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铜绿假单胞菌生物膜形成相关的蛋白质组学研究

作　者: 陈海荣
导　师: 陈一强
学　校: 广西医科大学
专　业: 内科呼吸病学
关键词: 铜绿假单胞菌蛋白质组学表面增强激光解析电离飞行时间质谱蛋白质芯片
分类号: R378
类　型: 硕士论文
年　份: 2007年
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内容摘要

目的:找出铜绿假单胞菌野生型PAO1与黏液型PDO300菌株、PAO1lasI rhlI基因缺陷型菌株、PAO1 lasR rhlR基因缺陷型菌株之间的差异蛋白质,探讨这些蛋白质与铜绿假单胞菌生物膜形成的关系。方法:(1)将同一份样品配制成不同蛋白浓度的标本分别上样检测,对检测所得蛋白质图谱进行分析。(2)根据最佳检测蛋白浓度,将黏液型PDO300、野生型PAO1、PAO1 lasI rhlI基因缺陷型和PAO1 lasR rhlR基因缺陷型菌株的菌体蛋白分别采用CM10、IMAC3-Cu这两种蛋白质芯片,运用SELDI技术进行测定,筛选最佳蛋白质芯片。(3)利用SELDI技术对黏液型PDO300、野生型PAO1、PAO1 lasI rhlI基因缺陷型和PAO1 lasR rhlR基因缺陷型菌株的菌体蛋白分别进行检测,并采用Biomarker Wizard软件进行分析。结果:(1)检测蛋白浓度为1.5μg/μl时,进行SELDI检测可发现较多的蛋白峰。(2)同样检测蛋白浓度时,CM10芯片捕获的蛋白峰数量比IMAC3-Cu芯片多。(3)铜绿假单胞菌野生型PAO1与黏液型PDO300菌株的菌体蛋白比较,有16个蛋白峰存在差异(P＜0.01)。与野生型PAO1菌株相比,PDO300菌株中有10个蛋白质高表达,分子量分别为4,074Da、3,817Da、8,923Da、8,148Da、3,332Da、4,521Da、7,621Da、11,594Da、7,831Da和13,751Da;有6个蛋白质低表达,分子量分别为6,199Da、6,899Da、12,379Da、6,115Da、6,763Da和8,576Da。(4)铜绿假单胞菌PAO1 lasI rhlI基因缺陷型与野生型PAO1菌株相比有1个蛋白质低表达(P＜0.05),分子量为6,910Da。(5)铜绿假单胞菌PAO1 lasR rhlR基因缺陷型与野生型PAO1菌株之间有4个蛋白峰存在差异(P＜0.05)。在PAO1 lasR rhlR基因缺陷型菌株中有2个蛋白质高表达,分子量分别为8,924Da和8,790Da:有2个蛋白质低表达,分子量分别为6,735Da和6,986Da。结论:(1)运用SELDI技术对细菌菌体蛋白进行分析的最佳检测蛋白浓度为1.5μg/μl。(2)与IMAC3-Cu芯片相比,CM10芯片更适于细菌菌体蛋白质组学的研究。(3)铜绿假单胞菌野生型PAO1与黏液型PDO300的菌体蛋白有16个蛋白质表达明显不同,这些差异蛋白可能与铜绿假单胞菌的表型和生物膜形成有关。(4)铜绿假单胞菌野生型PAO1与PAO1 lasI rhlI基因缺陷型菌株之间有1个蛋白质表达不同,野生型PAO1与PAO1 lasR rhlR基因缺陷型菌株之间有4个蛋白质表达不同,这些蛋白质可能与QS系统调控生物膜形成有关。(5)用蛋白质芯片和SELDI技术对铜绿假单胞菌进行蛋白质组学研究,方法简便、敏感性高,可发现一系列传统研究手段难以测得的低分子量或低丰度的蛋白质。

全文目录

一、论文:铜绿假单胞菌生物膜形成相关的蛋白质组学研究  4-37
  主要缩略语  4-5
  中文摘要  5-7
  英文摘要  7-9
  前言  9-11
  材料与方法  11-18
  结果  18-26
  讨论  26-31
  结论  31-32
  展望及后续工作  32-33
  参考文献  33-37
二、综述:肺部感染性疾病常见病原体的蛋白组学研究  37-49
  正文  37-44
  参考文献  44-49
三、致谢  49

铜绿假单胞菌生物膜形成相关的蛋白质组学研究

内容摘要

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