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家族性急性髓系白血病相关新基因全长cDNA的克隆及功能初步预测

作　者: 王程毅
导　师: 王少元；林旭
学　校: 福建医科大学
专　业: 内科学
关键词: 家族性急性髓系白血病生物信息学基因克隆全长cDNA RACE
分类号: R733.71
类　型: 硕士论文
年　份: 2006年
下　载: 59次
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内容摘要

急性白血病是一种涉及多基因改变的相关肿瘤,寻找白血病新的相关基因是该领域研究的热点,它不仅有助于阐明白血病的发病机制,而且有助于找到一些治疗的靶位点。【目的】克隆家族性急性髓系白血病相关基因全长,在分子水平上探讨急性白血病发生发展的机制。【方法】应用抑制性消减性杂交(suppression subtractive hybridization ,SSH)构建家族性急性髓系白血病cDNA抑制性消减文库获得28个基因克隆;测序结果提交GenBank进行同源性比对分析,发现11条为未知基因的EST片断,利用一步法半定量逆转录PCR(reverse transcriptase-PCR,RT-PCR)的方法,排除了可能出现的假阳性结果,筛选出4条差异表达的未知EST片断;以这4个未知EST片断为基础,1、综合应用电子克隆和SMART-cDNA末端快速扩增法(SMART-rapid amplification of cDNA ends,SMART-RACE)技术克隆家族性急性髓系白血病相关新基因的全长cDNA;2、应用生物信息学方法对家族性急性髓系白血病相关新基因的功能进行初步分析。【结果】获得家族性急性髓系白血病相关新基因ELF2C的全长cDNA和432bp的ORF,该基因定位于染色体4q31.1,编码143个氨基酸残基,与人的ELF2有部分同源,推测是ELF2的新可变剪切体。被GenBank收录,核酸注册号为DQ359746,蛋白注册号为ABD15131。【结论】1.成功获得家族性急性髓系白血病相关基因ELF2C的cDNA全长,染色体定位于4q31.1。2.新基因ELF2C可能是ELF2的新可变剪切体。3.SMART-RACE技术是克隆cDNA全长的有效方法。

全文目录

一、论文  3-48
  （一）中文摘要  3-4
  （二）英文摘要  4-6
  （三）前言  6-8
  （四）材料  8-10
  （五）方法  10-23
  （六）结果  23-37
  （七）讨论  37-43
  （八）结论  43-44
  （九）参考文献  44-47
  （十）致谢  47-48
二、综述  48-55
  （一）正文  48-54
  （二）参考文献  54-55

家族性急性髓系白血病相关新基因全长cDNA的克隆及功能初步预测

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