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多酚类化合物与牛血清蛋白相互作用的研究
作 者: 王婧
导 师: 施介华
学 校: 浙江工业大学
专 业: 药物分析学
关键词: 矢车菊素-3-葡萄糖苷 异甘草素 牛血清白蛋白 光谱法 分子对接
分类号: O657.3
类 型: 硕士论文
年 份: 2013年
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内容摘要
本论文采用光谱技术(包括荧光光谱法、同步荧光法、圆二色谱法和紫外-可见光谱法)和分子模拟技术相结合的方法,研究了多酚类化合物与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用。实验结果表明,矢车菊素-3-葡萄糖苷(Cy-3-G)及异甘草素(ISL)对BSA的猝灭类型均为静态猝灭。Cy-3-G及ISL与BSA的结合位点数约为1,形成1:1结合物。310K时,BSA与Cy-3-G和ISL的结合常数(K)分别为5.13×105和5.26×104。由BSA与Cy-3-G和ISL结合过程中热力学参数测定结果表明,BSA与Cy-3-G、ISL的结合过程是一个自发过程(ΔG0<0)。而且,焓变(ΔH0)和熵变(ΔS0)均为负值,表明了BSA与Cy-3-G及ISL结合过程中的主要作用力是氢键和范德华力。从圆二色谱及同步荧光结果可知,Cy-3-G与BSA结合后,对BSA的二级结构影响较小。而ISL与BSA结合后,BSA二级结构及色氨酸和酪氨酸附近的微环境可能发生了改变。分子模拟结果表明,Cy-3-G结合在BSA的site Ⅱ’位上,且Cy-3-G与BSA上的PHE229, ARG232, SER503, LEU504残基形成了氢键。而ISL结合在BSA的site Ⅰ位上,ISL与BSA上的ARG222, ARG280, ALA314, GLU315残基形成了氢键。并且,结合前后客体分子Cy-3-G和ISL的构象发生明显变化。
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全文目录
摘要 4-5 ABSTRACT 5-9 第一章 绪论 9-22 1.1 血清白蛋白 9-11 1.1.1 血清白蛋白的结构 9-10 1.1.2 血清白蛋白的功能 10-11 1.2 多酚类化合物 11-13 1.2.1 多酚类化合物的分类 11-12 1.2.2 多酚类化合物的生物学作用 12-13 1.3 研究方法 13-15 1.3.1 荧光光谱法 13-14 1.3.2 同步荧光法 14-15 1.3.3 紫外-可见吸收光谱法 15 1.3.4 圆二色谱法 15 1.4 分子对接技术(DOCKING) 15-20 1.4.1 分子对接原理 15-16 1.4.2 分子对接方法分类及常用软件 16-17 1.4.3 蛋白质序列和结构数据库 17-18 1.4.4 能量优化算法 18-19 1.4.5 本论文中使用的对接方法介绍 19-20 1.5 本课题的研究意义 20-22 1.5.1 国内外研究现状 20-21 1.5.2 研究意义 21-22 第二章 光谱法研究矢车菊素-3-葡萄糖苷及异甘草素与牛血清蛋白相互作用 22-48 2.1 前言 22-23 2.2 实验部分 23-28 2.2.1 试剂和仪器 23-24 2.2.2 荧光测定 24-25 2.2.3 同步荧光测定 25 2.2.4 距离测定 25-26 2.2.5 竞争实验 26-28 2.2.6 圆二色谱的测定 28 2.3 结果与讨论 28-46 2.3.1 荧光猝灭及其机理 28-33 2.3.2 结合常数、结合位点数及热力学常数的确定 33-36 2.3.3 结合过程中牛血清蛋白结构的变化 36-38 2.3.4 结合位点的确定 38-44 2.3.5 距离的确定 44-46 2.4 本章小结 46-48 第三章 分子模拟法研究CY-3-G及ISL与BSA相互作用 48-58 3.1 前言 48 3.2 分子模拟 48-51 3.2.1 分子模拟过程中用到的数据库与软件 48 3.2.2 药物与蛋白结构的下载与优化 48-50 3 2.3 分子对接 50-51 3.3 结果与讨论 51-57 3.3.1 Autodock方法模拟矢车菊素-3-葡萄糖苷与牛血清白蛋白作用过程 51-54 3.3.2 Autodock方法对异甘草素与牛血清白蛋白作用过程的模拟 54-57 3.4 本章小结 57-58 第四章 结论与展望 58-60 4.1 结论 58-59 4.2 展望 59-60 参考文献 60-67 攻读硕士学位期间已发表的论文 67-68 致谢 68
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中图分类: > 数理科学和化学 > 化学 > 分析化学 > 仪器分析法(物理及物理化学分析法) > 光化学分析法(光谱分析法)
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