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利用SSR标记构建杂交水稻品种DNA指纹数据库

作　者: 肖子发
导　师: 詹庆才
学　校: 中南大学
专　业: 植物学
关键词: 杂交水稻遗传多样性 DNA指纹库品种特异性
分类号: S511
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

杂交水稻新品种作为种业发展的基础,无论是在质量和数量上,都得到突飞猛进的发展,但由于技术的限制,现实中各种品种侵权现象屡见不鲜。为了解决这一问题,本研究利用前期建立的一套杂交水稻品种DNA指纹检测体系,对2001-2008年湖南省主要的杂交水稻品种43个、2009-2011年湖南省区试杂交水稻品种140个、其他省份应用较广泛的杂交稻品种130个进行了DNA指纹检测。主要研究结果如下：根据带型清晰,多态性高,基因组分布均衡原则,筛选确定了用于DNA指纹数据库构建的48对SSR引物；构建了313个杂交水稻品种×48个SSR标记的DNA指纹图谱数据库,为进一步规范和完善湖南省杂交水稻品种区试、审定及管理工作提供技术支持。利用48对SSR引物分析了从2009年到2011年参与湖南省品种审定的杂交稻组合的相似系数,对2009-2011年的140个杂交水稻品种的遗传多样性进行了聚类(系谱)分析。其中,2009年杂交组合间的平均遗传相似系数是0.725,变幅为0.47-0.98,2010年的平均遗传相似系数是0.69,变幅为0.53-0.85,2011年的平均遗传相似系数是0.695,变幅为0.56-0.83。聚类分析显示,本研究中的水稻品种种质资源遗传多样性相对狭窄,杂交稻的遗传育种基础需要进一步拓宽。本研究构建的数据库具有品种的广泛代表性和容量的无限扩展性,技术先进准确且易标准化。为了充分共享该研究成果,已将数据库公布到因特网上

全文目录

摘要  4-5
ABSTRACT  5-8
第一章综述  8-17
  1.1 前言  8-9
  1.2 水稻遗传多样性的研究现状  9-10
  1.3 农作物品种指纹数据库的构建及应用  10-17
    1.3.1 蛋白质电泳图谱及同工酶的应用  11-12
    1.3.2 DNA指纹图谱及SSR标记的优点  12-16
      1.3.2.1 特异标记法阶段  13-15
      1.3.2.2 标记组合法阶段  15-16
    1.3.3 指纹数据库的应用前景  16-17
第二章利用SSR标记构建杂交水稻品种DNA指纹数据库  17-33
  2.1 材料与方法  17-18
    2.1.1 杂交水稻材料  17
    2.1.2 全基因组DNA提取  17
    2.1.3 SSR标记筛选  17-18
    2.1.4 PCR扩增和PCR产物电泳  18
    2.1.5 图片处理和统计  18
  2.2 结果与分析  18-32
    2.2.1 供试引物的确定  18-19
    2.2.2 带型记录和图片处理  19
    2.2.3 单个品种的DNA指纹  19-21
    2.2.4 2001-2008年通过湖南省审定的43个杂交稻品种的DNA指纹数据  21-22
    2.2.5 2009年通过湖南省审定的50个杂交稻品种DNA指纹  22-25
    2.2.6 2010年和2011年参加湖南省区试的杂交稻品种DNA指纹  25-28
    2.2.7 DNA指纹数据库的构建和特征  28
    2.2.8 2009-2011年湖南省审定的杂交稻组合的遗传多样性分析  28-32
  2.3 讨论  32-33
第三章全文结论  33-34
参考文献  34-40
附录  40-48
致谢  48-49
攻读学位期间主要的研究成果目录  49

利用SSR标记构建杂交水稻品种DNA指纹数据库

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