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加工番茄早熟及相关性状的QTL分析

作　者: 位江静
导　师: 薛琳；魏亦农
学　校: 石河子大学
专　业: 生物化学与分子生物学
关键词: 加工番茄 分子标记 遗传连锁图 早熟性 QTL定位
分类号: S641.2
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要


目的：早熟性加工番茄品种是新疆的重要资源。新疆光、热、水土资源得天独厚,所生产的番茄酱以品质优良而闻名于世,是目前全球三大加工番茄主产区之一由于新疆的无霜期短以及早霜严重威胁晚熟原料等气候特点,推广加工番茄早熟品种显得尤为重要。加工番茄的成熟期属于数量性状,这类性状由多基因控制,遗传基础较复杂。分子标记的应用使数量性状的研究取得了突破性进展。SSR(简单重复序列)标记是一种基于PCR技术的DNA标记,具有多态性丰富、稳定性高等特点。方法：本研究以“TD-13”和“TD-41杂交产生的202个F2：3家系为作图群体,采用SSR分子标记技术,利用Joinmap3.0和MapQTL5.0软件构建了一张加工番茄遗传连锁图谱,对加工番茄早熟性基因进行了初步QTL定位分析。结果：1.通过对亲本及F2：3家系各生育期性状进行统计分析表明,各个生育期性状均符合正态分布,呈现数量性状的遗传特点。通过对各生育期性状相关性分析表明,成熟期与始花期,始花节位,结果期,开花至成熟天数呈极显著正相关,始花期与开花至成熟天数,早期结果数呈极显著负相关；平均单果重与始花期成显著正相关,与结果期和早期结果数呈负相关。2.利用500对番茄SSR引物对两亲本进行多态性筛选,得到123对具有多态性的SSR引物。利用这些多态性引物分析202个F2群体及F2：3家系单株的基因,共得到75个分子标记。利用Joinmap3.0软件对这75个标记进行连锁分析,最后有54个标记进入2个连锁群。其中一个连锁群包含52个多态性标记,另一个连锁群包含2个多态性标记。该连锁群标记间的最小遗传距离为0.17 cM,最大遗传距离为41 cM,总长为158cM,平均图距为2.87cM,基本可以满足QTL定位的要求。3.利用软件MapQTL5.0,用复合区间作图法进行QTL检测,共检测到12个QTLs。在F2群体中检测到2个QTLs,关于始花期和平均单果重的QTL各检测到1个。F2：3家系中检测到10个,其中控制始花期的QTLs检测到2个,控制始花节位的QTLs检测到3个,均位于SSR40a附近,控制成熟期的QTLs检测到2个,控制开花至成熟天数、早期结果数和平均单果重的QTL分别检测到1个结论：本研究利用两年时间调查加工番茄各生育期性状,通过MapQTL5.0发现了与加工番茄早熟性相关的QTL密集区域,在LEaat006-LEat016区间附近分别检测到了与始花节位,成熟期,早期结果数,开花至成熟天数相关的QTLs。

全文目录


摘要  5-6
Abstract  6-7
目录  7-9
缩略词表  9-10
前言  10-11
第一章 文献综述  11-23
  1.1 加工番茄早熟性研究现状及进展  11-14
    1.1.1 加工番茄早熟性的测定方法  12
    1.1.2 番茄早熟性的遗传  12-13
    1.1.3 番茄早熟性与早期产量相关  13
    1.1.4 番茄早熟性与其他性状相关  13-14
  1.2 分子标记主要类型与特点  14-17
    1.2.1 RFLP标记  14-15
    1.2.2 RAPD标记  15
    1.2.3 AFLP标记  15-16
    1.2.4 SSR标记  16
    1.2.5 其他分子标记  16-17
  1.3 QTL分析的原理与方法  17-20
    1.3.1 QTL作图群体的类型和特点  17-18
    1.3.2 QTL定位的原理  18
    1.3.3 QTL定位的方法  18-20
  1.4 番茄分子连锁图谱的构建及QTL定位  20-23
    1.4.1 番茄分子连锁图谱的构建  20-21
    1.4.2 与番茄相关基因的QTL定位  21-23
第二章 材料和方法  23-28
  2.1 实验材料和遗传连锁群体的构建  23
  2.2 性状考  23
  2.3 室内实验  23-26
    2.3.1 DNA的提取  23-24
    2.3.2 SSR标记分析  24-26
    2.3.3 亲本多态性引物筛选及群体检测  26
  2.4 数据整理和分析  26
  2.5 遗传连锁图谱的构建  26-27
  2.6 QTL分析  27-28
第三章 结果与分析  28-38
  3.1 亲本、F_2群体及F_(2:3)家系的性状表现  28-30
  3.2 各生育期性状的相关性分析  30-31
  3.3 DNA提取情况  31
  3.4 多态性引物的筛选及标记的偏分离情况  31-33
  3.5 遗传连锁图谱的构建  33
  3.6 QTL定位结果及分析  33-38
第四章 讨论  38-40
  4.1 作图群体  38
  4.2 加工番茄遗传连锁图谱的构建  38-39
  4.3 偏分离标记分析  39
  4.4 早熟性状的QTL分析  39-40
第五章 结论  40-41
参考文献  41-46
附录  46-48
致谢  48-49
作者简介  49-50
导师评阅表  50

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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 蔬菜园艺 > 茄果类 > 番茄（西红柿）
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