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国内分离的致肾盂肾炎大肠埃希菌papA和papG基因分型的研究

作 者: 吴庆刚
导 师: 陈锦英
学 校: 天津医科大学
专 业: 病原生物学
关键词: 致肾盂肾炎大肠埃希菌 粘附 papa papG 基因分型
分类号: R378
类 型: 博士论文
年 份: 2003年
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内容摘要


尿路感染是一种常见病、多发病,大肠埃希菌为其主要致病菌,导致上行性尿路感染的大肠埃希菌大多具有P菌毛,称为致肾盂肾炎大肠埃希菌(UPEC)。编码P菌毛的粘附基因群(pap)位于UPEC的染色体上,由11个基因组成,其中papA编码P菌毛的主要菌毛结构亚单位,papG编码P菌毛尖端与尿道上皮细胞表面受体Gal-Gal结合的真正粘附素。近年来,UPEC papA和papG因在P菌毛组成和粘附致病中的重要作用而成为研究的焦点,尤其对papA和papG的基因分型研究在UPEC的流行病学、致病机理、遗传变异和免疫防治研究中的作用在国外越来越引起人们的关注,国内尚处于空白。 首先,本研究建立了UPEC papC PCR的方法,在其扩增片段内设计了PstⅠ内切酶位点,可用于PCR产物的鉴定,提高该方法的特异性。采用上述方法对国内分离的147株尿源性大肠埃希菌进行检测,UPEC菌株检出率为31.98%(47/147株)。与血凝试验相比较,两种方法检测结果无明显差异(P>0.05)。继而采用多重PCR方法对45株UPEC菌株分别进行了papA和papG的基因分型,探讨国内UPEC菌株的papA和papG的基因组合形式。结果显示,45株UPEC papG的基因型均为Ⅱ型,与国外报道显著不同。其中44株(97.8%)papA基因分型结果阳性,1株(2.2%)papA结果阴性,预示为新的papA基因型。44株UPEC papA分型结果表天津医科大学博士学位论文明,24株(54.55%)具有l个基因型,13株(29.55%)具有2个基因型,4株(9 .09%)和3株(6名2%)分别具有3个和4个基因型。单一基因型较常见的为F7一2(25.00%)、Fll(6.82%)和F16(9.09%)。受试菌株各种基因型出现的频次,优势基因型依次为:F10和F13各12株(2727%)、F7一2和Fll各11株(25.00%)、F14 10株(22.72%)和F169株(20.45%);具有2个以上基因型的组合形式与国外不同,并首次发现了4个基因型(FS+Fg+F13+F14)组合的UPEC菌株。表明国内UPEC菌株存在p即A的多态性。 同时,采用PCR克隆的方法对papA多重PCR不能分型的uPEc 4030株的papA和p即G基因克隆和序列分析,结果显示,papA由720个核普酸组成,编码192个氨基酸的多肤。与国外报道的10个基因型的papA核普酸序列和推导氨基酸序列同源性比较,分别为36.n一77.95%和21.11一78.34%;与p即A基因分型多重pCR引物比较,uPEC403o在各基因型下游引物相应位置序列同源性仅为10一“.67%,表明该菌株paPA确实为新基因型,并验证了p即A基因分型方法的可靠性。砷Ec4030与天津地区曾报道UPEC 132(F13型)paPA核普酸和推导氨基酸序列比较,其同源性分别为49.70%和46.18%,变异部位主要出现在可变区和Cys一Cys区;但p即G均为n型,其核昔酸和推导氨基酸序列同源性分别为98.89%和99.01%。 综上所述,国内分离UPEC菌株paPG高度保守;而p即A呈现高度多态性,并出现与国外不同的基因型,有关临床和流行病学意义值得深入研究。

全文目录


1 中文摘要  4-6
2 英文摘要  6-9
3 前言  9-13
4 正文  13-102
  第一部分 papC PCR方法用于UPEC的鉴定  13-21
    材料和方法  13-17
    结果  17-18
    讨论  18-21
  第二部分 国内分离的UPEC菌株papA和papG基因分型  21-43
    材料和方法  22-28
    结果  28-37
    讨论  37-43
  第三部分 致肾盂肾炎大肠埃希菌UPEC4030株papA和papG基因的克隆和序列分析  43-90
    材料和方法  44-52
    结果  52-84
    讨论  84-90
  小结  90-91
  参考文献  91-102
5 综述  102-116
  参考文献  110-116
6 附录  116-117
7 致谢  117

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中图分类: > 医药、卫生 > 基础医学 > 医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学) > 病原细菌
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