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泛发性色素异常症致病基因的分离与功能分析
作 者: 王娜
导 师: 张福仁
学 校: 济南大学
专 业: 皮肤病与性病学
关键词: 泛发型色素异常 遗传异质性 致病基因 连锁分析 外显子测序
分类号: R758.54
类 型: 硕士论文
年 份: 2013年
下 载: 3次
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内容摘要
研究背景:泛发性色素异常症(dyschromatosis universalis hereditaria, DUH)是一种少见的孟德尔遗传性皮肤病,临床上以全身泛发性色素异常伴多系统损害为特征。该病具有高度的遗传异质性,2003年贺林等首次将显性遗传DUH的致病基因定位在6q24.2~q25.2区域,隐性遗传DUH的致病基因定位在12q21~q23区域,其致病基因尚未分离,目前课题组在一个泛发性色素异常症家系中应用全基因组连锁分析,已经将共分离区域定位在2号染色体区间内,这就更提示该病具有很强的遗传异质性。实验目的:①采用全基因组连锁分析及外显子测序相结合的方式,分离DUH的致病基因。②通过表达及其亚细胞定位结合模式、生物斑马鱼体内实验检测致病变异在疾病发生发展过程中的作用,阐述疾病的发病机理。实验方法:①应用Illumina-660K_Beadchips芯片技术对这12个样本进行全基因组分型,应用Merlin软件进行连锁分析;采用Agilent最新的外显子捕获试剂盒;②进行外显子捕获;信息获得后生物信息分析,筛选候选致病变异;③采用Sanger测序法进一步验证,检测基因突变位点。④利用RT-PCR、免疫组织化学和模式动物斑马鱼等实验技术手段,分析致病基因的表达水平,对其功能进行初步探索。实验结果:连锁分析与外显子测序结果分析找到的13个可能的致病变异比对,经Sanger测序验证后筛选致病基因ABCB6,RT-PCR、免疫组织化学和模式动物等实验表明ABCB6是DUH的致病基因。
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全文目录
导师简介 5-6 目录 6-8 摘要 8-9 Abstract 9-10 英文缩略词表 10-11 1.前言 11-14 2.实验材料与方法 14-25 2.1 研究对象 14 2.2 实验试剂 14-15 2.3 实验相关器材 15-17 2.4 分析软件和电子数据库查询信息 17 2.5 实验方法 17-25 2.5.1 全血标本采集 17 2.5.2 基因组 DNA 的提取 17-18 2.5.3 连锁分析 18 2.5.4 外显子测序 18 2.5.5 生物信息分析筛选致病变异 18-19 2.5.6 对初筛位点的 Sanger 验证 19-23 2.5.7 相关基因的功能分析 23-25 3.实验结果 25-30 3.1 病例资料 25 3.2 连锁分析结果 25-26 3.3 外显子测序及数据分析 26-27 3.4 Sanger 测序验证结果 27 3.5 实时定量 PCR 结果 27-28 3.6 免疫组织化学染色结果 28-29 3.7 模式动物斑马鱼实验结果 29-30 4.讨论 30-31 5.结论 31-32 参考文献 32-35 附录 35-36 综述 36-40 主要参考文献 38-40 攻读学位期间发表的学术论文 40-41 发表论文 41-78 1. Detection of the STS gene in a family with X-Linked Recessive Ichthyosis disease 《Indian Journal of Dermatology, venerology and Leprology》 41-43 2. Identification of IL18RAP/IL18R1 and IL12B as leprosy risk genes demonstrates shared pathogenesis between inflammation and infectious diseases......《Am J Hum Genet.》 43-50 3. Genome-wide linkage, Exome sequencing and functional analyses identify ABCB6 as the pathogenic gene of dyschromatosis universalis hereditaria............《J Invest Dermatol.》 50-67 4. Evaluation of colloid milium by in vivo reflectance confocal microscopy 《J Eur Acad Dermatol Venereol》 67-69 5. 播散性复发性漏斗部毛囊炎 1 例 《中国麻风皮肤病杂志》 69-71 6. 色素沉着-息肉综合征1例《中国麻风皮肤病杂志》 71-75 7. 复发性多软骨炎 1 例《中国麻风皮肤病杂志》 75-78 在校期间所受奖励 78-79 致谢 79
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