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K.pneumoniae XJPD-Li甘油脱水酶高效催化特性的研究
作 者: 吕波
导 师: 李春
学 校: 石河子大学
专 业: 农产品加工及贮藏工程
关键词: 甘油脱水酶 定点突变 1,3-丙二醇 yqhD K. pneumoniae XJPD-Li
分类号: Q814
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
下 载: 9次
引 用: 1次
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内容摘要
利用甘油或葡萄糖等可再生资源为原料生物合成1,3-丙二醇(1,3-PD)具有生产清洁、对环境无污染的“绿色化学”特征,符合21世纪可持续发展的需要。课题组前期筛选的菌株Klebsiella pneumoniae XJPD-Li具有在较高的温度(40℃),较高的pH(8.0)下,高效、快速的合成1,3-丙二醇的特点。本论文通过对Klebsiella pneumoniae XJPD-Li合成1,3-丙二醇关键酶基因的克隆、表达以及定点突变,研究了甘油脱水酶高效催化的特性,得到以下结果:1.利用PCR方法从K. pneumoniae XJPD-Li总DNA中成功克隆了甘油脱水酶基因片段并构建了表达载体pET28a-dhaBCE。在1.0mmIPTG,30℃条件诱导5小时,成功表达重组甘油脱水酶。重组甘油脱水酶催化反应的最适反应温度为45℃、最适pH为8.0,比酶活为40.2U·mg-1,约为原始菌株的80倍。序列比对发现与Genbank中报道的K. pneumoniae甘油脱水酶(U60992)基因相似性为99.48%,氨基酸相似性为99.55%。2.利用大引物PCR法和质粒快速突变方法将K. pneumoniae XJPD-Li甘油脱水酶α亚基上差异氨基酸进行突变,成功构建了突变体M193α(S193C)、M407α(E40A),在1.0mmIPTG,30℃条件诱导5小时条件下,M193α甘油脱水酶催化反应最适温度为45℃、最适pH为8.0,比酶活是37.8 U·mg-1;M407α最适反应温度为40℃,与原酶相比下降了5℃,最适pH为8.0,比酶活是14.7 U·mg-1,是原酶的36.6%。3.利用质粒快速突变方法,对K. pneumoniae XJPD-Li重组甘油脱水酶中β亚基上差异氨基酸进行突变。成功构建了突变体M47β(N47I)、M189β(V189I),在1.0mmIPTG,30℃条件诱导5小时条件下,M47β和M189β甘油脱水酶比酶活分别为38.7U·mg-1和39.2 U·mg-1,与突变前重组甘油脱水酶比酶活接近。M47β和M189β甘油脱水酶最适温度分别为40℃和45℃,最适pH均为8.0,与未突变重组菌相比,M47β催化反应最适温度下降了约5度。4.利用PCR方法从E.coli K-12中成功克隆了yqhD基因并与表达载体pET28a-dhaBCE串联表达,蛋白电泳分析表明在61KD,43KD,24KD和16KD处出现特征条带。通过对Klebsiella pneumoniae XJPD-Li甘油脱水酶基因的克隆表达及其定点突变研究,为研究甘油脱水酶高效催化机理提供依据,也为甘油脱水酶定向进化提供理论指导。
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全文目录
摘要 5-6 Abstract 6-11 前言 11-12 第1章 文献综述 12-30 1.1 1,3-丙二醇概述 12-15 1.1.1 1,3-丙二醇的基本性质 12 1.1.2 1,3-丙二醇的主要用途 12-14 1.1.3 1,3-丙二醇的生产概况 14-15 1.2 生物法合成1,3-丙二醇的研究进展 15-19 1.2.1 生物合成1,3-丙二醇的菌种和生产能力 15-16 1.2.2 生物合成1,3-丙二醇的代谢途径 16-18 1.2.3 生物合成1,3-丙二醇的基因工程生产情况 18-19 1.3 1,3-PD 生物合成途径中的关键酶 19-25 1.3.1 甘油脱水酶的研究进展 20-22 1.3.2 甘油脱水酶的催化机理 22 1.3.3 甘油脱水酶的失活研究情况 22-23 1.3.4 甘油脱水酶的克隆表达研究情况 23 1.3.5 1,3-丙二醇氧化还原酶的研究进展 23-25 1.4 体外定点突变技术研究进展 