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多酚类化合物与牛血清蛋白相互作用的研究

作 者: 王婧
导 师: 施介华
学 校: 浙江工业大学
专 业: 药物分析学
关键词: 矢车菊素-3-葡萄糖苷 异甘草素 牛血清白蛋白 光谱法 分子对接
分类号: O657.3
类 型: 硕士论文
年 份: 2013年
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内容摘要


本论文采用光谱技术(包括荧光光谱法、同步荧光法、圆二色谱法和紫外-可见光谱法)和分子模拟技术相结合的方法,研究了多酚类化合物与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用。实验结果表明,矢车菊素-3-葡萄糖苷(Cy-3-G)及异甘草素(ISL)对BSA的猝灭类型均为静态猝灭。Cy-3-G及ISL与BSA的结合位点数约为1,形成1:1结合物。310K时,BSA与Cy-3-G和ISL的结合常数(K)分别为5.13×105和5.26×104。由BSA与Cy-3-G和ISL结合过程中热力学参数测定结果表明,BSA与Cy-3-G、ISL的结合过程是一个自发过程(ΔG0<0)。而且,焓变(ΔH0)和熵变(ΔS0)均为负值,表明了BSA与Cy-3-G及ISL结合过程中的主要作用力是氢键和范德华力。从圆二色谱及同步荧光结果可知,Cy-3-G与BSA结合后,对BSA的二级结构影响较小。而ISL与BSA结合后,BSA二级结构及色氨酸和酪氨酸附近的微环境可能发生了改变。分子模拟结果表明,Cy-3-G结合在BSA的site Ⅱ’位上,且Cy-3-G与BSA上的PHE229, ARG232, SER503, LEU504残基形成了氢键。而ISL结合在BSA的site Ⅰ位上,ISL与BSA上的ARG222, ARG280, ALA314, GLU315残基形成了氢键。并且,结合前后客体分子Cy-3-G和ISL的构象发生明显变化。

全文目录


摘要  4-5
ABSTRACT  5-9
第一章 绪论  9-22
  1.1 血清白蛋白  9-11
    1.1.1 血清白蛋白的结构  9-10
    1.1.2 血清白蛋白的功能  10-11
  1.2 多酚类化合物  11-13
    1.2.1 多酚类化合物的分类  11-12
    1.2.2 多酚类化合物的生物学作用  12-13
  1.3 研究方法  13-15
    1.3.1 荧光光谱法  13-14
    1.3.2 同步荧光法  14-15
    1.3.3 紫外-可见吸收光谱法  15
    1.3.4 圆二色谱法  15
  1.4 分子对接技术(DOCKING)  15-20
    1.4.1 分子对接原理  15-16
    1.4.2 分子对接方法分类及常用软件  16-17
    1.4.3 蛋白质序列和结构数据库  17-18
    1.4.4 能量优化算法  18-19
    1.4.5 本论文中使用的对接方法介绍  19-20
  1.5 本课题的研究意义  20-22
    1.5.1 国内外研究现状  20-21
    1.5.2 研究意义  21-22
第二章 光谱法研究矢车菊素-3-葡萄糖苷异甘草素与牛血清蛋白相互作用  22-48
  2.1 前言  22-23
  2.2 实验部分  23-28
    2.2.1 试剂和仪器  23-24
    2.2.2 荧光测定  24-25
    2.2.3 同步荧光测定  25
    2.2.4 距离测定  25-26
    2.2.5 竞争实验  26-28
    2.2.6 圆二色谱的测定  28
  2.3 结果与讨论  28-46
    2.3.1 荧光猝灭及其机理  28-33
    2.3.2 结合常数、结合位点数及热力学常数的确定  33-36
    2.3.3 结合过程中牛血清蛋白结构的变化  36-38
    2.3.4 结合位点的确定  38-44
    2.3.5 距离的确定  44-46
  2.4 本章小结  46-48
第三章 分子模拟法研究CY-3-G及ISL与BSA相互作用  48-58
  3.1 前言  48
  3.2 分子模拟  48-51
    3.2.1 分子模拟过程中用到的数据库与软件  48
    3.2.2 药物与蛋白结构的下载与优化  48-50
    3 2.3 分子对接  50-51
  3.3 结果与讨论  51-57
    3.3.1 Autodock方法模拟矢车菊素-3-葡萄糖苷与牛血清白蛋白作用过程  51-54
    3.3.2 Autodock方法对异甘草素与牛血清白蛋白作用过程的模拟  54-57
  3.4 本章小结  57-58
第四章 结论与展望  58-60
  4.1 结论  58-59
  4.2 展望  59-60
参考文献  60-67
攻读硕士学位期间已发表的论文  67-68
致谢  68

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中图分类: > 数理科学和化学 > 化学 > 分析化学 > 仪器分析法(物理及物理化学分析法) > 光化学分析法(光谱分析法)
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