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烟草抗马铃薯γ病毒(PVY)育种、抗性基因的克隆与功能分析
作 者: 陈荣平
导 师: 杨铁钊
学 校: 河南农业大学
专 业: 烟草学
关键词: 烟草马铃薯Y病毒(PVY) 抗PVY的烟草品种 抗性基因 抑制性消减杂交 eIf4E
分类号: S572
类 型: 博士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
马铃薯Y病毒(Potato virus Y, PVY)是我国烟叶生产中的主要病害之一,近年来,随着农村保护地蔬菜栽培和马铃薯种植面积的扩大,烟草PVY病毒病的发生与危害呈现急剧上升趋势,在黑龙江、吉林、辽宁、山东、安徽和云南相继出现大面积爆发流行,造成了严重的经济损失。针对我国烟区缺乏抗PVY品种的生产实际,本研究通过筛选烟草PVY抗源,并对主要抗源材料进行抗性遗传分析,克隆其抗性基因,同时开展抗PVY烟草育种工作,主要包括以下内容:1.采用人工接种方式,在温室和田间病圃中分别对17份和114份烟草种质进行PVY抗病性鉴定,筛选出高抗马铃薯Y病毒的烟草种质资源C151、CV91,达到中抗水平的有CV87,87414和NC55,表现多基因水平抗性。2.对C151、CV91、CV87和NC55等抗源材料进行了抗性遗传分析,证实C151为少数基因控制,不完全显性,CV91为少数隐性基因控制,易受显性感病基因影响,与没有显性感病基因品种杂交表现抗性。CV87分别与IslandGold和龙江851杂交组合的F2代抗感比例不同且表现连续分布,证实为多数微效基因控制,且为加性基因控制。NC55×9625组合F2代中无病株-病轻株-病重株≈8-5-3,基本表现连续分布,NC55是多数微效抗性基因。3.利用高抗PVY的CV91做亲本,选育出了烤烟常规纯系品种龙江911和杂种优势利用品种LJ237,其中龙江911为中抗马铃薯Y病毒病,LJ237高抗马铃薯Y病毒病,利用CV87育成了抗马铃薯Y病毒的烤烟品种LJ981。4.提出微效水平抗性基因富集思路,利用中等水平抗性资源,选配适当的杂交组合,在杂交后代材料中富集、浓缩抗性基因,得到高于抗性亲本抗性的品种,重视水平抗性资源的开发与利用。5.以高抗PVY的C151为试验材料,利用抑制差减杂交技术(Suppression SubtractiveHybridization,SSH)构建了抗PVY相关基因的烟草叶片SSH文库,对烟草叶片接种PVY前后的差异表达基因片段进行测序,得到280多条EST序列。利用NCBI上的GenBank等公共数据库对所获得的280多条EST序列进行生物信息分析和功能预测,其中与光合作用有关的RuBP羧化酶相关蛋白基因片段96条,林烟草和绒毛烟草叶绿体DNA片段12条,与抗病性有关的有:脂质转化酶基因片段15条,突变的过氧化氢酶基因片段8条,蛋白酶抑制剂基因片段32条,铁氧还蛋白和铁硫蛋白基因片段26条,糖基转移酶3条,富含甘氨酸蛋白质前体蛋白9条。其他序列86条,未知基因片段71条。6、利用荧光定量PCR对5个可能与抗病性有关诱导表达片段的从开始接种到接种后72小时之间的0小时,12小时,24小时,36小时和72小时5个时间点基因的差异表达,并证实了所获得的基因序列为真实诱导的表达序列。对此序列进行RACE,最终获得一个与PVY抗病性有关的全长cDNA序列。7、采用同源序列法,根据抗PVY的辣椒品种中的eIF4E基因序列设计扩增引物,在抗PVY的CV91、C151等烟草品种扩增晒选抗性基因,在CV91品种中克隆出了与马铃薯Y病毒抗性有关的翻译起始因子eIF4E基因。8、通过比对该eIF4E基因的核酸序列,发现与感病品种有两个突变位点,导致病毒基因不能翻译,产生抗病性。
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全文目录
致谢 4-9 摘要 9-11 1 文献综述 11-38 1.1 马铃薯 Y 病毒病研究现状 11-15 1.1.1 马铃薯 Y 病毒的分子生物学研究 11-12 1.1.2 马铃薯 Y 病毒的株系划分 12-14 1.1.3 马铃薯 Y 病毒的传播 14-15 1.2 烟草马铃薯 Y 病毒病的危害与防治 15-18 1.2.1 烟草马铃薯 Y 病毒病的危害 15-17 1.2.2 烟草马铃薯 Y 病毒病的防治 17-18 1.3 烟草抗马铃薯 Y 病毒品种的选育 18-20 1.3.1 烟草抗马铃薯 Y 病毒种质资源的收集与研究 18 1.3.2 烟草抗马铃薯 Y 病毒病育种 18-20 1.4 植物抗病机制研究 20-23 1.4.1 植物转脂蛋白(lipid transfer protein)研究 21 1.4.2 RNA 干扰(RNA interference)机制 21-22 1.4.3 病毒翻译障碍机制 