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腮腺炎病毒F蛋白七肽重复序列的结构生物学研究
作 者: 刘月永
导 师: 冯明光;田波;高福
学 校: 浙江大学
专 业: 微生物学
关键词: 腮腺炎病毒MuV 融合蛋白F 七肽重复序列HR 融合机制
分类号: R34
类 型: 硕士论文
年 份: 2004年
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内容摘要
腮腺炎病毒(MuV)同其他囊膜病毒相似,在融合蛋白(F)中具有两个七肽重复序列结构域(HR)。有关其他囊膜病毒F蛋白的研究表明,HR区在F蛋白介导的病毒侵染中起着至关重要的作用,在结合蛋白或结合亚基的协助作用下,两段HR结构域的构像发生变化形成热稳定的富含α螺旋的发夹异源三聚体结构,并由此得到一个共同的融合机制。但目前并不清楚MuV是否有类似于其他囊膜病毒的侵染机制。 本研究构建了HR区(HR1、HR2和2-Helix)的重组载体,并在大肠杆菌中以融合蛋白的形式表达了HR1、HR2和2-Helix。GST融合的HR1、HR2和2-Helix单体蛋白都以可溶形式表达,利用亲和层析及凝胶过滤层析纯化获得了高纯度的目的蛋白。经pull-down实验,初步证实HR1和HR2之间存在相互作用,HR1和HR2的混合物在凝胶过滤层析中以聚体形式存在。HR1/HR2和2-Helix的化学交联实验表明,等摩尔的HR1和HR2可形成异源三聚体,其中2-Helix蛋白随着交联剂浓度的增加,呈现明显的单体和聚体的浓度梯度;HR1/HR2蛋白由于浓度较低虽未见清晰的单体和聚体的浓度梯度,但仍可看到明显的异源三聚体。凝胶过滤层析也证实了这一结果,两者在同一位置出峰,且在分子量为52 kDa和14.4 kDa的出峰位置之间,显示其以聚体形式存在。质谱分析结果显示,2-Helix蛋白分子量为11.7 kDa,HR1为7.1 kDa,HR2为4.7 kDa,2-Helix和HR1/HR2三体分子量分别为35.1 kDa和35.4 kDa,与凝胶过滤层析结果相对应。圆二色谱分析结果表明,单独的HR1以α螺旋结构存在,而HR2则以无规卷曲存在,当两者等摩尔混合后,α螺旋含量明显增加。2-Helix同样具有典型的α螺旋结构。2-Helix和HR1/HR2三体相当稳定,Tm达到76℃,而且这种结合是特异的,高温变性后的蛋白经低温长时间放置后能够大部分复性,仍然呈现较高含量的α螺旋结构。用晶体生长条件筛选试剂盒(Crystal Screen Ⅰ and Ⅱ,Hampton Research,Riverside,CA,USA)对2-Helix蛋白晶体的生长条件进行初选,经过优化最后在15%PEG 8000、1.0 M Li2SO4缓冲液长出可以进行衍射的晶体。通过应用程序AMORE,以SV5 F蛋白N1/Cl三聚体晶体结构(PDB code:1SVF)为模型,利用分子置换的方法对2-Helix的晶体结构进行解析,得到了与SV5、RSV和NDV核心结构相似的六螺旋束,显示MuV可能具有与上述蛋白相似的融合侵染机制。
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全文目录
致谢 5-8 中文摘要 8-9 英文摘要 9-11 1 囊膜病毒融合蛋白研究现状及文献评述 11-31 1.1 腮腺炎病毒概述 11 1.2 囊膜病毒融合的分子机制 11-20 1.2.1 病毒囊膜融合蛋白的一些基本特征 12-13 1.2.2 流感病毒HA和HIV-1Env蛋白 13-20 1.3 共同融合机制 20-22 1.4 副粘病毒的融合机制 22-29 1.4.1 副粘病毒简介 22-24 1.4.2 副粘病毒的融合蛋白 24-26 1.4.3 副粘病毒的融合机制 26-29 1.5 存在问题、研究内容与目标 29-31 2 腮腺炎病毒HR1、HR2及2-Helix基因载体构建 31-37 2.1 材料与方法 31-35 2.1.1 质粒与菌株 31 2.1.2 HR基因的引物设计 31 2.1.3 构建载体 31-35 2.2 结果与分析 35-37 2.2.1 基因载体构建 35 2.2.2 重组质粒的双酶切鉴定和测序 35-36 2.2.3 重组质粒的表达鉴定 36-37 3 HR1、HR2及2-Helix蛋白的表达和纯化 37-41 3.1 材料与方法 37-38 3.1.1 重组载体在大肠杆菌中的表达 37 3.1.2 表达蛋白产物的纯化 37-38 3.2 结果与分析 38-41 3.2.1 pGEX-HR1、pGEX-HR2、pGEX-2-Helix都以可溶性蛋白的形式表达 38-39 3.2.2 HR1、HR2和2-Helix蛋白的初步纯化 39 3.2.3 HR1和HR2相互作用分析 39-40 3.2.4 2-Helix与HR1/HR2蛋白以多聚体形式存在 40-41 4 腮腺炎病毒融合蛋白核心结构的二级结构分析 41-46 4.1 材料和方法 41 4.1.1 质谱分析 41 4.1.2 化学交联 41 4.1.3 圆二色谱分析 41 4.2 结果与分析 41-46 4.2.1 2-Helix和HR1/HR2蛋白以三聚体的形式存在 41-44 4.2.2 2-Helix和HR1/HR2的α螺旋结构 44-46 5 蛋白2-Helix的结晶和结构解析 46-49 5.1 材料与方法 46 5.1.1 晶体生长条件的筛选 46 5.1.2 晶体X射线衍射数据的收集和分析 46 5.1.3 晶体结构的解析 46 5.2 结果与分析 46-49 5.2.1 蛋白2-Helix的结晶 46-47 5.2.2 2-Helix蛋白晶体X射线衍射数据的分析 47-49 6 问题与讨论 49-53 参考文献 53-65 附录1: MuV-HR1测序图 65-66 附录2: MuV-HR2测序图 66-67 附录3: MuV-2-Helix测序图 67-68 附录4: MuV-2-Helix mutation测序图 68-69 附录5: 在读期间发表的研究论文 69
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中图分类: > 医药、卫生 > 基础医学 > 人体生物化学、分子生物学
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