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南大西洋深海细菌的分离及多样性分析

作　者: 马瑞
导　师: 闫培生
学　校: 哈尔滨工业大学
专　业: 微生物学
关键词: 深海 深海细菌 多样性 抗真菌
分类号: Q938.8
类　型: 硕士论文
年　份: 2013年
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内容摘要


深海这一特殊的生态环境中蕴藏着极为丰富的生物资源，而微生物是这类资源中数量和种类最多的。这些生物体内的产生的各种活性物质，特别是酶，具有高度的耐受性和较强的抗毒能力，是最具研究和应用价值的部分。另外，研究海洋微生物的多样性，可以使我们更加全面、立体、深刻的认识海洋环境，不仅可以为开发利用海洋微生物资源提供重要的参考依据，还可以为人类了解生命起源和进化提供重要的线索。本文选用不同的培养基和处理方法对南大西洋深海海水样品和沉积物样品进行细菌的分离、纯化、培养，通过16S rDNA序列分析对分离菌株进行鉴定和多样性分析，并研究了部分菌株对寄生曲霉生长和黄曲霉毒素产生的影响。使用2种培养基从海水样品中共分离纯化到265个菌株，进行16S rDNA序列分析，得到237个菌株的测序结果，分为47个属，Erythrobacter、Altero-monas和Marinobacter为优势菌属，17个菌株与模式菌株相似性低于97%，为潜在新种。选择5种培养基对15个深海沉积物样品进行分离共得到848株菌，进行16S rDNA序列分析，得到474株菌的鉴定结果，分为23个属，多数样品中优势菌株为Halomonas和Marinobacter，属于γ-Proteobacteria类群。随机选出195株海洋细菌在淡水GY和海水GY上进行抗寄生突变曲霉实验，海洋细菌在两种培养基上的生长情况呈现多样化，表明其生长类型和对营养物质的利用以及对培养环境的适应能力是多样的，多数细菌更适应海水培养基。有33株对寄生曲霉突变菌株NFRI-95表现出不同程度的抑制率和抑红率，多数菌株均在海水GY上表现出更高的抑制率。

全文目录


摘要  4-5
Abstract  5-8
第1章 绪论  8-18
  1.1 课题来源及研究目的  8
    1.1.1 课题来源  8
    1.1.2 研究目的  8
  1.2 课题研究背景  8-9
  1.3 课题研究现状  9-17
    1.3.1 海洋及深海环境概况  9-10
    1.3.2 深海开发及深海微生物研究  10-12
    1.3.3 深海微生物的应用价值  12-13
    1.3.4 深海微生物的多样性  13-15
    1.3.5 深海微生物多样性研究方法  15-17
  1.4 课题研究内容  17-18
第2章 深海细菌的分离  18-28
  2.1 实验材料  18-19
    2.1.1 实验仪器  18
    2.1.2 实验试剂  18
    2.1.3 实验样品  18-19
  2.2 实验方法  19-21
    2.2.1 海水样品  19-20
    2.2.2 沉积物样品  20-21
  2.3 结果与分析  21-25
    2.3.1 海水样品分离结果  21-22
    2.3.2 沉积物样品分离结果  22-25
  2.4 讨论  25-26
    2.4.1 海水样品  25
    2.4.2 沉积物样品  25-26
  2.5 本章小结  26-28
第3章 菌株的分子鉴定与多样性分析  28-48
  3.1 实验材料  28-29
    3.1.1 实验仪器  28
    3.1.2 实验试剂及溶液  28
    3.1.3 引物  28
    3.1.4 软件  28-29
  3.2 实验方法  29-32
    3.2.1 PCR 扩增  29
    3.2.2 细菌基因组 DNA 提取  29-30
    3.2.3 琼脂糖凝胶电泳  30
    3.2.4 16S rDNA 测序  30
    3.2.5 系统发育树的构建与同源性分析  30-32
  3.3 结果与分析  32-45
    3.3.1 海水样品分子鉴定结果  32-35
    3.3.2 沉积物样品分子鉴定结果  35-38
    3.3.3 系统发育树的构建及同源性分析  38-45
  3.4 讨论  45-46
  3.5 本章小结  46-48
第4章 抗寄生曲霉菌株的筛选及抑菌能力的测定  48-58
  4.1 实验材料  48-49
    4.1.1 实验菌株  48
    4.1.2 实验试剂  48
    4.1.3 实验仪器  48-49
  4.2 实验内容  49
  4.3 实验方法  49
    4.3.1 寄生曲霉孢子悬液的制备  49
    4.3.2 活性菌株的筛选  49
  4.4 结果与分析  49-56
    4.4.1 海水对细菌生长的影响  49-55
    4.4.2 抑菌抑毒活性菌株的抑制效果  55-56
  4.5 讨论  56-57
  4.6 本章小结  57-58
结论  58-60
参考文献  60-66
致谢  66

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中图分类: > 生物科学 > 微生物学 > 微生物生态学和地区分布 > 水生微生物学
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