firmus (3.03%,1株)、Bacillus amyloliquefaciens (3.03%,1株)和Bacillus megaterium (3.03%,1株),其中Bacillus cereus和Bacillus subtilis是酸粥中芽孢杆菌的优势菌群。从14份四川泡菜样品中共分离出18株芽孢杆菌,通过16S rDNA序列分析将将其鉴定为5个种,分别为:Bacillus amyloliquefaciens(38.89%,7株)、Bacillus subtilis(22.22%,4株)、Bacillus thermoamylovorans (16.67%,3株)、Bacillus pumilus (16.67%,3株)和Bacillus megaterium(5.56%,1株),其中Bacillus amyloliquefaciens和Bacillus subtilis为泡菜中芽孢杆菌的优势菌群。Bacillus subtilis在酸粥和泡菜中所占比例较为接近,均为20%左右,且为酸粥和泡菜中芽孢杆菌的优势菌株,其他菌种所占比例各不相同。整体来说这二者中的芽孢杆菌种类丰富。

全文目录

摘要  3-4
Abstract  4-8
1 引言  8-15
  1.1 酸粥  8-9
  1.2 泡菜  9
  1.3 芽孢杆菌  9-14
    1.3.1 芽孢杆菌作为益生菌的作用  10-11
    1.3.2 芽孢杆菌作为益生菌的应用及研究进展  11-14
  1.4 16S rDNA 序列分析  14
  1.5 本课题研究的内容、目的和意义  14-15
2 材料与方法  15-19
  2.1 试验材料  15-16
    2.1.1 样品来源  15
    2.1.2 培养基及试剂  15
    2.1.3 仪器与设备  15-16
  2.2 试验方法  16-19
    2.2.1 酸粥和泡菜样品的采集  16
    2.2.2 酸粥和泡菜样品中芽孢杆菌的分离、纯化和保存  16-17
    2.2.3 芽孢杆菌的16S rDNA 序列分析  17-19
3 结果与分析  19-39
  3.1 样品采集结果分析  19-22
  3.2 酸粥和泡菜中芽孢杆菌的分离纯化结果  22
  3.3 芽孢杆菌的菌落形态和菌体细胞形态观察结果  22
  3.4 芽孢杆菌的16S rDNA 序列分析结果  22-33
    3.4.1 基因组DNA 的提取结果  22-23
    3.4.2 16S rDNA 的扩增及检测结果  23
    3.4.3 16S rDNA 同源性分析  23-33
  3.5 16S rDNA 序列的系统发育分析  33-39
    3.5.1 分离自内蒙古酸粥中芽孢杆菌的16S rDNA 系统发育树  33-36
    3.5.2 分离自四川泡菜中芽孢杆菌的16S rDNA 系统发育树  36-37
    3.5.3 51 株芽孢杆菌中不同种的16S rDNA 系统发育树  37-39
4. 结论  39-41
致谢  41-42
参考文献  42-49
附录  49-52
作者简介  52

自然发酵酸粥和泡菜中芽孢杆菌的分离及16SrDNA序列分析

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