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新疆哈萨克族食管鳞癌miR-203基因甲基化改变及其意义
作 者: 王巍伟
导 师: 李锋
学 校: 石河子大学
专 业: 病理学与病理生理学
关键词: 食管鳞状细胞癌 miR-203基因 甲基化 基质辅助激光解析电离时间飞行质谱仪
分类号: R735.1
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
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内容摘要
目的:检测新疆哈萨克族食管鳞癌、癌旁非癌组织和正常食管粘膜中miR-203基因的甲基化状态,探讨miR-203基因甲基化与食管鳞癌之间的关系及其意义。方法:运用基质辅助激光解析电离时间飞行质谱仪(MALDI-TOF MS)检测99例新疆哈萨克族食管鳞癌、46例癌旁非癌组织和46例正常食管粘膜中miR-203基因甲基化状态。运用Cluster 3.0软件、TreeView软件对三组样本miR-203基因甲基化数据进行分层聚类分析。运用GraphPad Prism 5软件对三组样本miR-203基因甲基化数据进行分布状况分析。运用SPSS16.0软件对食管鳞癌/癌旁非癌组织/正常食管粘膜三组样本、ESCC临床病理学特征、HPV16感染间miR-203基因甲基化数据进行非参数秩和检验统计学分析。结果:1、食管鳞癌、癌旁非癌组织和正常食管粘膜三组miR-20315甲基化数据比较结果:新疆哈萨克族鳞癌、癌旁非癌组织中miR-20315呈高甲基化改变,且miR-20315有10个CpG单位(CpG7.8、CpG10、CpG11、CpG12、CpG14、CpG15.16、CpG17.18.19.20、CpG22.23、CpG24、CpG31.32)的高甲基化改变与新疆哈萨克族食管鳞癌的发生相关(p<0.05);而miR-20315有两个CpG单位(CpG10、CpG11)在食管鳞癌与癌旁非癌组织之间存在甲基化水平的差异(p<0.017),且这两个CpG单位的甲基化水平在癌旁非癌组织中较高。2、miR-20315甲基化与食管鳞癌临床病理学特征比较结果:与性别比较,miR-20315各CpG单位甲基化水平在两组间无差异性(p>0.05);与年龄相关性分析显示,CpG22.23甲基化水平与年龄呈止相关(p<0.05):与肿瘤发生部位比较,CpG 31.32甲基化水平在不同部位间存在差异性(p<0.05),且甲基化率比较:下段>中段>上段;与肿瘤大体类型比较,CpG24甲基化水平在不同类型间存在差异性(p<0.05);与肿瘤分化程度比较,CpG17.18.19.20甲基化水平在高、中、低分化程度间存在差异性(p<0.05)且甲基化率比较:中分化组>高分化组>低分化组;与淋巴结转移、TNM分期(Ⅰ期+Ⅱ期和Ⅲ期+Ⅳ期)比较,均无甲基化水平的差异性(p>0.05)。3、miR-20315甲基化与食管鳞癌HPV16感染比较结果:CpG15.16、CpG17.18.19.20在HPV16(+)组与HPV16(-)组之间存在甲基化水平差异性(p<0.05),且甲基化率比较:感染组>非感染组。结论:1、新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌与癌旁非癌组织miR-20315甲基化水平显著高于正常食管粘膜。2、新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌miR-20315有10个CpG单位(CpG7.8、CpG10、CpG11、CpG12、CpG14、CpG15.16、CpG17.18.19.20、CpG22.23、CpG24、CpG31.32)呈高甲基化改变,这种改变可能是新疆哈萨克族食管鳞癌发生的一个早期事件。3、新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌miR-20315有两个CpG单位(CpG15.16、CpG17.18.19.20)高甲基化改变与HPV16感染相关,两者可能协同作用共同参与新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌的发生、发展。
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全文目录
中文摘要 6-7 英文摘要 7-8 英文缩略语表 8-9 前言 9-11 材料与方法 11-29 1.材料 11-14 2.方法 14-29 2.1 临床病理学研究内容和方法 14 2.2 基因组DNA制备 14-16 2.3 HPV16检测 16-17 2.4 MALDI-TOF MS法甲基化检测 17-27 2.5 实验室质量控制 27 2.6 甲基化结果分析 27-29 结果 29-42 1.食管鳞癌临床病理学特征 29-30 2.食管鳞癌HPV16检测结果 30-31 3 miR-203_15甲基化检测结果 31-42 3.1 基因组DNA检测结果 31 3.2 miR-203_15 PCR扩增产物检测结果 31 3.3 EpiTYPER v1.0.5软件miR-203_15甲基化质谱数据分析结果 31-32 3.4 miR-203_15各CpG单位甲基化率分布结果 32-35 3.5 miR-203_15各CpG单位甲基化率非参数秩和检验比较结果 35-36 3.6 miR-203_15甲基化与食管鳞癌临床病理学特征之间关系分析结果 36-40 3.7 miR-203_15甲基化与食管鳞癌HPV16感染之间关系分析结果 40-42 讨论 42-48 结论 48-49 参考文献 49-52 文献综述 52-68 参考文献 63-68 附录 68-71 致谢 71-72 作者简介 72-73 石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表 73
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中图分类: > 医药、卫生 > 肿瘤学 > 消化系肿瘤 > 食管肿瘤
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