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精神分裂症易感基因筛查

作　者: 刘阳
导　师: 陈刚
学　校: 山东省医学科学院
专　业: 医学免疫学
关键词: 精神分裂症遗传单核苷酸多态性关联分析连锁不平衡基因 JARID2 YAP1
分类号: R749.3
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要

第一节精神分裂症易感基因筛查精神分裂症是一种人类最为常见的严重精神疾患,其终生患病率约为1%。主要特征表现为思维、情感与行为障碍以及精神活动与环境的不协调。家系调查、双生子和寄养子研究表明其遗传度约为70%～85%,先症者同胞的患病风险为一般人群的10倍。尽管精神分裂症具有明显的遗传倾向,遗传因素在其发病过程中起主导作用,但其遗传机制尚未完全阐明。目前,认为精神分裂症的发生是由许多微效基因与环境因素共同作用,多个基因相互作用的多基因遗传性疾病。因此,定位克隆精神分裂症易感基因,不但有助于阐明其分子遗传学机制,而且也为基因诊断、基因治疗和药物设计奠定基础。然而,由于精神分裂症的遗传模式不明确、不完全外显以及遗传异质性与临床异质性等诸多因素,使得大量研究结果难以相互验证。为了减少上述因素的影响,本课题基于DNA混合池技术结合全基因组微卫星(ABI Linkage Mapping Set-2)与人类全基因组单核苷酸多态性Affymetri6.0芯片(Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0)双重扫描结果,筛选出JARID2基因作为候选基因,利用高分辨率熔解曲线SNP分型和SNaPshot测序技术,证实了其在中国山东省东部地区人群中与精神分裂症存在关联。目的通过筛查与精神分裂症关联的染色体遗传位点,发现精神分裂症的易感基因。方法根据美国精神障碍诊断与统计手册第四版(DSM-Ⅳ)精神分裂症的诊断标准,排除器质性精神障碍及精神活性物质和非成瘾物质所致精神障碍,选取山东省潍坊地区精神分裂症患者119例与正常对照119例作为研究样本。采用高分辨率熔解曲线(High Resolution Melting)单核苷酸(SNP)分型技术与ABI的SNaPshot单核苷酸(SNP)分型技术相结合,检测分析了上述样本中JARID2基因9个SNP位点的等位基因、基因型与单倍型的频率分布,利用Haploview、UNPHASED、PLINK等遗传统计分析软件进行统计学分析。结果除rs2237158位点外,其余位点均符合哈迪-温伯格平衡检验。单核苷酸多态性位点rs2235258、rs9654600与rs9396590构成的单倍型ATA与精神分裂症关联(P=0.0393);rs9654600、rs9396590、rs2072821构成的单倍型TAC与精神分裂症相关(P=0.038);rs2235258、rs9654600、rs9396590及rs2072821构成4-SNP核心区域的单倍型ATAC也表现与精神分裂症显著相关(P=0.0165)。结论本研究结果支持JARID2基因为精神分裂症的易感基因。第二节儿童精神分裂症易感基因筛查精神分裂症也可在少年儿童期发病,称为儿童精神分裂症。儿童精神分裂症是一种不常见的精神疾病,早期阶段不易识别。起病于10岁以前者较少,10岁以后起病者显著增多。起病年龄最小者为3岁,一般以12～14岁少年占多数。与成人相比,儿童精神分裂症的患病率较低。目前,其病因尚未明了。有关儿童精神分裂症的易感基因筛查也仅局限于精神分裂症的易感基因范围,以至于还没有基因被定位。而本实验旨在进一步探讨YAP1基因是否与山东省儿童精神分裂症存在关联。目的通过筛查与儿童精神分裂症关联的位点,查找儿童精神分裂症易感基因。方法将全基因组扫描阳性结果锁定的YAP1基因作为候选基因,选取112个儿童精神分裂症家系(共316个体,其中核心家系91个)做为研究对象,针对YAP1基因的12个单核苷酸多态性位点采用高分辨率熔解曲线(High Resolution Melting)单核苷酸(SNP)分型技术和ABI的SNaPshot单核苷酸(SNP)分型技术进行基因分型。利用Haploview、UNPHASED、PLINK等遗传统计分析软件进行遗传统计分析。结果单核苷酸多态性位点rs7107909 (P=0.0312)及rs2846836(P=0.008)的等位基因传递不平衡呈现阳性,具有统计学意义。同时rs2282652和rs3858420构成的单倍型CG(P=0.0008)传递具有显著性差异。以这个2-SNP单倍体为核心,依次递加右侧相邻位点所构成的3-SNP、4-SNP, 5-SNP及6-SNP单倍型均表现为有显著性差异。表明这个区域范与儿童精神分裂症的病因有关。结论本研究结果提示YAP1基因可能是儿童精神分裂症的易感基因。

全文目录

摘要  4-6
Abstract  6-9
主要符号表  9-10
引言  10-11
第一章精神分裂症研究概论  11-23
  1.1 精神分裂症概述  11-13
  1.2 精神分裂症遗传学研究  13-16
  1.3 精神分裂症单核苷酸多态性及相关检测技术  16-23
第二章 JARID2 基因与精神分裂症关联分析  23-38
  2.1 研究背景介绍  23-24
  2.2 研究对象  24
  2.3 实验材料与仪器设备  24-26
  2.4 实验方法  26-33
  2.5 实验结果  33-36
  2.6 讨论  36-37
  2.7 结论  37-38
第三章 YAP1 基因与儿童精神分裂症传递不平衡分析  38-44
  3.1 研究背景介绍  38
  3.2 研究对象  38-39
  3.3 实验材料与仪器设备  39-41
  3.4 实验方法  41-42
  3.5 讨论  42-43
  3.6 结论  43-44
参考文献  44-60
附表  60-65
附图  65-75
综述  75-90
攻读学位期间参与的科研项目及发表文章目录  90-91
致谢  91

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