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肺鳞癌及其淋巴结转移的差异蛋白质组学研究

作　者: 谭锋维
导　师: 赫捷
学　校: 北京协和医学院
专　业: 临床医学
关键词: 肺鳞癌蛋白质组学 2D-DIGE 质谱 MALDI-TOF/TOF
分类号: R734.2
类　型: 博士论文
年　份: 2009年
下　载: 7次
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内容摘要

肺癌是当今全世界发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一。每年全球大约有120万新发肺癌病例,占所有新发恶性肿瘤病例的15%,而其死亡人数占到恶性肿瘤死亡数的30%。尽管有关肺癌的研究不断取得进展,但肺癌的治疗效果至今难以令人满意。目前,肺癌的总体5年生存率为15%,在我国则低于10%。开发更加敏感的早期诊断方法和更加有效的治疗靶点是提高肺癌诊治水平的重要发展方向。利用分子生物学手段筛选肺癌发生、发展、转移过程中的特异性表达蛋白,可以揭示肿瘤相关分子机制、开发诊断和治疗的新靶点。蛋白质组学作为全面分析蛋白质表达变化的有力研究工具,已广泛应用到疾病特别是肿瘤研究之中。2D-DIGE的出现是蛋白质组学的一个重要进展。它可以对生物样品之间的蛋白质差异表达值提供准确和重复性好的分析。本研究运用2D-DIGE系统分析了12对肺鳞癌(其中6例有淋巴结转移,6例无淋巴结转移)癌组织和相应癌旁组织的差异表达蛋白,并利用MALDI-TOF/TOF 质谱对部分差异表达蛋白进行了鉴定。将肺鳞癌组织与相应癌旁组织进行差异分析,得到66个癌组织中显著上调(Ratio癌,癌旁≥2,p≤0.01)蛋白位点和99个显著下调(Ratio癌,癌旁≤-2,p≤0.01)蛋白位点。通过切胶回收和质谱分析,在这165个差异表达位点中鉴定出了22种肿瘤高表达蛋白和19种低表达蛋白。将有淋巴结转移和无淋巴结转移的癌组织进行差异分析,得到24个在伴有淋巴结转移的肺鳞癌组织中显著上调(Ratio有转移癌/无转移癌≥1.5,p≤0.05)蛋白位点和20个显著下调(Ratio有转移癌/无转移癌≤-1.5,p-0.05)蛋白位点。通过切胶回收和质谱分析,在这44个差异表达位点中鉴定出了8种淋巴结转移相关高表达蛋白和9种低表达蛋白。通过Swiss-prot蛋白库的注释信息对得到鉴定的41种肿瘤发生相关的蛋白和17种淋巴结转移相关蛋白的功能进行总结,提示它们分别参与调节细胞骨架形成、糖代谢、氧化还原、蛋白质转运、基因转录、mRNA加工等多项细胞生理活动。通过对这些差异表达蛋白的进一步功能研究,可以揭示肿瘤发生及转移的某些关键性分子机制,同时也可以开发出更多肺鳞癌诊断和治疗的靶点。通过数据分析,发现有三种蛋白既在肺鳞癌组织中高表达,又与淋巴结转移相关。它们有潜力成为预测肺鳞癌淋巴结转移的组织标志物。

全文目录

摘要  4-6
Abstract  6-8
前言  8-16
实验材料  16-18
实验方法  18-29
实验结果  29-47
讨论  47-50
小结  50-51
参考文献  51-55
英文縮写对照表  55-56
综述  56-67
  参考文献  65-67
致谢  67-68

肺鳞癌及其淋巴结转移的差异蛋白质组学研究

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