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猪10号染色体上部分免疫性状QTLs扫描

作　者: 蔡绍倩
导　师: 陈宏权；张勤；殷宗俊
学　校: 安徽农业大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 猪微卫星 QTL定位免疫性状抗病育种
分类号: S828
类　型: 硕士论文
年　份: 2008年
下　载: 35次
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内容摘要

本试验以7头大白公猪、33头大白母猪;5头长白公猪、15头长白母猪、4头松黑猪公猪和15头松黑母猪为基础群组建的混合家系,选择子代个体366头。35日龄采血,测定并记录血液常规18项指标;选取13个微卫星位点进行PCR扩增,判定基因型:用最小二乘线性模型对免疫性状进行QTL区间定位,利用置换法(permutation)确定显著性阈值。研究结果如下:1.13个标记在群体中绝大多数的微卫星属于中度多态的遗传标记。所有微卫星标记在三个品种中的平均等位基因数为3.1754,平均杂合度为0.5215,平均多态信息含量为0.5999,平均香农指数为1.3222。从分子标记的信息量上看,可以满足连锁图谱构建和QTL定位的要求。2.用CRIMAP软件进行资源家系群体10号染色体遗传连锁图谱的构建,染色体长度为314.2cM。与USDA-MARC图谱相比图谱较长,主要是标记间的间距变大,标记的排列顺序与USDA-MARC图谱尚有一定差距。3.达到了染色体极显著水平的4个QTL(p＜0.01),分别影响着红细胞压积(HCT)、血红蛋白计数(HGB)、平均红细胞血红蛋白量(MCH)和红细胞分布宽度(RDW)。影响平均红细胞体积(MCV)的QTL达到染色体显著水平(p＜0.05)。定位的QTL依次集中在97cM-98cM和127cM-128cM区域,临近的标记分别为:PIP5K2、SW951、SY30和SW2067。各种性状的QTL位置具有一定的规律性,相关比较紧密的性状往往定位在染色体上相同或邻近的区间内。这提示我们这些QTL之间可能存在一因多效或基因互作。

全文目录

摘要  4-5
ABSTRACT  5-8
文献综述  8-19
1 引言  19-20
2 材料与方法  20-29
  2.1 试验材料  20-23
  2.2 实验步骤  23-29
3 结果与分析  29-36
  3.1 基因组DNA提取结果  29
  3.2 微卫星基因型的检测  29-30
  3.3 微卫星群体遗传参数评估  30-31
  3.4 微卫星遗传图谱的绘制  31-32
  3.5 个体血液生化指标的统计  32-33
  3.6 血液生化指标的QTL定位  33-36
4 讨论  36-41
  4.1 关于基因组扫描结果  36-37
  4.2 关于微卫星分型和数据导出  37-38
  4.3 关于遗传图谱的构建  38
  4.4 关于血液生化指标的测定的结果  38-39
  4.5 关于猪10号染色体QTL定位的结果  39-41
5 结论  41-42
参考文献  42-47
致谢  47-48
作者简介  48

猪10号染色体上部分免疫性状QTLs扫描

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