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心脏特异表达基因的生物芯片分析及利用基因本体论分析其特性的研究

作　者: 周春晓
导　师: 惠汝太
学　校: 中国协和医科大学
专　业: 遗传学
关键词: 特异表达基因 本体论 基因芯片 医科大学 芯片分析 基因产物 生物芯片技术 人类基因组计划 协和 特异基因
分类号: Q819
类　型: 硕士论文
年　份: 2007年
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内容摘要


基因的组织特异表达能揭示出基因功能的重要线索。本课题利用现有的人类多组织基因芯片数据集，结合Cardiosignal数据库中收集的数据展开心脏特异基因寻找。这一数据集包含44 775个人类基因转录体在人的79种组织中的表达值。这是目前为止，包含人类基因转录体表达值最完整的数据集之一。在τ的阈值取为0.85时，共找到112个心脏特异表达基因。其次，本课题对找到的心脏特异表达基因进行基因本体论分析。建立的基因本体论的DAG结构，并将数据集中的基因转录体的基因本体论注释映射到DAG结构上，做为研究的背景集合。将112个心脏特异表达基因的基因本体论注释映射到DAG结构上，做为训练集合，进行fisher精确检验，p＜0.1，得到过量出现的62条基因本体论注释。这些注释提示了心脏特异表达基因的共同特性，对研究未知的心脏特异表达基因的功能研究提供了方向。

全文目录


缩略语表  4-5
中文摘要  5-6
英文摘要  6-7
前言  7-20
材料与方法  20-39
实验结果  39-48
结论  48-49
参考文献  49-55
文献综述  55-63
附表  63-68
个人简历  68-69
致谢  69

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中图分类: > 生物科学 > 生物工程学（生物技术） > 生物工程应用
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