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烟草CONSTANS同源基因的克隆与分析
作 者: 陆莹
导 师: 王志德
学 校: 中国农业科学院
专 业: 作物种质资源学
关键词: 烟草 CO同源基因 NtCO克隆 表达模式
分类号: S572
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
开花是植物从营养生长阶段转变到生殖阶段的关键环节,植物通过对环境信号以及内源信号的应答途径构成了一个调控网络,控制着花期的转变,这一调控网络对植物适应环境以及传宗接代具有决定性的重要意义。由光、日长和生理钟介导的光周期途径驱动了植物花期的转变,CONSTANS(CO)基因是光周期途径中的关键基因之一。CO可以激活FT基因的表达,产生成花素FT蛋白来促进开花。CO基因编码一个在N端有2个锌指结构域(B-box)和在C端有1个CCT结构域的转录因子。CO基因受日照长度和生物钟调控,表达量在一天之内呈节律性变化。本研究主要的实验结果如下:(1)烟草CO同源基因的克隆利用马铃薯StCO基因序列和茄科基因组数据库设计引物,应用RACE技术从短日照烟草品种Kutsaga. Mammoth10(Nicotiana tabacum cv. Kutsaga Mammoth10)中克隆到3个CO同源基因,并命名为NtCO1、NtCO2和NtCO3。(2)烟草CO同源基因序列分析通过生物信息学方法的分析发现,其编码的蛋白均含有2个保守的结构域—B-box锌指结构域和CCT结构域。经同源性比对和构建系统发育树分析发现,NtCO1、 NtCO2和NtCO3基因同拟南芥和其他植物中CO基因具有同源性,同茄科的马铃薯StCO和番茄SlCO一致性最高,进化距离最短。NtCO1、NtCO2属于CO家族第I亚组,NtCO3属于CO家族第III亚组。(3)烟草NtCO1表达模式分析通过组织器官特异性表达分析发现,NtCO1基因mRNA在叶片中优势表达,茎中次之,根中最弱,且在现蕾期和营养生长中期的表达量明显高于幼苗期。Real Time PCR检测发现NtCO1基因的表达呈现昼夜节律性,并且这种表达模式受日照长度的调节。本文结果为烟草开花途径分子机理的研究、烟草种质资源创新和分子育种提供了重要的依据。
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全文目录
摘要 6-7 Abstract 7-12 第一章 前言 12-20 1.1 高等植物开花概述 12-15 1.1.1 光周期途径 12 1.1.2 春化作用途径 12-14 1.1.3 自主途径 14 1.1.4 赤霉素途径 14 1.1.5 植物开花途径的互作 14-15 1.2 植物 CO 家族基因的特性 15-17 1.2.1 CO 基因的由来及家族成员 15 1.2.2 CO 蛋白的结构和类型 15-16 1.2.3 CO 基因的功能 16-17 1.2.4 CO 的表达与调控 17 1.3 光周期促进烟草开花研究进展 17-18 1.3.1 烟草概况 17-18 1.3.2 烟草的光周期与开花 18 1.4 本研究的目的意义 18-20 第二章 烟草 CO 同源基因克隆与分析 20-42 2.1 材料与试剂 20 2.1.1 实验材料及处理 20 2.1.2 实验所用试剂 20 2.2 实验方法和步骤 20-29 2.2.1 总 RNA 提取前准备工作 20-21 2.2.2 总 RNA 提取操作步骤 21 2.2.3 总 RNA 纯度检测 21-22 2.2.4 中间片段的克隆 22-24 2.2.5 中间片段的序列分析 24 2.2.6 3’RACE 与 5’RACE 24-29 2.3 结果与分析 29-40 2.3.1 总 RNA 的提取 29 2.3.2 中间片段的克隆 29-31 2.3.3 RACE 扩增结果与分析 31-40 2.4 讨论 40-42 2.4.1 RNA 的提取 40 2.4.2 RACE 获得基因全长 40-41 2.4.3 CO 家族成员与功能 41-42 第三章 烟草 NtCO1 基因的表达分析 42-49 3.1 NtCO1 时空表达分析 42-44 3.1.1 实验材料准备和试剂 42 3.1.2 实验方法与步骤 42-44 3.2 NtCO1 昼夜节律表达分析 44-46 3.2.1 材料、试剂和仪器 44-45 3.2.2 实验方法与步骤 45-46 3.3 结果与分析 46-48 3.3.1 NtCO1 时空表达分析 46 3.3.2 NtCO1 昼夜节律表达分析 46-48 3.4 讨论 48-49 第四章 全文结论 49-51 参考文献 51-57 附录 57-59 致谢 59-60 作者简历 60
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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 经济作物 > 烟草(菸草)
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