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中国普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)的遗传多样性及其保护研究

作 者: 杨庆文
导 师: 孙其信
学 校: 中国农业大学
专 业: 作物遗传育种
关键词: 普通野生稻 遗传多样性 原位保护 异位保护
分类号: S511.9
类 型: 博士论文
年 份: 2004年
下 载: 345次
引 用: 1次
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内容摘要


原位保护和异位保护是野生稻种质资源安全保存相互补充的两种方式,对这两种保护方式中涉及的生物学问题进行研究对于制定相应的保护策略具有非常重要的指导意义。本论文利用分子标记和常规调查相结合的方法,对我国异位保存野生稻遗传多样性的代表性、异位保存取样策略、原生境保护点野生稻的遗传多样性以及每个保护点的保护策略和技术等保护生物学基础问题进行了探讨。结果如下: 一、以原、异位保护都较完整的江西省东乡县2个居群的原、异位群体为材料,利用30对水稻SSR引物进行了遗传多样性比较研究。结果表明,庵家山居群原、异位保存群体的遗传多样性指数分别为0.5000和0.3555,异位群体的遗传多样性远远小于原位群体,并在聚类图中仅为原位保护材料中的一个分支,说明该异位保存群体由于保存数量太少而不能代表原居群的遗传多样性;虽然水桃树居群原、异位群体的遗传多样性指数分别为0.4100和0.4577,相差较小,但异位保存群体中约40%的相连序号聚集在一起,为重复样本,也不能代表整个居群的遗传多样性。据此认为,异位保存的庵家山和水桃树野生稻遗传资源都不能反映原居群遗传多样性的完整性,进而推测我国保存的普通野生稻资源所包含的遗传变异相对较少,建议进行普通野生稻遗传资源的再收集。 二、以选择取样数目超过50株的5个自然居群为对象,将每个居群所有样品按5的倍数分别随机取样,重复10次,计算每次取样利用SSR所检测的平均等位变异数,并以该居群总的等位变异数为基数,计算等位变异出现的频率,以取样数和频率对应值绘制曲线图。结果表明,如果以曲线图中的拐点为取样值,则5个居群的取样范围为10~30株,而相应的等位变异比率为87.0%~95.1%;如果以等位变异比率90%和95%为临界值确定取样数目,则取样范围分别为15~25株和30~40株。 三、利用30对引物对全国7个普通野生稻原生境保护点的样品进行遗传多样性分析,共检测出150个等位变异,每个位点平均5.4个。7个居群遗传多样性指数从大到小顺序排列为:广东(0.5130)>海南(0.4692)>广西(0.3860)>湖南(0.3520)>江西(0.3485)>福建(0.3154)>云南(0.1444)。在广东、广西、湖南、江西4个居群中,完全按照由南到北的顺序排列,即随着纬度的增加,遗传多样性降低。因此,进一步确认了华南是我国普通野生稻的遗传多样性中心的论点;7个居群在聚类图上完全独立成群,居群之间的个体没有任何交叉,说明7个居群都应保护,选择的保护点是合理的:7个居群中,只有云南居群周围从未种植过栽培稻,而云南居群的遗传多样性远远低于其它6个居群,证实了栽培稻的基因流对普通野生稻遗传多样性具有重要影响的论点。 四、通过SSR遗传多样性分析,选择江西东乡、云南元江和广东高州3个保护点的普通野生稻进行居群遗传分化研究。结果表明,无论是自然隔离还是人工隔离,当隔离时间超过20年,自然群体之间就存在遗传分化,隔离时间越长,遗传分化越显著。说明小生境的变化对普通野生稻的居群遗传分化产生着重要影响。

