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固始—安卡鸡F_2群体生长性状的微卫星标记连锁分析

作　者: 杨菊凤
导　师: 代江生；康相涛
学　校: 石河子大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 鸡微卫星生长性状连锁分析多重比较
分类号: S831
类　型: 硕士论文
年　份: 2008年
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内容摘要

本研究利用26个微卫星标记分析了固始鸡和安卡鸡为亲本制备的F2代分离群体共686个个体各标记座位的等位基因数、基因频率、杂合度和多态信息含量,同时测定F2群体的27项生长性状指标,对其进行描述性统计分析和相关性分析,采用方差分析法对标记与性状进行连锁分析,并对性状连锁的同一标记不同基因型作多重比较,试验结果如下:1、对27项生长性状描述性分析结果表明,群体内个体间存在较大的差异,适于进行标记-QTL的连锁分析。2、从已发表的三个参考家系的遗传图谱中选取26个微卫星标记,合成引物对F2群体进行PCR扩增,12%变性聚丙酰胺凝胶电泳分型,结果表明:各座位均表现出不同程度的多态,平均等位基因数约5个,最多的ADL326为6个,最少的MCW120为3个,平均杂合度为0.7730,平均多态信息含量为0.6180.3、采用方差分析法对26个多态性座位与27项生长性状间进行连锁分析,结果表明:26个多态性座位中共检测到16个与不同的生长性状存在相关关系,具有较高的检测效率。它们分别为ADL716、MCW062、MCW236、ADL166、ADL326、ADL298、MCW166、MCW157、ADL267、MCW120、LEI147、LEI070、LEI077、ADL169、MCW193和ADL146。4、微卫星标记与27项生长性状间方差结果表明:ADL176座位可能与4周龄体重、胫长、胸深,8周龄胸骨长、体斜长、盆骨宽连锁;MCW120座位可能与4周龄胸骨长、体斜长、盆骨宽,8周龄胸骨长、胫围连锁;MCW062座位可能与4周龄胸深、胸角,8周龄胫长、12周龄胸角连锁;ADL267座位可能与8周龄胫长、4周龄胸骨长4周龄骨盆宽连锁;LEI147座位可能与4周龄胫长、胸深、骨盆宽、8周龄胫长、体斜长和12周龄胫围连锁;LEI070座位可能与4周龄胫长、胸深、8周龄胫长、胫围、胸角、体斜长,12周龄体重连锁;MCW166座位可能与4周龄体重、胸角、骨盆宽;8周龄胫长、胫围、体斜长;12周龄体重、胫长、胫围、体斜长连锁;ADL146座位可能与4周龄体重、胫围、体斜长连锁;MCW157座位可能与4周龄体斜长、12周龄胸深、盆骨宽连锁; ADL298座位可能与8周龄胫围、胸宽、体斜长连锁;ADL326座位可能与4周龄体重、8周龄体重、12周龄胸骨长、盆骨宽连锁;MCW236座位可能与4周龄胫长、胸深、胸宽、8周龄胫长、胸骨长、12周龄胸宽连锁;ADL169座位可能与4周龄体重、胫长、胫围和8周龄体重连锁。5、与性状连锁的同一标记不同基因型间作多重比较,结果表明:标记MCW120中的BC型对8周龄胫围、胸骨长,4周龄盆骨宽显著影响;标记ADL176中的AD型对4周龄体重、8周龄体斜长影响显著,CC型对8周龄胸宽、胸骨长、盆骨宽影响显著,CD型对4周龄胸深影响显著;标记MCW062中的CC型对4周龄胸深、胸角影响显著,BD型对12周龄胸角影响显著,AA型对8周龄胫长影响显著;标记ADL267基因型中的CD型对4周龄胸骨长、盆骨宽影响显著,BD型对8周龄胫长影响显著;标记LEI147基因型中的BB型对4周龄胫长、胸深、盆骨宽影响显著;标记MCW166基因型中的AB型对4、12周龄体重、8、12周龄胫长、12周龄胫围、体斜长、8周龄体斜长影响显著;标记LEI070基因型中的AD型对12周龄体重、胫围、胸角、体斜长,4、8周龄胫长、4周龄胸深影响显著;标记ADL146中的AA型对4周龄体重、体斜长影响显著;标记MCW193基因型中的AC型对4周龄胫长影响显著;标记LEI070基因型中的BC型对8周龄胫长、8、12周龄体斜长影响显著;标记ADL166各基因型中的BB型对4周龄体重、胫围、盆骨宽影响显著;标记ADL326中的AC型对12周龄胸骨长、盆骨宽影响显著;标记MCW236中的BD型对4、5周龄胫长、4周龄胸深、12周龄胸宽影响显著;标记ADL169中的AD型对4周龄体重、胫围影响显著,CD型对4周龄胫长影响显著。

