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猪链球菌分子分型新方法研究及健康猪群猪链球菌菌株耐药性检测
作 者: 邢娟
导 师: 柳纪省;胡永浩
学 校: 甘肃农业大学
专 业: 预防兽医学
关键词: 猪链球菌 分型方法 药敏试验 毒力岛
分类号: S858.28
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
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内容摘要
根据国外当前的多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)法,我国分离的猪链球菌S. suis 98HAH33和05ZYH33株属于序列7(sequence type 7,ST7)型。但S. suis 98HAH33和05ZYH33在7个猪链球菌MLST基因序列上的基因分子特征却与MLST ST7型其它猪链球菌分离株的基因分子特征不相吻合。鉴于上述原因,本研究尝试建立一种新的分型方法,力求同一型内的菌株在ST和基因分子特征方面获得一致。本研究首先从基因组上随机选择6个保守的酶基因和1个CPS基因,截取其500-750bp的保守片段。由于相关研究认为GenBank上发表的S. suis 98HAH33和S. suis 05ZYH33基因组序列存在较多的错误,所以,我们首先对本课题保存的S. suis 98HAH33和S. suis 05ZYH33菌株上的相关基因测序,以求得到准确的测序结果。同时,从GenBank上下载S. suis BM407,S. suis P1/7,S. suis SC84相关序列。之后,按C76和C77组合,将其按6或7片段连接起来,通过DNASTAR软件MegAlign建立遗传树。该分型法对所得的8个分型图均表明,S. suis 98HAH33、S. suis 05ZYH33均应归属于MLST ST1型,分型结果与S. suis 98HAH33、S. suis05ZYH33的基因分子特征完全吻合。同时,本研究从甘肃省部分地区采集到的152份健康猪扁桃体分离猪链球菌,共分离到67株猪链球菌菌株,分离率约44%。对67株猪链球菌菌株所作的耐药性检测表明,全部猪链球菌分离株具有多重耐药性,最严重者,对22种抗生素中的16种抗生素产生耐药性。用我国致病性2型猪链球菌特有的89k毒力岛序列特异性引物对67株猪链球菌进行PCR鉴定,仅发现一株猪链球菌分离株能够扩增出该特异性片段,提示在该地区健康猪群中少数猪可能隐性感染致病性2型猪链球菌病。
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全文目录
摘要 3-4 SUMMARY 4-7 缩写词英汉对照表 7-8 第一篇 猪链球菌流行毒株分子分型研究及甘肃省健康 猪群猪链球菌分离株耐药性检测 8-38 第一章 猪链球菌分子分型新方法研究 9-28 前言 10-11 1 材料与方法 11-21 1.1 实验材料 11 1.2 实验方法 11-19 1.3 PCR 结果及鉴定 19-21 2 结果 21-25 2.1 测序结果 21 2.2 基因修正 21-23 2.3 遗传树的建立 23-25 3 分析与讨论 25-28 3.1 基因选择分析 25-26 3.2 遗传树比较结果分析 26-28 第二章 甘肃省健康猪群猪链球菌耐药性检测 28-37 前言 29 1 材料与方法 29-33 1.1 实验材料 29-30 1.2 实验方法 30-33 2 结果与分析 33-35 2.1 猪链球菌菌株分离状况 33 2.2 药敏试验结果 33-34 2.3 67 株猪链球菌的多重耐药情况 34-35 2.4 健康猪群猪链球菌分离株中致病毒株的 PCR 检测 35 3 小结和讨论 35-37 第三章 结论 37-38 第二篇 文献综述 38-59 第四章 猪链球菌研究进展 39-49 前言 39-40 1 猪链球菌毒力因子 40-44 1.1 荚膜多糖 40-41 1.2 MRP 和 EF 41-42 1.3 溶血素 42-43 1.4 粘附素 43 1.5 IGG 结合蛋白 43 1.6 新发现的毒力因子 43-44 2 猪链球菌毒力岛研究进展 44-45 3 细菌耐药机理的研究进展 45-47 3.1 耐药基因 45-47 3.2 猪链球菌的耐药性 47 4 研究目的和意义 47-49 第五章 猪链球菌鉴定分型方法研究进展 49-59 前言 49 1 生化鉴定 49-50 2 血清学分型 50-51 3 分子生物学分型方法 51-57 3.1 随机扩增核酸片段多态性分析 51 3.2 多位点酶电泳法 51-52 3.3 ELISA 52 3.4 原位杂交 52-53 3.5 限制性内切酶图谱分析法 53 3.6 限制性片段长度多态性分析 53 3.7 PCR 鉴定 53-54 3.8 基因芯片技术 54-55 3.9 核糖体分型研究 55-56 3.10 脉冲场凝胶电泳法 56-57 3.11 多位点序列分型技术 57 4 小结 57-59 致谢 59-60 参考文献 60-66 附录 66-86 作者简介 86-87 导师简介 87-88
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 各种家畜、家禽、野生动物的疾 > 家畜 > 猪
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