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鹅掌楸近交子代群体的遗传分析
作 者: 姚俊修
导 师: 李火根
学 校: 南京林业大学
专 业: 遗传学
关键词: 鹅掌楸 SSR 遗传多样性 饱满度 出苗率 纯合位点 近交衰退
分类号: S792.21
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
下 载: 30次
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内容摘要
异交物种易发生近交衰退。鹅掌楸为濒危树种,现存种群规模小,其天然种群更新可能受到近交衰退的影响,因此,开展鹅掌楸近交子代遗传分析对于了解鹅掌楸濒危机制有重要意义,同时,对于鹅掌楸杂交育种及种子园管理也具有实践价值。本文以鹅掌楸属树种不同交配类型子代为材料,从种子饱满度、出苗率、苗期生长量、遗传多样性、纯合位点百分率等方面进行比较分析,估算鹅掌楸近交衰退程度。主要结论如下:种子饱满度及出苗率在不同母本间、交配类型间、交配类型内组合间差异均达到了极显著水平。种内交配子代种子饱满度与出苗率均最高,种内交配子代饱满度平均高出种间杂交、回交交配、自交组合的33.30%、89.02%、612%;出苗率平均高出90.56%、119%、362%,不同交配类型子代饱满度、出苗率有相同的变异趋势:种内>种间>回交>自交。在苗高和地径性状上,交配类型间、交配类型内组合间差异均达极显著水平。种间交配子代在两性状上均最高,种间交配子代地径平均高出自交组合、回交交配、种内组合分别为7.98%、19.73%、91.30%;苗高平均高出9.59%、36.70%、47.45%,不同交配类型子代地径与苗高变异趋势为:种间>自交>回交>种内。12对SSR引物对27个交配组合进行遗传多样性分析,以观测杂合度和shannon多样性指数为指标,种间群体均最高,Ho平均高出回交群体、种内群体、自交群体的17.99%、27.75%、269%;shannon多样性指数平均高出5.22%、13.34%、19.77%;遗传多样性变异趋势:种间>回交>种内>自交。自交子代的纯合位点百分率最高为76.82%,分别高出种内群体、回交群体,种间群体的1.04倍、1.37倍、2.73倍;由此推算出鹅掌楸、北美鹅掌楸亲本的平均基因杂合度分别为42.72%、47.62%。综上所述,与种内及种间交配子代相比较,鹅掌楸近交子代在种子饱满度、出苗率、遗传多样性、纯合位点百分率等方面均存在不同程度的衰退,但对于苗期生长量,近交衰退不明显。
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全文目录
致谢 3-4 摘要 4-5 Abstract 5-11 第一章 文献综述 11-19 1.1 植物交配系统 11-13 1.1.1 植物交配系统概念及类型 11 1.1.2 植物交配系统研究内容及方法 11-12 1.1.2.1 植物交配系统研究内容 11-12 1.1.2.2 植物交配系统研究方法 12 1.1.3 植物交配系统中的交配事件 12-13 1.1.4 濒危植物交配系统及其保护与繁育 13 1.2 植物近交衰退研究 13-16 1.2.1 近交衰退的概念 14 1.2.2 近交衰退的原因 14 1.2.3 近交的遗传效应 14-15 1.2.4 关于近交衰退的假说 15 1.2.5 近交衰退的检测 15-16 1.2.6 近交衰退的研究展望 16 1.3 鹅掌楸属树种交配系统与保护机制 16-18 1.3.1 鹅掌楸属交配系统研究 17 1.3.2 鹅掌楸属树种的保护机制 17-18 1.4 本研究的目的及意义 18-19 第二章 鹅掌楸不同交配组合种子活力 19-26 2.1 试验材料与方法 19-20 2.1.1 试验材料 19 2.1.2 试验方法 19-20 2.1.2.1 种子饱满度的测定 19-20 2.1.2.2 种子出苗率的测定 20 2.1.2.3 种子饱满度与出苗率方差分析模型 20 2.2 结果与分析 20-25 2.2.1 鹅掌楸不同交配组合的饱满度及出苗率 20-21 2.2.2 鹅掌楸不同母本种子饱满度及出苗率比较 21-22 2.2.3 鹅掌楸不同交配类型种子饱满度及出苗率比较 22 2.2.4 鹅掌楸不同母本及组合间种子饱满度及出苗率方差分析 22-23 2.2.5 交配类型间及交配类型内组合间种子饱满度及出苗率方差分析 23 2.2.6 鹅掌楸近交子代种子饱满度与出苗率的比较 23-24 2.2.7 鹅掌楸种子饱满度与出苗率相关性分析 24-25 2.3 讨论 25-26 2.3.1 鹅掌楸不同交配类型种子饱满度与出苗率 