全文目录

摘要  5-6
Abstract  6-8
英文缩写一览表  8-12
引言  12-13
1 文献综述  13-30
  1.1 鸡的分类学及分子生物学进展  13
  1.2 鸡的研究意义  13-14
  1.3 鸡基因组结构与特征  14
    1.3.1 鸡基因组结构及大小  14
    1.3.2 重复序列  14
  1.4 遗传标记的类型及特性  14-22
    1.4.1 传统遗传标记  15
    1.4.2 DNA 分子标记  15-18
    1.4.3 微卫星 DNA 标记在畜禽遗传育种中的应用  18-22
  1.5 鸡基因组研究进展  22-25
    1.5.1 鸡基因组  22
    1.5.2 基因组图谱  22-24
    1.5.3 鸡的基因组测序及功能基因组研究  24-25
  1.6 鸡的数量性状及遗传基础  25-29
    1.6.1 数量性状及其遗传基础  26-27
    1.6.2 数量性状基因座（QTL）定位  27-28
    1.6.3 鸡QTL 定位  28-29
  1.7 数量性状与标记间的连锁分析方法  29-30
2 材料与方法  30-35
  2.1 试验材料  30-31
    2.1.1 F2 代资源群体的制备  30-31
    2.1.2 主要试剂及配制  31
  2.2 实验方法  31-33
    2.2.1 引物的合成与选择  31
    2.2.2 试验鸡性状观测指标  31-32
    2.2.3 鸡的体型参数的测定  32
    2.2.4 表型数据处理  32
    2.2.5 连锁分析的软件  32
    2.2.6 血样的采集  32
    2.2.7 基因组DNA 抽提  32
    2.2.8 PCR 扩增  32-33
    2.2.9 PCR 产物的检测  33
  2.3 统计分析  33-35
    2.3.1 群体等位基因频率  33-34
    2.3.2 多态信息含量  34
    2.3.3 群体平均杂合度(Heterozygosity,H)  34
    2.3.4 统计分析方法  34-35
3 结果与分析  35-52
  3.1 扩增产物的电泳结果  35-37
  3.2 F2 代群体的性状描述性统计值  37
  3.3 各标记座位等位基因、等位基因频率、杂合度及多态信息含量  37-38
  3.4 方差分析结果  38-42
  3.5 与性状关联显著的标记座位的多重比较  42-52
    3.5.1 标记ADL176 座位的多重比较  42-43
    3.5.2 标记MCW120 座位的多重比较分析  43
    3.5.3 标记MCW062 座位的多重比较分析  43-44
    3.5.4 标记ADL267 座位的多重比较分析  44
    3.5.5 标记LE1147 座位的多重比较分析  44-45
    3.5.6 标记LE1070 座位的多重比较分析  45
    3.5.7 标记MCW166 座位的多重比较分析  45-46
    3.5.8 标记ADL146 座位的多重比较分析  46-47
    3.5.9 标记MCW157 座位的多重比较分析  47
    3.5.10 标记MCW193 座位的多重比较分析  47-48
    3.5.11 标记LE1077 座位的多重比较分析  48
    3.5.12 标记ADL166 座位的多重比较分析  48-49
    3.5.13 标记 ADL298 座位的多重比较分析  49
    3.5.14 标记 ADL326 座位的多重比较分析  49-50
    3.5.15 标记 MCW236 座位的多重比较分析  50
    3.5.16 标记 ADL169 座位的多重比较分析  50-52
4 结果与讨论  52-56
  4.1 标记-QTL 连锁分析的试验设计  52
  4.2 微卫星标记的相关分析  52-53
  4.3 标记与性状间的方差分析  53-54
  4.4 关于性状关联显著的标记不同基因型间的多重比较  54
  4.5 方差分析方法和标记辅助选择  54-56
5 结论  56-58
6 展望  58-59
参考文献  59-64
致谢  64-65
作者简介  65-66
石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表  66

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