22-23 1.5 植物抗病基因的种类 23-25 1.5.1 植物抗病基因分类 23-25 1.5.2 植物自身的马铃薯 Y 病毒抗性基因 25 1.6 植物抗病基因的克隆策略 25-29 1.6.1 功能克隆(functional Cloning) 25-26 1.6.2 定位克隆(Positional cloning) 26 1.6.3 人工合成并克隆基因 26 1.6.4 转座子标记法(transposon tagging) 26-27 1.6.5 表型克隆(phenotype cloning) 27 1.6.6 mRNA 差异显示(mRNA differential display) 27-28 1.6.7 减法杂交(Subtractive hybridization) 28 1.6.8 依据序列同源性克隆基因 28 1.6.9 同系位候选法 28-29 1.7 抑制性消减杂交(suppression subtractive byridization,SSH)技术原理与程序 29-32 1.8 同源序列克隆的原理与程序 32-36 1.8.1 全长 cDNA 文库构建 33-35 1.8.2 RACE 35-36 1.9 本研究的目的意义 36-38 2 烟草抗马铃薯 Y 病毒种质资源的筛选 38-51 2.1 试验材料与试验设计 38-42 2.1.1 试验材料 38-41 2.1.2 试验设计 41 2.1.3 调查、统计方法 41-42 2.2 结果与分析 42-48 2.2.1 温室接种鉴定结果 42 2.2.2 田间病圃鉴定结果 42-48 2.3 结论与讨论 48-51 3 烟草马铃薯 Y 病毒主要抗源材料的抗性遗传分析 51-55 3.1 试验材料与田间试验设计 51 3.1.1 试验材料 51 3.1.2 试验设计 51 3.2 结果与分析 51-53 3.3 结论与讨论 53-55 4 烟草抗马铃薯 Y 病毒育种 55-64 4.1 试验材料 55 4.2 试验设计与步骤 55-56 4.3 结果与分析 56-62 4.3.1 选择抗 PVY 杂交杂交后代材料情况 56-57 4.3.2 育成抗病品种情况 57-62 4.4 结论与讨论 62-64 5 烟草 PVY 诱导的抑制性消减文库的建立及 EST 分析 64-87 5.1 试验材料 64 5.1.1 供试品种 64 5.1.2 试验材料的准备 64 5.2 取样 64 5.3 耗材试剂 64-66 5.4 仪器设备 66-67 5.5 方法 67-69 5.5.1 总 RNA 的提取 67 5.5.2 RNA 质量检测 67-69 5.6 mRNA 分离纯化 69-77 5.6.1 实验操作步骤 69-71 5.6.1.1 实验准备 69 5.6.1.2. 操作 69 5.6.1.3 合成第一链 cDNA 69-70 5.6.1.4 合成 cDNA 第二链 70-71 5.6.1.5 实验参数 71 5.6.1.6 电泳检测 71 5.6.2 cDNA RsaI 酶切 71-73 5.6.3 接头连接 73-74 5.6.4 差减杂交 74-77 5.7 实验结果与分析 77-86 5.7.1 烟叶总 RNA 的提取结果 77-78 5.7.2 插入片段检测 78 5.7.3 cDNA 文库构建 78 5.7.4 EST 处理及文库分析 78-81 5.7.5 影响文库质量的因素 81-82 5.7.6 相关抗病基因的分析 82-84 5.7.7 功能验证 84-86 5.8 结论与讨论 86-87 6 烟草与 PVY 抗性有关的 eIF(iso)4E 克隆与分析 87-94 6.1 试验材料 87-88 6.2 试剂与仪器 88 6.3 方法 88-89 6.3.1 引物设计 88 6.3.2 PCR 扩增体系 88-89 6.3.3 烟草 DNA 和 RNA 的提取 89 6.3.4 烟草 eIF4E、eIF(iso)4E 基因 cDNA 的合成及克隆 89 6.3.5 RACE 克隆全长基因 89 6.3.6 克隆片段的测序与分析 89 6.4 结果与分析 89-93 6.4.1 各品种(系)DNA 筛选结果 89-90 6.4.2 RNA RT-PCR 扩增产物分析 90-92 6.4.3 CV91 品种 eIF4E 基因 RACE 克隆产物分析 92-93 6.5 结论与讨论 93-94 7 论文总结 94-95 参考文献 95-105 Abstract 105-106
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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 经济作物 > 烟草(菸草)
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