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聚合酶链反应检测A组链球菌、白喉杆菌、嗜肺军团菌的实验研究

作 者: 王晓春
导 师: 熊鸿燕;张建中
学 校: 第三军医大学
专 业: 流行病学
关键词: 聚合酶链反应 A组链球菌 白喉杆菌 嗜肺军团菌 speB基因 toxB基因 mip基因
分类号: R446.5
类 型: 硕士论文
年 份: 2002年
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内容摘要


目的:建立用于检测A组链球菌、白喉杆菌以及嗜肺军团菌的多聚合酶链反应(PCR)方法。同时,为下一步呼吸道传染病多重PCR检测方法以及基因芯片检测方法的建立提供实验基础。方法:1、以A组链球菌致热性外毒素B基因(speB)、白喉外毒素B片段基因(toxB)以及嗜肺军团菌巨噬细胞感染增强子基因(mip)为PCR扩增靶序列,通过美国医学图书馆生物信息中心的blast窗口,验证其特异性及保守性;根据核酸芯片技术的要求设定引物设计条件,应用primer premier 5.0引物设计软件设计引物;采用常规PCR技术对实验菌株DNA样本进行扩增。2、选择系列鉴别菌株样本进行对比,以观察设计、建立的PCR检测方法的特异性。同时,将待检测菌株DNA模板以1:10梯度稀释,做PCR扩增,分析PCR方法的检测敏感性。结果:1、用PCR方法检测A组链球菌:以A组链球菌致热性外毒素基因speB为靶序列,设计的扩增引物对全部对照菌株的扩增结果为阴性,而全部A组链球菌参考株均能扩增出特异的345bp片段,其中包括三株猩红热链球菌,检测敏感性为6.5pg/μl DNA。2、用PCR方法检测白喉杆菌:以白喉外毒素基因toxB为靶序列,设计的扩增引物对全部白喉杆菌参考株(有毒株)均能扩增出特异的318bp片段,而全部对照株的扩增结果为阴性,检测敏感性为850fg/μl DNA。3、用PCR方法检测嗜肺军团菌:以嗜肺军团菌巨噬细胞感染增强子基因mip为靶基因,设计的引物对嗜肺军团菌14个血清型参考株均扩增出特异的340bp片段,而鉴别对照株包括三株非嗜肺军团菌均未扩增出任何片段。检测敏感性为2.6pg/μl Lp-DNA。结论:1、以speB基因为靶基因建立的A组链球菌PCR检测方法、以toxB基因为靶基因建立的白喉杆菌PCR检测方法以及以mip基因为靶基因建立的嗜肺军团菌PCR检测方法均具有高度的特异性和敏感性,为三种病原体的快速、早期诊断提供了一种便捷、准确、可靠的技术。由于时间的限制,所建立的三种PCR检测方法目前还只处在实验室验证阶段,其对临床标本的检测及其准确度评价有待进一步开展。2、本实验PCR引物的设计、反应条件的选择均按照基因芯片技术的要求进行,为下一步呼吸道传染病多重PCR检测方法以及基因芯片检测方法的建立提供一定的实验基础。

全文目录


中英文对照表  3-4
英文摘要  4-6
中文摘要  6-8
论文正文 聚合酶链反应检测A组链球菌、白喉杆菌、嗜肺军团菌的实验研究  8-43
  前言  8-10
  材料与方法  10-18
    材料  10-14
    方法  14-18
  结果  18-34
  讨论  34-37
  小结  37-38
  致谢  38-39
  参考文献  39-43
文献综述  43-55
  参考文献  52-55

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中图分类: > 医药、卫生 > 临床医学 > 诊断学 > 实验室诊断 > 微生物学检验
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