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拟南芥转录因子AtMYB44在细菌信号分子-N酰基高丝氨酸内酯调控根生长中的作用
作 者: 李曼
导 师: 宋水山
学 校: 河北工业大学
专 业: 生物化工
关键词: N-酰基高丝氨酸内酯(AHLs) 拟南芥 AtMYB44基因 防卫反应
分类号: Q943.2
类 型: 硕士论文
年 份: 2013年
下 载: 4次
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内容摘要
细菌通过分泌一种或者几种小分子的化学信号分子相互交流,协调群体行为,这一现象被称为群体感应(QuorumSensing,QS)。革兰氏阴性细菌利用N-酰基高丝氨酸内酯(N-acyl-homoserinelactones,AHLs)作为QS信号分子。细菌利用QS系统调节体内许多生物学功能,如共生现象、毒力作用、生物发光、孢子的产生、生物膜形成、生物群游现象和质粒接合与转移等。近年来研究结果表明,AHLs能够调控植物根的生长和发育,但是,植物是如何感知这些细菌信号还知之甚少,因此研究AHLs在植物中的信号通路是十分必要的。在植物生长发育和胁迫反应中,转录因子在调控基因表达中发挥重要的作用。AtMYB44归属于拟南芥中的R2R3-MYB亚基22转录因子家族。本次研究中,我们用1μMN-3-羰基己酰基高丝氨酸内酯(N-3-oxo-hexanoyl-homoserinelactone,3OC6-HSL)或10μMN-3-羰基辛酰基高丝氨酸内酯(N-3-oxo-octanoyl-homoseringlactone,3OC8-HSL)处理拟南芥后,以不用AHLs处理的拟南芥作为对照,分别与拟南芥29K基因组表达谱芯片进行杂交,从芯片结果中我们发现,AtMYB44基因在两种信号分子处理的情况下都有所上调,通过real-timePCR验证,我们发现qRT-PCR实验结果和芯片结果一致。从文献出我们发现AtMYB44基因可能参与了AHLs调控拟南芥根伸长的作用。用1μM3OC6-HSL或10μM3OC8-HSL处理拟南芥后,AHLs对野生型拟南芥主根的伸长有明显的促进作用,而这种促进作用在atmyb44突变体上完全消失,在转基因的过表达AtMYB44植株上这种促进作用被显著地放大。我们发现,3OC6-HSL和3OC8-HSL两种信号分子不仅能够诱导AtMYB44基因的表达还诱导一些和生长素、细胞分裂素相关的基因表达。实验结果表明,AtMYB44基因在AHLs调控拟南芥主根伸长通路中发挥重要的作用。以往研究证明,转录因子AtMYB44在植物防卫反应的过程中起重要作用,我们分析了AtMYB44转录因子在AHLs调控拟南芥对胡萝卜软腐欧文氏菌E.carotovorasubsp.carotovora(简称Ecc)基本防卫中的作用。实验结果表明,转录因子AtMYB44参与AHLs介导的抑制拟南芥抗Ecc过程,并且对于拟南芥抗病是负向调控作用。
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全文目录
摘要 4-5 ABSTRACT 5-10 第一章 绪论 10-24 §1-1 细菌的群体感应系统 10-11 §1-2 基因芯片技术 11-15 1-2-1 基因芯片技术概念和原理 11 1-2-2 基因芯片技术分类和主要技术流程 11-13 1-2-3 基因芯片的发展 13-14 1-2-4 基因芯片的应用及前景 14-15 §1-3 植物的转录因子和MYB蛋白 15-19 1-3-1 植物的转录因子结构特征 15-16 1-3-2 植物MYB转录因子 16-17 1-3-3 植物MYB蛋白的DNA结合位点 17-18 1-3-4 植物MYB蛋白DNA结合的特性 18-19 §1-4 植物的防卫反应 19-22 1-4-1 植物防卫信号的识别 19-20 1-4-2 参与植物防卫反应的信号分子 20 1-4-3 植物防御反应信号转导途径拮抗及协同作用 20-21 1-4-4 大白菜软腐病菌的研究现状 21-22 §1-5 课题的意义 22-24 第二章 生物信息学分析拟南芥表达谱芯片杂交数据 24-32 §2-1 材料 24-26 2-1-1 供试植物 24 2-1-2 引物 24 2-1-3 试剂 24 2-1-4 仪器设备 24-25 2-1-5 培养基及营养液 25-26 §2-2 方法 26-29 2-2-1 拟南芥的种植 26 2-2-2 AHLs处理拟南芥幼苗 26 2-2-3 植物总RNA的提取 26-27 2-2-4 芯片分析 27 2-2-5 RT-PCR与cDNA的合成 27-28 2-2-6 RealTimePCR检测基因的表达 28-29 §2-3 结果 29-30 2-3-1 real-timePCR验证基因芯片结果 29-30 §2-4 小结 30-32 第三章 AtMYB44在N-酰基高丝氨酸内酯调控拟南芥根生长过程中的作用 32-44 §3-1 材料 32-34 3-1-1 供试植物 32 3-1-2 引物 32 3-1-3 试剂 32-33 3-1-4 仪器设备 33-34 3-1-5 培养基及营养液 34 §3-2 方法 34-35 3-2-1 拟南芥的种植 34 3-2-2 AHLs处理拟南芥幼苗 34 3-2-3 植物总RNA的提取 34 3-2-4 RT-PCR与cDNA的合成 34 3-2-5 拟南芥主根长度的测定 34-35 3-2-6 RealTimePCR检测基因的表达 35 §3-3 结果 35-42 3-3-1 AHLs对不同基因型拟南芥主根生长的影响 35-36 3-3-2 AHLs对拟南芥AtMYB44基因表达的影响 36-37 3-3-3 AHLs通过AtMYB44调控与细胞分裂素相关ARR15、ARR4、CYCB2基因的表达 37-40 3-3-4 AHLs通过AtMYB44调控与生长素相关IAA14、IAA7、MAX2基因的表达 40-42 §3-4 小结 42-44 第四章 转录因子AtMYB44与AHLs调控拟南芥对Ecc的抗病分析 44-50 §4-1 材料 44-46 4-1-1 供试菌株植株及植物 44 4-1-2 主要试剂 44-45 4-1-3 仪器设备 45 4-1-4 培养基 45-46 §4-2 方法 46-47 4-2-1 拟南芥的种植 46 4-2-2 AHLs处理拟南芥幼苗 46 4-2-3 菌种的活化培养 46 4-2-4 植物病原菌接种及抗病性评价 46-47 §4-3 结果 47-49 §4-4 小结 49-50 第五章 结论 50-52 参考文献 52-56 致谢 56-58 攻读学位期间所取得的相关科研成果 58
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中图分类: > 生物科学 > 植物学 > 植物细胞遗传学 > 植物基因工程
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