全文目录


摘要  4-9
第一章 绪论  9-21
  1 立题的意义  9-10
  2 国内外研究现状  10-20
    2.1 稻属的分类和亚洲栽培稻起源研究  10-15
    2.2 分子标记及其在野生稻遗传多样性研究中的应用  15-19
    2.3 植物遗传资源保护技术研究进展  19-20
  3 研究目的  20-21
第二章 原、异位保存的普通野生稻种质资源遗传多样性比较研究  21-28
  1 材料和方法  21-23
    1.1 供试材料  21-22
    1.2 分析方法  22-23
  2 结果与分析  23-26
    2.1 庵家山分布点原、异位保存的野生稻遗传多样性  23-24
    2.2 水桃树分布点原、异位保存的野生稻遗传多样性  24-26
  3 讨论  26-28
    3.1 我国异位保存的普通野生稻资源所包含的遗传变异较低,必须进行再次收集  26-27
    3.2 原生境保护有利于丰富普通野生稻的遗传多样性  27-28
第三章 普通野生稻异位保护取样策略研究  28-36
  1 材料与方法  29
    1.1 居群的选择  29
    1.2 取样方法  29
    1.3 分析方法  29
  2 结果与分析  29-34
    2.1 五个居群SSR多态位点和等位变异频率比较  29-30
    2.2 取样点的空间布局  30
    2.3 取样数目与遗传多样性的关系  30-34
  3 结论与讨论  34-36
    3.1 野生稻异位保存最佳取样数目的确定  34
    3.2 野生稻居群内取样的空间样式  34-35
    3.3 根据经验数据制定取样策略的可靠性  35-36
第四章 全国普通野生稻的遗传多样性分布特点与原生境保护的选点原则  36-45
  1 材料与方法  37
    1.1 实验材料  37
    1.2 研究方法  37
    1.3 数据处理  37
  2 结果与分析  37-40
    2.1 全国普通野生稻居群的遗传多样性分析  37-39
    2.2 全国7个普通野生稻居群的聚类分析  39-40
  3 结论与讨论  40-45
    3.1 华南地区是我国普通野生稻的遗传多样性中心  40
    3.2 北缘居群属于生境片断化形成的小种群,保护意义重大  40-43
    3.3 栽培稻基因流对普通野生稻遗传多样性的影响  43
    3.4 生境恢复与种质回归拯救福建漳浦野生稻  43
    3.5 我国普通野生稻原生境保护点的选点的合理性  43-45
第五章 特殊地区普通野生稻的居群遗传分化研究  45-65
  第一节 东乡普通野生稻自然群体的遗传分化关系  45-53
    1 材料和方法  45-46
      1.1 供试材料  45-46
      1.2 方法  46
    2 结果与分析  46-51
      2.1 庵家山保护点野生稻的遗传分化关系  46-49
      2.2 庵家山和水桃树2个保护点野生稻的遗传分化  49-51
    3 结论与讨论  51-53
      3.1 小生境变化对居群遗传结构的影响  51-52
      3.2 东乡野生稻的保护策略  52-53
  第二节 云南元江普通野生稻自然群体的遗传分化关系  53-58
    1 材料和方法  53-54
      1.1 供试材料  53-54
      1.2 方法  54
    2 结果与分析  54-56
      2.1 云南元江野生稻的遗传多样性  54
      2.2 聚类分析  54-55
      2.3 居群间和居群内的遗传多样性分析  55-56
    3 讨论  56-58
  第三节 广东高州普通野生稻的居群分类与保护技术  58-64
    1 材料与方法  58-59
      1.1 实验材料  58-59
      1.2 研究方法  59
    2 结果与分析  59-62
      2.1 高州野生稻的遗传多样性分析  59-61
      2.2 聚类分析  61-62
    3 结论与讨论  62-64
      3.1 利用居群聚类结果选择代表性材料的可靠性  62
      3.2 高州野生稻的居群分类和保护策略  62-64
  第四节 特殊地区普通野生稻居群遗传结构的相似性  64-65
第六章 全文结论与展望  65-67
参考文献  67-76
致谢  76-77
附录  77-107
作者简介  107

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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 禾谷类作物 > > 野生稻
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