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CCKAR基因多态性及其与猪部分经济性状关联性研究

作　者: 谭岳华
导　师: 黄生强
学　校: 湖南农业大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 猪 CCKAR基因 SNP 生长性状肉质性状
分类号: S828
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
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内容摘要

本试验以9个猪品种/群(5个地方品种:宁乡猪、大围子猪、沙子岭猪、桃源猪、五指山猪;3个外来品种:大白猪、长白猪、杜洛克猪;1个杜长大杂交品种)共计687头猪为研究对象,采用PCR-RFLP方法分析了CCKAR基因+179A/GHpy8Ⅰ酶切位点和+471C/G SatJ酶切位点的基因频率和基因型频率,并进行了Hardy-Weinberg平衡检验。同时,结合生长、屠宰性能资料,分析研究了CCKAR基因+179A/G位点和+471C/G位点不同基因型对部分生长性状和肉质性状的影响。主要结果如下:1猪CCKAR基因+179A/G位点1.1(1)在所有猪种群体中,CCKAR基因+179A/G Hpy8Ⅰ酶切位点均存在较丰富的遗传多态性,除宁乡猪中没检测到AA基因型个体外,其他品种中都检测到AA、AG、GG三种基因型个体的分布;(2)在所检测的9个品种中,GG型基因型为优势基因型,AA基因型在各品种中分布较少;(3)无论是在地方猪种、外来品种还是杂交品种中,等位基因G都是优势基因,外来品种中G等位基因频率都比地方品种中G等位基因频率低:1.2生长性状上,(1)杜洛克、大白猪和长白猪在达100kg体重日龄性状上,GG基因型个体与AA基因型个体间差异显著(P＜0.05),GG基因型个体比AA基因型个体分别低:5.79%、4.81%、4.72%;(2)在生长性能指数性状指标上,在杜洛克猪和大白猪中,显著性检验GG基因型个体与AA基因型个体间(P＜0.05);(3)另外在杜洛克猪中,GG基因型个体活体平均背膘厚明显低于AA基因型个体(P＜0.05):由此可见,CCKAR基因+179A/G位点上,等位基因G对生长具有正效应;1.3肉质性状上,(1)杜洛克、大白猪和长白猪在肉色等级和大理石纹等级性状上,各基因型之间呈现一定的规律性,其总的趋势AA＞AG＞GG,说明等位基因A对提高肉色等级和大理石纹等级有一定的作用,但作用不明显(P＞0.05);(2)在失水率性状上,大白猪和杜长大猪中AA基因型个体比GG基因型个体分别低11.42%、12.84%,两基因型间差异显著(P＜0.05);(3)在贮存损失性状上,在杜洛克、大白和长白猪中,GG基因型个体比AA基因型个体分别高39.68%、27.87%、46.84%(P＜0.05),选择CC基因型能明显降低贮存损失;因此,该位点A等位基因很可能是猪肉质性状的一个有利等位基因;2猪CCKAR基因+471C/G位点2.1(1)在所有猪种群体中,CCKAR基因+471C/G SatⅠ酶切位点都检测到了CC、CG、CG基因型个体的分:布,其中CG基因型个体分布占多数,CG基因型为优势基因型;(2)在该位点上的C、G等位基因频率相差不大,在地方猪种中,等位基因C为优势基因;在外来品种和杂交品种中,等位基因G为优势基因;(3)所有品种多态信息含量都处于0.25到0.5之间,说明在该位点上各品种具有较丰富的遗传多态性,且遗传变异较大。2.2生长性状上,(1)在杜洛克、大白和长白三个外来品种中,在达100kg体重日龄性状和生长性能指数性状上,GG基因型明显优于从基因型(P＜0.05);(2)在大白猪中,在校正活体平均背膘厚性状上,显著性检验GG基因型个体与从基因型个体间差异显著(P＜0.05);总体来看,在CCKAR基因+471C/G位点上,杜洛克猪、大白猪和长自猪在达100kg日龄、活体平均背膘厚、校正活体平均背膘厚和生长性能指数上都表现出GG基因型优于AA基因型的趋势。等位基因G是影响猪生长的一个有利基因,增加G等位基因的基因频率,将有利用提高猪的生长速度:2.3肉质性状上,(1)肉色等级性状上,在杜洛克猪和大白猪中,CC基因型个体均值都比GG基因型个体均值,其中杜洛克猪中CC基因型比GG基因个体均值高16.12%、比CG基因型个体高8.56%,显著性检验在此两个品种中CC基因型个体与GG基因型个体之间差异显著(P＜0.05),长白猪和杜长大猪中存在一定差异,但差异不显著;(2)大理石纹等级上,三个外来品种基因型间大理石纹等级总体趋势是AA＞AG＞GG,其中在大白猪和长白猪中,CC基因型个体与GG基因型个体问达到显著水平(P＜0.05);(3)pH值性状上,在长白猪中,显著性检验CC基因型个体与GG基因型个体差异显著(P＜0.05);因此,CCKAR基因+471C/G位点不同基因型与猪部分肉质的相关说明了该位点可能是一个与肉色等级和大理石纹等级相关的分子标记。本研究结果表明,CCKAR基因有望成为猪的生长性状和肉质性状的一个候选基因或分子标记,为生长速度快、肉质优良的猪的选育提供一种分子育种途径。

