学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

XRCC1和SMAD4基因多态性与胃癌遗传易感性研究

作　者: 朱海霞
导　师: 张正东
学　校: 南京医科大学
专　业: 流行病与卫生统计学
关键词: DNA修复抑癌基因 XRCC1 SMAD4 胃癌遗传易感性分子流行病学标签SNPs
分类号: R735.2
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
下　载: 46次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载

内容摘要

胃癌是常见的消化系统恶性肿瘤之一,居各种肿瘤死因的第二位,在全球肿瘤发病率中列第四。近年来,我国胃癌发病率仍居所有肿瘤的第一位,发病人数约占全球发病总人数的1/3,与世界各国比较,中国男性和女性胃癌的死亡率均居首位,因此,胃癌已经成为严重危害我国人民身体健康的最主要疾病之一。胃癌的发生和发展是环境暴露因素及遗传因素共同作用的结果。环境危险因素的暴露如幽门螺旋杆菌(Helicobacter pylori,HP)感染、吸烟、饮酒和饮食摄入致癌性N-亚硝基前体物等。此外,胃慢性病史、不良的饮食习惯在胃癌发病中同样具有重要作用。流行病学调查显示,尽管很多人接触相同的环境致癌危险因素,但只有少数人最终发生胃癌,即使在胃癌高发区也存在类似的情况,提示个体对于胃癌具有遗传易感性。大量证据显示,作为关键性DNA修复基因的XRCC1和作为新的重要抑癌基因的SMAD4在胃癌发生发展过程中发挥重要作用。本研究旨在评价XRCC1和SMAD4基因多态变异与中国人群胃癌遗传易感性的关联性,为进一步揭示其参与胃癌发病机制提供理论依据,也为今后实施有效的个体化预防和干预提供重要参考。第一部分XRCC1基因启动子区多态性与胃癌遗传易感性研究DNA在各种内源和外源诱导剂作用下发生损伤,如果这些损伤不被修复,将会导致突变和基因组不稳定,进而导致细胞恶化。碱基切除修复(base excision repair, BER)通路是DNA修复的主要通路之一,修复各种碱基损伤和单链损伤。XRCC1是BER通路中的一个关键蛋白,具有“脚手架”(scaffold)样作用,通过直接与聚合酶β、DNA连接酶III和多聚ADP核糖聚合酶[poly (ADP-ribose) polymerase, PARP]形成复合物,共同参与因电离辐射和氧化损伤等引起的碱基切除修复和单链断裂修复。越来越多的证据显示,DNA多态性现象可以解释个体肿瘤发生易感性差异。基因启动子区是执行基因转录调控的重要区域,如果该区域发生多态变异,将可能影响基因的转录,继而影响基因功能的正常发挥,参与肿瘤的发生发展。因此,我们假设,DNA修复通路中的XRCC1基因启动子区的单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性有关。为了探讨XRCC1启动子区的四个多态性位点( -77T>C、-1450GGCCins>del、-1889T>C和-1991C>G)与胃癌遗传易感性的关系,我们选择了经组织学确诊的332例新发胃癌病例及与其性别和年龄频数匹配的332例对照,采用限制性内切酶片段长度多态性(polymerase chain reaction- restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP)方法进行基因分型。运用logistic回归模型计算各基因型人群罹患胃癌的风险(odds ratios, ORs)及其95%可信区间(95% confidence intervals, 95% CIs)。应用电泳迁移率变动试验(electrophoretic mobility shift assay, EMSA)和荧光素酶报告基因转染试验评价候选多态性位点对转录因子与DNA结合亲和性以及基因转录活性的影响。结果显示,与携带XRCC1 -1450GGCCins/ins基因型者比较,携带GGCC del/del和GGCCins/del+del/del基因型者罹患胃癌的风险分别降低了64%(调整OR=0.36,95% CI=0.21-0.64)和58%(调整OR=0.42,95% CI=0.30-0.58);同时发现,与携带XRCC1 -1991CC基因型者相比,携带GG和CG+GG基因型者罹患胃癌的风险分别增加1.61倍(95% CI=1.04-2.49)和1.21倍(95% CI=0.87-1.69)。