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丹参雄性不育基因的AFLP标记
作 者: 王真
导 师: 慕小倩; 郭宏波
学 校: 西北农林科技大学
专 业: 药用植物学
关键词: 丹参 雄性不育 AFLP
分类号: S567.53
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
丹参(Salvia miltiorrhiza Bge.)为我国常见的传统中药材之一,在临床上被广泛应用于心血管疾病的预防与治疗上。近年来随着对野生资源的过度开采以及生产管理方式的落后,导致现有种质资源严重退化,药材质量下降,在一定程度上影响了其疗效。雄性不育是植物界存在的一种普遍现象,大量研究表明,利用雄性不育系培育品种在很多方面都有独特的优势。2002年舒志明等在田间发现了丹参雄性不育株,并命名为Sh-B,这为实现丹参品质的遗传改良及其杂种优势利用开辟了新的道路。本研究在此基础上利用AFLP标记技术,筛选出与丹参育性基因紧密连锁的分子标记,以期为丹参雄性不育材料的转育和利用提供依据。试验中得到的主要结果和结论如下:1田间群体育性调查结果发现,在随机调查的73株单株中,不育株为37株,可育株为36株,卡方检验符合1:1的理论分离比;2通过优化试验条件,获得了一种以CTAB法为基础的快速、简便分离完整基因组DNA的方法,该技术可有效地从富含多酚和多糖的药用植物中分离出高质量的DNA并直接用于AFLP分析;3本研究采用扩增片段长度多态性(AFLP)的分子标记方法结合群分法(BSA)构建的不育/可育基因池,通过筛选128对引物组合,发现共有5对引物在两个基因池间表现出稳定的多态性;4将上述筛选出的引物组合用73株单株进行群体验证,研究发现仅有1对引物与丹参育性基因之间存在连锁关系,记为E11/M4;该标记在群体中的重组率为6.85%,由Kosambi函数计算得出它们之间的遗传距离为6.89cM;5试验将通过群体验证得到的标记片段回收、克隆到pGM-T载体进行测序。测序结果表明,该片段全长208bp,其碱基组成为A+T=51.92%;将该序列提交到NCBI网站运行Blastn程序与拟南芥基因组进行比对,结果发现其与拟南芥具有较高的同源性。
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全文目录
摘要 5-6 ABSTRACT 6-10 第一章 文献综述 10-22 1.1 植物雄性不育的类型及特点 10-13 1.1.1 细胞核雄性不育(GMS) 11 1.1.2 细胞质雄性不育(CMS) 11-13 1.2 植物雄性不育研究进展 13-17 1.2.1 植物雄性不育的形态学和细胞学研究进展 13-15 1.2.2 植物雄性不育的生理生化研究进展 15-16 1.2.3 植物雄性不育的分子机制研究进展 16-17 1.3 AFLP 分析的原理及应用 17-19 1.3.1 AFLP 标记的原理 18 1.3.2 AFLP 标记的应用 18-19 1.4 本研究的目的及意义 19-22 第二章 材料和方法 22-32 2.1 试验材料 22 2.1.1 植物材料 22 2.1.2 酶及试剂 22 2.1.3 仪器设备 22 2.1.4 菌株及载体 22 2.2 试验方法 22-32 2.2.1 田间群体的构建和培养 22 2.2.2 田间育性调查 22-23 2.2.3 AFLP 引物的筛选 23-28 2.2.3.1 丹参叶片基因组 DNA 的提取与纯化 23 2.2.3.2 不育池和可育池的构建 23-25 2.2.3.4 预扩增体系及步骤 25 2.2.3.5 选择性扩增体系及步骤 25-26 2.2.3.6 变性聚丙烯酰胺电泳 26-28 2.2.4 群体验证 28 2.2.5 多态性 DNA 片段的回收与重扩增 28-29 2.2.6 目的片段的克隆 29-32 第三章 结果与分析 32-40 3.1 田间试验结果分析 32 3.2 室内试验结果分析 32-40 3.2.1 丹参基因组 DNA 质量检测结果与分析 32-33 3.2.2 基因组 DNA 酶切、连接结果检测 33-34 3.2.3 预扩增结果检测 34-35 3.2.4 选择性扩增及多态性引物筛选结果分析 35-36 3.2.5 群体验证结果分析及遗传距离计算 36-37 3.2.6 变性聚丙烯酰胺凝胶上差异片段的回收与二次扩增 37-38 3.2.7 差异片段的克隆、测序 38 3.2.8 序列比对分析 38-40 第四章 讨论 40-45 4.1 基因组 DNA 的提取 40 4.2 AFLP 标记内切酶和引物的选择 40-41 4.3 AFLP 扩增中应注意的问题 41-42 4.4 银染及聚丙烯酰胺凝胶上差异片段的回收问题 42-43 4.5 AFLP 分子标记技术的应用价值 43-45 第五章 结论 45-46 参考文献 46-52 附录 52-53 缩略词表 53-54 致谢 54-55 作者简介 55
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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 经济作物 > 药用作物 > 喜阴药物 > 其他
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