25 2.3.2 鹅掌楸不同交配组合种子饱满度与出苗率相关性 25 2.3.3 鹅掌楸自交组合种子饱满度与出苗率 25-26 第三章 鹅掌楸近交子代苗期生长表型变异 26-34 3.1 材料与方法 26-27 3.1.1 试验材料 26 3.1.2 试验方法 26 3.1.3 统计分析方法 26-27 3.2 结果与分析 27-32 3.2.1 鹅掌楸不同交配组合苗期生长量变异 27-28 3.2.2 鹅掌楸近交子代生长性状方差分析 28 3.2.3 鹅掌楸不同交配类型苗期生长量比较 28-29 3.2.4 鹅掌楸不同交配组合子代苗期生长量的多重比较 29-32 3.3 讨论 32-34 3.3.1 鹅掌楸不同交配类型子代生长量与近交衰退 32 3.3.2 鹅掌楸不同交配类型子代变异系数 32-33 3.3.3 鹅掌楸近交组合子代生长量变异分析 33-34 第四章 鹅掌楸近交子代遗传多样性 34-49 4.1 试验材料:同第三章 34 4.2 试验方法 34-38 4.2.1 总的DNA 的提取(CTAB—硅珠法) 34 4.2.2 总DNA 的纯化 34-35 4.2.3 DNA 质量的检测 35 4.2.4 引物来源 35 4.2.5 SSR 引物筛选与PCR 扩增反应 35-36 4.2.6 电泳检测(聚丙烯酰胺变性凝胶电泳) 36-37 4.2.7 数据分析 37-38 4.3 结果与分析 38-46 4.3.1 鹅掌楸交配亲本间遗传距离 38 4.3.2 鹅掌楸不同回交子代遗传多样性 38-40 4.3.3 鹅掌楸不同自交子代遗传多样性 40-42 4.3.4 鹅掌楸正反交子代遗传多样性的比较 42 4.3.5 鹅掌楸近交子代固定指数分析 42-44 4.3.6 正反交的固定指数分析 44 4.3.7 鹅掌楸不同交配类型遗传多样性分析 44 4.3.8 鹅掌楸不同交配类型固定指数及Fst 分析 44-45 4.3.9 鹅掌楸交配亲本间遗传距离与子代遗传多样性的相关性 45-46 4.4 讨论 46-49 4.4.1 实验过程影响条带判读的因素 46 4.4.2 SSR 引物的选择 46 4.4.3 鹅掌楸近交子代遗传多样性比较 46-47 4.4.4 鹅掌楸正反交子代多样性比较 47-48 4.4.5 鹅掌楸近交子代F-统计量分析 48 4.4.6 鹅掌楸各交配类型子代遗传多样性比较 48-49 第五章 鹅掌楸近交子代纯合位点比率 49-58 5.1 试验材料与方法 49 5.1.1 试验材料 49 5.1.2 试验方法 49 5.2 结果与分析 49-55 5.2.1 鹅掌楸、北美鹅掌楸交配亲本杂合度 49-50 5.2.2 鹅掌楸回交子代在不同位点中纯合位点百分率比较 50 5.2.3 鹅掌楸自交子代在不同位点中纯合位点百分率比较 50-51 5.2.4 鹅掌楸不同交配组合纯合位点百分率变异分析 51-53 5.2.5 鹅掌楸不同交配类型子代纯合位点百分率变异分析 53 5.2.6 鹅掌楸不同交配类型子代纯合位点百分率的方差分析 53-54 5.2.7 鹅掌楸回交子代纯合位点百分率的方差分析 54 5.2.8 鹅掌楸不同交配组合子代纯合位点比例多重比较 54-55 5.3 讨论 55-58 5.3.1 子代纯合位点百分率、遗传多样性与近交衰退 55-56 5.3.2 鹅掌楸、北美鹅掌楸亲本杂合度 56 5.3.3 纯合位点百分率与物种稳定性和一致性 56-58 第六章 主要研究结论及进一步研究展望 58-62 6.1 主要研究结论 58-60 6.1.1 鹅掌楸不同交配类型种子饱满度及出苗率变异 58 6.1.2 鹅掌楸近交子代苗期生长变异 58 6.1.3 鹅掌楸不同交配类型生长量变异 58-59 6.1.4 鹅掌楸近交子代不同SSR 位点遗传多样性 59 6.1.5 鹅掌楸不同交配类型与子代遗传多样性的关系 59 6.1.6 子代鹅掌楸遗传多样性与亲本间遗传距离的关系 59 6.1.7 鹅掌楸正反交子代纯合位点百分率变异 59-60 6.1.8 鹅掌楸不同交配类型子代纯合位点百分率变异分析 60 6.2 创新点 60 6.3 进一步研究展望 60-62 6.3.1 同一母本鹅掌楸不同交配类型子代种子活力变异 60 6.3.2 近交子代纯合位点比例变异 60-61 6.3.3 近交子代群体的表型变异 61-62 参考文献 62-65 详细摘要 65-68
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中图分类: > 农业科学 > 林业 > 森林树种 > 阔叶乔木 > 鹅掌楸
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