与携带XRCC1 -77TT基因型者相比,携带TC基因型者罹患胃癌的风险增加了53%(OR=1.53,95% CI=1.01-2.33)。单倍型分析显示,以最常见的单倍型CCIT为参比组,携带单倍型CCDT、GCDT、CTDT、CCDC者罹患胃癌的风险均明显降低(“I”代表-1450GGCCins等位基因;“D”代表-1450GGCCdel等位基因)。EMSA结果显示,XRCC1 -1450GGCCins等位基因相对于GGCCdel等位基因,可增加转录因子与该启动子区DNA序列结合的亲和性。荧光素酶报告基因结果显示,GGCCins>del的变异可能增加XRCC1基因的转录活性。上述结果表明,XRCC1基因启动子区多态与中国人群胃癌遗传易感性显著关联,其中,-1450GGCCins>del多态变异可改变转录因子与该启动子区DNA序列结合的亲和性,并可能影响该基因的转录活性,为进一步揭示其参与胃癌的发病机制提供功能学的证据。第二部分SMAD4基因标签SNPs与胃癌遗传易感性研究SMAD4作为SMADs家族的重要一员,可介导SMADs家族其它成员的激活,是最重要的TGF-β信号受体之一。SMAD4基因(又名DCP4基因)作为新的重要抑癌基因,其突变与促进胃癌的发生发展密切相关。为了进一步探讨SMAD4基因多态变异与胃癌发生发展的关系,我们采用分子流行病学病例-对照研究方法,评价SMAD4基因标签SNPs ( tagging single nucleotide polymorphisms, tSNPs)与胃癌遗传易感性的关联性。我们选择了经组织学确诊的322例新发胃癌病例及与其性别和年龄频数匹配的351例对照。研究设计和方法详见第一部分。在单个SNP分析中发现,SNP2rs8084630、SNP3 rs17663887和SNP5 rs12456284三个多态性位点与胃癌的发生风险性显著相关。对于SNP2 rs8084630,以携带GG基因型者为参照,携带AA基因型者罹患胃癌的风险降低了89%(OR=0.11,95% CI=0.04-0.33);在SNP3 rs17663887中,携带TC基因型者与携带TT基因型者相比,其罹患胃癌的风险降低了60%(OR=0.40,95% CI=0.22-0.75);对于SNP5 rs12456284,与携带AA基因型者相比,携带AG和GG基因型者罹患胃癌的风险分别增加了2.97倍(95% CI=1.51-5.84)和3.30倍(95% CI=1.67-6.52)。进一步的联合分析发现,与携带1-3个危险等位基因(即SNP2 G、SNP3 T和SNP5 G)者相比较,携带4-6个危险等位基因者罹患胃癌的风险增加了67%(OR=1.67,95% CI=1.13-2.45),且在小于65岁(1.77,1.08-2.88)、女性(1.91,1.00-3.64)、吸烟(1.99,1.21-3.27)和饮酒(1.64,1.05-2.55)人群中更显著。单倍型分析显示,与携带最常见的单倍型GATCGG者比较,携带AGTGAA单倍型者罹患胃癌风险明显降低(OR=0.58,95% CI=0.40-0.85)。上述结果表明,SMAD4基因多态性与中国人群胃癌遗传易感性明显相关,有必要进行功能学或更大样本人群的进一步验证。

全文目录

一、中文摘要  4-8
二、英文摘要  8-13
三、论文正文  13-43
  引言  13-14
  第一部分 XRCC1基因启动子区多态性与胃癌遗传易感性研究  14-32
    研究对象  16
    材料和方法  16-24
    结果  24-29
    讨论  29-32
  第二部分 SMAD4 基因标签SNPs 与胃癌遗传易感性研究  32-43
    研究对象  34
    材料和方法  34-35
    结果  35-41
    讨论  41-43
四、参考文献  43-51
五、综述  51-67
  参考文献  58-67
六、附录  67-68
七、已发表论文  68-69
八、致谢  69

XRCC1和SMAD4基因多态性与胃癌遗传易感性研究

内容摘要

全文目录

相似论文