全文目录

摘要  4-6
Abstract  6-11
第一部分文献综述  11-20
  1 前言  11
  2 国内外研究进展  11-18
    2.1 生长性状主基因研究进展  11-13
    2.2 肉质性状主基因研究进展  13-14
    2.3 CCK及CCKR的研究进展  14-15
    2.4 CCKR的研究现状  15-18
  3 研究目的与意义  18-20
第二部分材料与方法  20-26
  1 材料  20-21
    1.1 试验用猪  20
    1.2 主要仪器和设备  20
    1.3 主要药品和试剂  20
    1.4 试剂配制  20-21
    1.5 PCR扩增引物的合成  21
  2 实验方法  21-26
    2.1 猪基因组DNA的提取  21-22
    2.2 基因组DNA的浓度测定和质量检测  22
    2.3 猪CCKAR基因不同位点的PCR扩增  22-23
    2.4 扩增产物的酶切  23-24
    2.5 琼脂糖凝胶电泳  24
    2.6 聚丙烯酰胺凝胶电泳  24
    2.7 基因型分析  24-25
    2.8 统计分析方法  25-26
第三部分结果与分析  26-41
  1 CCKAR基因多态性及不同SNP位点遗传结构分析  26-31
    1.1 CCKAR基因+179A/G位点的扩增和PCR-RFLP结果  26-27
    1.2 CCKAR+471C/G位点的扩增和PCR-RFLP结果  27-28
    1.3 猪CCKAR基因不同位点的遗传结构分析  28-31
  2 猪CCKAR基因不同位点对猪部分生长性状的影响  31-35
    2.1 CCKAR基因+179A/G位点对猪部分生长性状的影响  32-33
    2.2 CCKAR基因+471C/G位点对猪部分生长性状的影响  33-35
  3 猪CCKAR基因不同位点对猪部分肉质性状的影  35-41
    3.1 CCKAR基因+179A/G位点对猪部分肉质性质的影响  36-38
    3.2 CCKAR基因+471C/G位点对猪部分肉质性状的影响  38-41
第四部分讨论与结论  41-50
  1 猪CCKAR基因不同SNP位点的遗传结构与分析  41-42
    1.1 猪CCKAR基因+179A/G位点的遗传结构分析  41-42
    1.2 猪CCKAR+471C/G位点的遗传结构分析  42
  2 CCKAR基因不同SNP位点对猪部分生长性状的遗传效应  42-45
    2.1 CCKAR基因+179A/G位点对猪部分生长性状的遗传效应  43-44
    2.2 CCKAR基因+471C/G位点对猪部分生长性状的遗传效应  44-45
  3 CCKRA基因不同SNP位点对猪部分生长性状的遗传效应  45-50
    3.1 CCKRA基因+179A/G位点对猪部分肉质性状的遗传效应  46-47
    3.2 CCKAR基因+471C/G位点对猪部分肉质性状的遗传效应  47-50
参考文献  50-55
致谢  55-56
作者简介  56

CCKAR基因多态性及其与猪部分经济性状关联性研究

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