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成骨相关转录因子Osterix启动子调控机制初步研究
作 者: 李益广
导 师: 洪岸;孙奋勇
学 校: 暨南大学
专 业: 遗传学
关键词: Osterix 启动子 调控
分类号: Q343
类 型: 硕士论文
年 份: 2006年
下 载: 98次
引 用: 4次
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内容摘要
目的 在Osterix基因5’端上游区域搜寻BMP-2诱导Osterix转录上调的转录因子潜在核心作用区域,作为后续深入研究的基础。 方法 用Real-Time Q-PCR的方法检测出在转录水平上BMP-2能诱导Osterix的表达上调,然后用PCR的方法,从BAC-RP23-118K10克隆中,扩增出一系列不同长度的Osterix启动子片断,将上述片断克隆到Luciferase报告载体pGL3-Basic Vector中,构建出一系列Osterix启动子缺失突变的报告载体。将构建好的载体和内参pRL-TK共转染至C2C12、C3H10T1/2、和MC3T3三种细胞中,BMP-2诱导48小时后用Dual-Luciferase Reporter Assay System检测不同样品中Luciferase的表达量。通过其表达量的变化,分析其启动子上的调控区域。 结果 BMP-2在转录水平存在对Osterix的调控作用,成功的构建了一系列Osterix启动子缺失突变的报告载体,通过检测,找到了对Osterix基础表达活性有上调作用的三个潜在控制区,即-100~+81、-760~-560和-1254~-1042及两个潜在的BMP-2调控Osterix表达下调的控制区-100~+81和-760~-560。 结论 初步确定了Osterix核心启动子区域,并建立了一个对Osterix转录水平调控的研究平台。
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全文目录
摘要 6-7 Abstract 7-9 一.前言 9-26 1.文献综述: 9-23 1.1 骨的发生 9-10 1.2 成骨细胞分化过程中主要转录因子的研究及进展 10-16 1.3 Osterix调控机制的研究和进展 16-18 1.4 Real-Time Quantitative PCR概述 18-21 1.5 双荧光素酶报告基因测试系统(DLR)概述 21-23 2.本论文的研究内容及意义 23-25 2.1 研究内容 23-24 2.2 研究意义 24-25 3.研究思路 25-26 3.1 Real-Time Q-PCR检测Osterix基因是否在RNA水平上受到调控 25 3.2 BMP-2相关的Osterix启动子核心区域探寻 25-26 二.实验仪器与材料 26-31 1.主要仪器 26-27 2.材料 27-31 2.1 细胞株及质粒 27 2.2 工具酶和试剂盒 27-28 2.3 常用试剂及配方 28-31 三.实验方法 31-47 1.BMP-2诱导C2C12,C3H10T1/2和MC3T3-E1,并检测Osterix的表达 31-36 1.1 细胞的BMP-2诱导 31 1.2 细胞总RNA的抽提 31-32 1.3 用DNase Ⅰ(RNase free)处理RNA 32 1.4 总RNA纯度和完整性检测 32-33 1.5 逆转录 33 1.6 常规PCR检测逆转录是否成功 33-34 1.7 Real-Time Q-PCR检测Osterix表达水平 34-36 2、Osterix启动子缺失突变的Luciferase报告载体构建 36-44 2.1 实验设计 36-38 2.2 BAC的制备 38 2.3 PCR扩增 38-40 2.4 切胶回收纯化PCR或酶切产物 40-41 2.5 酶切反应 41 2.6 连接反应 41-42 2.7 点击转化宿主大肠杆菌 42 2.8 重组子的快速鉴定 42-43 2.9 质粒抽提 43 2.10 双酶切鉴定 43-44 3.BMP-2相关的Osterix核心启动元件的探寻 44-47 3.1 实验设计 44 3.2 转染用质粒制备 44-45 3.3 质粒转染C2C12,C3H10T1/2和MC3T3-E1细胞 45 3.4 BMP-2诱导转染后的细胞 45 3.5 Dual-Luciferase Reporter Assay System检测Luciferase活性 45-47 四.结果与分析 47-58 1.BMP-2分别诱导C2C12,C3H10T1/2和MC3T3-E1,并检测Osterix的表达 47-50 1.1 细胞总RNA的纯度和完整性检测 47 1.2 常规PCR检测逆转录 47-48 1.3 Real-Time Q-PCR检测不同样本的Osterix表达水平 48-49 1.4 小结 49-50 2.Osterix启动子区域生物信息学分析 50-52 2.1 不同种属Osterix启动子区域高度保守区探寻 50 2.2 Osterix启动子区域转录因子结合位点预测 50-52 3.Osterix启动子缺失突变的Luciferase报告载体构建 52-54 3.1 PCR扩增 52-53 3.2 载体鉴定 53-54 4.BMP-2相关的Osterix核心启动元件的探寻 54-57 小结 57-58 五.讨论 58-62 1.细胞株的选择策略 58 2.启动子区域的预测 58-60 3.启动子核心区域探寻及结果分析 60-62 六.总结与展望 62-64 1.总结 62 2.展望 62-64 七.参考文献 64-67 八.附录 67-69 1.pGL3-NBOP1.3K克隆测序结果图谱 67-68 2.pGL3-NBOP1.3K全序列 68-69 九.致谢 69
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中图分类: > 生物科学 > 遗传学 > 遗传学分支学科 > 细胞遗传学
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