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非编码RNA HULC促进细胞增殖、迁移及侵袭的生物学作用及分子机制研究

作　者: 李丹
导　师: 詹启敏；林晨；刘芝华
学　校: 北京协和医学院
专　业: 细胞生物学
关键词: ncRNA HULC YB-1 肝癌 MAPK通路 核定位
分类号: Q522
类　型: 博士论文
年　份: 2010年
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内容摘要


非编码RNA,即non-coding RNA(ncRNA),是指那些由DNA转录却并不翻译成蛋白的RNA,它们包含高密度的终止子或缺少有效的开放阅读框。它们能够通过不同的机制,如RNA-RNA碱基配对,RNA蛋白相互作用,RNA-DNA相互作用等,在细胞调控的各个层面中发挥功能,包括参与染色质修饰、转录调节、剪切加工、RNA稳定性调节等。近来还有研究发现,在一些肿瘤组织中,ncRNA有着过表达或者低表达的现象。提示在肿瘤的发生发展过程中,它们可能发挥着重要的作用。HULC (Highly Up-reglated in Liver Cancer)是一种在肝癌中发现的ncRNA。该基因定位于6p24.3,HULC基因转录产物经过剪切和加工后形成一个500bp的RNA,具有类似于mRNA的polyA尾结构。但这个RNA序列中存在多个终止密码子,并不能编码蛋白。HULC RNA不仅能够在肝癌组织中检测到,还能够在肝癌病人的血液中检测到高表达,另外有研究表明,除了能在肝癌组织中检测到HULC RNA高表达外,在从结肠癌转移到肝脏的转移瘤中也能检测到HULC RNA。这提示我们它可能可以作为一种潜在的肝癌标志物应用到临床诊断中。但是,HULC RNA的功能及分子机制迄今仍未知。在本研究中,我们发现HULC在内源性高表达的细胞系中并不存在基因组扩增,且HULC RNA半衰期在约6小时,属于较长效的RNA。并且HULC RNA能够促进细胞的体外增殖、迁移及侵袭,并能抑制顺铂诱导的凋亡。另外,我们还筛选出与HULC RNA特异性结合的蛋白YB-1。它是一种多功能蛋白,可以分别和DNA、RNA及其他蛋白相结合,参与转录调节、翻译调控、mRNA选择性剪接、mRNA稳定性、DNA的修复、细胞增殖等。我们的研究还发现在受到DNA损伤刺激后,HULC RNA能够影响YB-1蛋白的核定位,并影响YB-1蛋白对部分下游基因的调控。

全文目录


图表索引  5-6
中英文缩略词  6-8
中文摘要  8-9
Abstract  9-11
前言  11-19
  1 ncRNA的发现  11-13
  2 ncRNA的功能及机制  13-16
    2.1 ncRNA通过不同机制调控基因转录  14-15
    2.2 ncRNA影响蛋白的亚细胞定位  15
    2.3 ncRNA作为结构RNA  15
    2.4 ncRNA参与转录后调控  15-16
  3 ncRNA与肿瘤  16-18
  4 HULC与肝癌  18
  5 本文研究目标  18-19
材料与方法  19-43
  1 实验材料  19-28
  2 研究方法  28-43
实验结果  43-68
  1 HULC在HepG2细胞中特异性高表达,并且属于长效RNA  43-44
  2 HULC在HepG2细胞基因组中无扩增  44-47
  3 HULC RNA影响肿瘤细胞的体外增殖、迁移及侵袭能力  47-52
  4 HULC RNA影响肝癌细胞系的凋亡  52-53
  5 表达谱芯片研究HULC RNA对相关基因的影响  53-57
  6 HULC RNA与YB-1蛋白相互结合  57-63
  7 HULC影响YB-1亚细胞定位及其下游基因表达  63-68
讨论  68-78
  1 HULC RNA在肝癌细胞系中的高表达  68-69
  2 HULC RNA促进肿瘤细胞增殖、迁移以及侵袭能力并抑制凋亡  69-71
  3 HULC RNA影响MAPK信号通路基因转录水平  71-72
  4 HULC RNA与YB-1蛋白存在特异性的结合  72-74
  5 HULC RNA影响YB-1蛋白的亚细胞定位及转录活性  74-77
  6 展望  77-78
小结  78-79
参考文献  79-88
课题基金资助  88-89
博士在读期间发表与待发表论文  89-90
文献综述  90-100
  参考文献  97-100
致谢  100-101

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中图分类: > 生物科学 > 生物化学 > 核酸 > 核糖（醣）核酸（RNA）
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