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鸡H-FABP基因PCR-SSCP分析及其与脂肪性状的相关研究

作　者: 王彦
导　师: 朱庆；舒鼎铭
学　校: 四川农业大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 鸡 H-FABP基因单链构象(SSCP) 肌内脂肪含量
分类号: S831
类　型: 硕士论文
年　份: 2006年
下　载: 218次
引　用: 5次
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内容摘要

目前家禽育种工作已经取得了很大进展，然而这种高强度选择又带来了许多负面影响。其中控制脂肪在鸡体内的过多蓄积，提高肉鸡的胴体质量和适口性是中国养禽业急需解决的问题。利用基于分子遗传学的标记辅助选择进行脂肪与风味相关性状选择，将是解决这类问题的主要手段之一。本实验将H-FABP基因作为影响脂肪代谢和肌内脂肪含量的候选基因，采用单链构象多态性(PCR-SSCP)技术，以封开杏花鸡(T04)、惠阳三黄胡须鸡(H)、清远麻鸡(Q)、广西霞烟鸡(S1)等4个地方品种，岭南黄鸡矮小型麻羽专门化品系(E4)，岭南黄鸡Ⅱ号配套系商品代(DC)、从白羽肉鸡商品代(AA)等2个培育品种为试验材料，对H-FABP基因进行SNPs(单核苷酸多态性)检测和基因类型判别。对H-FABP基因的多态性、基因频率和基因型频率的研究显示：在12对引物位点中，只有引物8位点和引物10位点不存在多态，而在其它的引物位点中，七个鸡品种都存在变异。通过不同品种鸡脂肪性状的比较分析发现，品种效应对于腹脂率、肌内脂肪含量和肌苷酸含量三个性状影响很大，达到了极显著的水平(P＜0.01)，其中E4鸡和AA鸡对应的腹脂率和肌内脂肪含量最高，分别为5.834和3.825。在分品种进行H-FABP基因与脂肪性状的相关性分析中，在P1-89-295位点，除DC鸡BB基因型与AA基因型之间的肌苷酸含量的最小二乘均值之间的差异达到显著水平(P＜0.05)外，其它鸡种各基因型的腹脂重、肌内脂肪含量和肌苷酸含量最小二乘均值之间均差异不显著(P＞0.05)。在P2-110-280位点，DC鸡和T04鸡中BB和AA基因型对IMF影响达到显著水平(P＜0.05)，其它鸡种各基因型的腹脂重、肌内脂肪含量和肌苷酸含量最小二乘均值之间均差异不显著(P＞0.05)。在P4-528-792位点，除AA鸡BB基因型与AB、BB基因型之间的IMF和肌苷酸含量的最小二乘均值之间的差异达到显著水平(P＜0.05)外，其它鸡种各基因型的腹脂重、肌内脂肪含量和肌苷酸含量最小二乘均值之间均差异不显著(P＞0.05)。在P5-775-1049位点，AA鸡BB基因型对肌苷酸含量影响显著(P＜0.05)。在P6-960-1168位点，AA鸡的AA基因型、H鸡的AB基因型和S1鸡的CC基因型均对肌苷酸含量的影响显著(P＜0.05)。在P9-1644-1909位点，T04鸡中BB基因型和胡须鸡的AA基因型均对腹脂重影响显著(P＜0.05)。P12-2893-3052位点中，H鸡AB基因型和S1鸡AB基因型分别对肌苷酸含量和腹脂重影响显著(P＜0.05)。而在P3-430-661，P7-1106-1283

