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珠江水系鳜鱼的遗传多样性研究

作　者: 司从利
导　师: 章群
学　校: 暨南大学
专　业: 生态学
关键词: 珠江水系 鳜鱼 遗传多样性
分类号: S917.4
类　型: 硕士论文
年　份: 2012年
下　载: 98次
引　用: 3次
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内容摘要


鳜鱼隶属鲈形目（Perciformes）鮨科（Serranidae）鳜亚科（Sinipercinae）。鳜鱼作为东亚地区特有的名贵鱼类，具有较高的生态价值、经济价值和科研价值。鳜鱼因其肉质细嫩、味道鲜美、营养丰富，而受到广大消费者的欢迎。长期以来，受自然环境因素和人为因素两方面的影响，珠江水系鳜鱼的遗传多样性急剧下降。一方面，气候异常变化、地质灾害频发破坏了鳜鱼的生境；另一方面过度捕捞、人工养殖、环境污染及修建水坝，不仅使鳜鱼的个体迅速下降、种质资源受到破坏，而且影响了不同群体间的基因交流。不仅珠江，在长江流域鳜鱼也面临着遗传多样性下降的严峻趋势。作为东亚地区特有的重要经济鱼类，鳜鱼急需加强保护。本文基于线粒体细胞色素b基因，对珠江水系干流及其4个主要支流共计126尾鳜鱼进行遗传多样性分析。得到如下结果：1.遗传多样性方面，珠江7个地理群体的126尾鳜鱼中，共发现16个单倍型，平均单倍型多样性（Hd）为0.773，核苷酸多样性（Pi）为0.00195，呈现高单倍型多样性低核苷酸多样性的特点。表明鳜鱼可能经历过瓶颈效应或奠基者效应，短期内通过变异积累了足够的单倍型多样性，但相同时间却不足以积累核苷酸多样性。其中以柳州群体遗传多样性最高，而三江群体遗传多样性最低，这可能是因为三江地区地质结构复杂，鱼类生活环境较差，而柳州地区区域稳定性较好且处于柳江干流，便于与其他群体进行基因交流。2.遗传分化方面：基于线粒体Cytb基因的NJ系统树中，不同地理群体的鳜鱼没有表现出明显的地理聚群现象，说明没有形成明显的地理结构。珠江水系7个地理群体之间的遗传距离均为0.002，各群体内部遗传距离在0.001-0.002之间。AMOVA分析结果表明，群体间差异仅为8.40%，而群体个体间差异高达88.04%，说明珠江不同水体之间的差异主要来自群体个体间的变异。珠江水系7个地理群体中，三江群体和其他群体之间均发生了不同程度的遗传分化，这可能是由于三江处于柳江支流上游，远离干流，且三江地理环境较差，故阻碍了三江群体同其他群体间的基因交流。3.种群扩张方面：歧点分布图、Tajima’s D和Fu’s Fs中性检验结果都表明，在7个鳜鱼群体中，三江群体和柳州群体历史上发生过种群扩张，而鳜鱼作为一个大的群体没有发生过扩张。估计出鳜鱼三江群体、柳州群体的种群扩张时间分别为15~40万年前、18~45万年前。

全文目录


摘要  3-5
Abstract  5-7
目录  7-9
第一章 前言  9-29
  1.1 珠江流域简介  9-12
    1.1.1 珠江流域的自然地理概况  9-10
    1.1.2 珠江流域气候、水文及水资源状况  10
    1.1.3 珠江流域鱼类资源状况  10-12
  1.2 鳜鱼概述  12-22
    1.2.1 鳜鱼的分类地位及地理分布  12-13
    1.2.2 鳜鱼的形态特征  13
    1.2.3 鳜鱼的生物学特性  13-17
    1.2.4 鳜鱼的经济价值  17
    1.2.5 鳜鱼的常见疾病及防治方法  17-18
    1.2.6 鳜鱼的研究进展  18-21
    1.2.7 鳜鱼资源现状  21-22
  1.3 鱼类遗传多样性研究  22-26
    1.3.1 遗传多样性介绍  22-23
    1.3.2 分子标记的选择  23-25
    1.3.3 分子系统树的构建  25-26
  1.4 动物线粒体的特征  26-27
  1.5 细胞色素 b 基因的功能及特点  27
  1.6 本研究的目的意义  27-29
第二章 材料和方法  29-36
  2.1 实验材料及来源  29-30
  2.2 实验仪器和主要试剂  30-32
    2.2.1 实验仪器  30-31
    2.2.2 实验试剂  31-32
  2.3 实验方法  32-35
    2.3.1 DNA 的提取与检测  32-33
    2.3.2 PCR 扩增  33-35
    2.3.3 序列测定  35
  2.4 数据处理  35-36
第三章 实验结果与分析  36-53
  3.1 鳜鱼线粒体 Cytb 基因的序列分析  36-37
  3.2 鳜鱼的遗传多样性分析  37-39
    3.2.1 单倍型分布情况  37-38
    3.2.2 遗传多样性指数  38-39
  3.3 鳜鱼的遗传结构分析  39-47
    3.3.1 鳜鱼群体间的遗传距离  39-40
    3.3.2 鳜鱼群体间的遗传分化系数和基因流  40-42
    3.3.3 鳜鱼系统发育树  42-47
  3.4 鳜鱼的种群历史动态  47-52
    3.4.1 中性检测  47-48
    3.4.2 歧点分布  48-51
    3.4.3 鳜鱼单倍型间的网状支系分布  51-52
  3.5 鳜鱼群体遗传变异分析  52-53
第四章 讨论  53-59
  4.1 珠江水系鳜鱼的遗传多样性分析  53-54
  4.2 珠江水系鳜鱼群体间的遗传分化  54-56
  4.3 珠江水系鳜鱼群体的种群动态  56-57
  4.4 珠江水系鳜鱼的保护  57-59
第五章 结论与展望  59-60
参考文献  60-73
硕士期间发表论文  73-74
致谢  74

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中图分类: > 农业科学 > 水产、渔业 > 水产基础科学 > 水产生物学 > 水产动物学
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