25-28 1.5 论文的研究意义和技术框架 28-30 1.5.1 论文研究的意义 28-29 1.5.2 论文研究的技术框架 29-30 第2章 材料与方法 30-40 2.1 材料 30-33 2.1.1 菌种和质粒 30 2.1.2 培养基 30-31 2.1.3 仪器 31-32 2.1.4 试剂 32-33 2.2 方法 33-37 2.2.1 细菌总DNA 的提取 33 2.2.2 质粒DNA 的提取 33 2.2.3 PCR 产物的回收方法 33 2.2.4 PCR 产物与表达载体的连接 33-34 2.2.5 热击用大肠杆菌感受态细胞的制备 34 2.2.6 连接产物对大肠杆菌感受态细胞的转化 34 2.2.7 阳性克隆的筛选和鉴定 34-35 2.2.8 重组菌的诱导表达 35 2.2.9 蛋白质SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳 35 2.2.10 定点突变方法 35-37 2.3 分析方法 37-40 2.3.1 菌体生物量的测定 37 2.3.2 蛋白质浓度的测定 37 2.3.3 丙醛浓度的测定 37-38 2.3.4 甘油脱水酶活性的测定 38-40 第3章 K. pneumoniae XJPD-Li 甘油脱水酶的克隆与表达 40-48 3.1 引言 40 3.2 甘油脱水酶基因的克隆与鉴定 40-44 3.2.1 甘油脱水酶基因的扩增 41-42 3.2.2 甘油脱水酶表达质粒pET-28a(+)-dhaBCE 的构建 42-44 3.3 甘油脱水酶基因的序列分析 44 3.4 重组质粒pET-28a(+)-dhaBCE 在E.coli BL21(DE3)中诱导表达 44-45 3.5 重组甘油脱水酶dhaBCE 最适pH 值的测定 45-46 3.6 重组甘油脱水酶dhaBCE 最适温度的测定 46 3.7 小结 46-48 第4章 K. pneumoniae XJPD-Li 甘油脱水酶α亚基的突变研究 48-60 4.1 引言 48 4.2 突变设计的引物与策略 48-50 4.3 甘油脱水酶突变体M193α的构建与验证 50-54 4.4 甘油脱水酶突变体M407 α的构建与验证 54-56 4.5 突变体M193α、M407α在E.coli BL21(DE3)中诱导表达 56 4.6 突变体M193α、M407α甘油脱水酶最适pH 值的测定 56-57 4.7 突变体M193α、M407α甘油脱水酶最适温度测定 57-58 4.8 小结 58-60 第5章 K. pneumoniae XJPD-Li 甘油脱水酶β亚基的突变研究 60-68 5.1 引言 60 5.2 突变设计的引物与策略 60-61 5.3 甘油脱水酶突变体M47β的构建与验证 61-63 5.4 甘油脱水酶突变体M189β的构建与验证 63-65 5.5 突变体M47β、M189β在E.coli BL21(DE3)中诱导表达 65 5.6 突变体M47β、M189β甘油脱水酶最适pH 值的测定 65-66 5.7 突变体M47β、M189β甘油脱水酶最适温度测定 66 5.8 小结 66-68 第6章 dhaBCE 基因与yqhD 基因串联表达载体的构建 68-74 6.1 引言 68 6.2 yqhD 基因的克隆及鉴定 68-71 6.2.1 yqhD 基因扩增引物 69 6.2.2 yqhD 基因扩增 69-70 6.2.3 yqhD 基因的克隆及鉴定 70-71 6.3 重组质粒pET-dhaBCE-yqhD 的构建 71-73 6.3.1 重组质粒pET-dhaBCE-yqhD 载体的构建 72 6.3.2 重组质粒pET-dhaBCE-yqhD 基因的诱导表达 72-73 6.4 小结 73-74 第7章 结论与展望 74-76 7.1 结论 74-75 7.2 展望 75-76 参考文献 76-82 附录A 硅胶膜质粒DNA 小量提取 82-83 附录B 多功能DNA 纯化回收试剂盒 83-84 附录C 质粒快速鉴定法筛选重组菌株 84-85 附录C yqhD 测序结果 85-86 致谢 86-87 作者简介 87-88 附表 88
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中图分类: > 生物科学 > 生物工程学(生物技术) > 酶工程
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