全文目录

中文摘要  5-7
英文摘要  7-12
1. 文献综述  12-23
  1.1 FABPS家族的研究进展  12-16
    1.1.1 概述  12-13
    1.1.2 FABPs结构  13-14
    1.1.3 FABPs基因的进化、染色体定位和结构  14-15
    1.1.4 FABPs对动物脂肪代谢的作用  15-16
  1.2 H-FABP基因的研究进展  16-19
    1.2.1 H-FABP基因的分子结构  16-17
    1.2.2 H-FABP基因的功能  17-18
    1.2.3 H-FABP基因多态性与脂肪性状的关系  18-19
  1.3 PCR-SSCP方法与SNP研究综述  19-22
    1.3.1 PCR-SSCP原理及其运用  19-21
    1.3.2 SNP及其研究方法  21-22
  1.4 本实验研究的目的和意义  22-23
2. 材料与方法  23-34
  2.1 试验材料  23-25
    2.1.1 试验样品  23
    2.1.2 主要仪器设备  23-24
    2.1.3 引物来源与合成  24
    2.1.4 主要试剂及配制  24-25
  2.2 试验方法  25-31
    2.2.1 总 DNA的提取  25-26
    2.2.2 DNA浓度和纯度的检测  26
    2.2.3 目的基因的扩增  26-28
    2.2.4 PCR产物的检测  28-29
    2.2.5 PCR扩增的PCR-SSCP分析及基因型判定  29-31
  2.3 数据处理  31-34
3. 试验结果与分析  34-69
  3.1 基因组DNA抽提结果  34
  3.2 PCR扩增结果  34-37
    3.2.1 引物1 PCR产物的扩增结果  34
    3.2.2 引物2 PCR产物的扩增结果  34
    3.2.3 引物3 PCR产物的扩增结果  34-35
    3.2.4 引物4 PCR产物的扩增结果  35
    3.2.5 引物5 PCR产物的扩增结果  35
    3.2.6 引物6 PCR产物的扩增结果  35
    3.2.7 引物7 PCR产物的扩增结果  35-36
    3.2.8 引物8 PCR产物的扩增结果  36
    3.2.9 引物9 PCR产物的扩增结果  36
    3.2.10 引物10 PCR产物的扩增结果  36
    3.2.11 引物11 PCR产物的扩增结果  36-37
    3.2.12 引物12 PCR产物的扩增结果  37
  3.3 PCR-SSCP多态性检测结果  37-40
    3.3.1 引物1 PCR-SSCP检测结果  37
    3.3.2 引物2 PCR-SSCP检测结果  37-38
    3.3.3 引物3 PCR-SSCP检测结果  38
    3.3.4 引物4 PCR-SSCP检测结果  38
    3.3.5 引物5 PCR-SSCP检测结果  38
    3.3.6 引物6 PCR-SSCP检测结果  38-39
    3.3.7 引物7 PCR-SSCP检测结果  39
    3.3.8 引物8 PCR-SSCP检测结果  39
    3.3.9 引物9 PCR-SSCP检测结果  39
    3.3.10 引物10 PCR-SSCP检测结果  39
    3.3.11 引物11 PCR-SSCP检测结果  39-40
    3.3.12 引物12 PCR-SSCP检测结果  40
  3.4 SSCP检测结果基因型命名  40
  3.5 突变位点的群体遗传学研究结果  40-47
    3.5.1 H-FABP基因频率和基因型频率  40-43
    3.5.2 遗传特性分析  43-44
    3.5.3 Hardy-weinberg平衡状态的检验  44-47
  3.6 7个群体鸡的遗传发生树分析  47
  3.7 不同品种鸡脂肪性状的比较分析  47-48
  3.8 H-FABP基因与各品种鸡脂肪性状的相关分析  48-53
  3.9 总群体H-FABP基因不同位点各基因型对脂肪性状的相关分析  53-66
  3.10 H-FABP多态性分析  66-68
  3.11 群体动态分析  68-69
4. 讨论与分析  69-74
  4.1 H-FABP基因群体遗传特性分析  69
  4.2 H-FABP基因与不同品种鸡脂肪性状的关系  69-70
  4.3 H-FABP基因对肌内脂肪含量的相关分析  70-71
  4.4 7个鸡品种(系)的群体间亲缘关系的分析  71-72
  4.5 H-FABP基因的应用前景  72-74
5. 结论  74-75
参考文献  75-80
致谢  80-81
附录: 攻读学位期间发表的论文  81

鸡H-FABP基因PCR-SSCP分析及其与脂肪性状的相关研究

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