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马传染性贫血病毒分离株WH17全基因组克隆、序列分析及LTR启动子活性研究
作 者: 鲁山
导 师: 童光志;陈焕春
学 校: 华中农业大学
专 业: 预防兽医学
关键词: 马传染性贫血病毒 前病毒 序列分析 长末端重复序列 转录调控
分类号: S852.65
类 型: 硕士论文
年 份: 2006年
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内容摘要
马传染性贫血病毒(Equine infectious anemia virus,EIAV)是反转录病毒科慢病毒属成员之一,可以引起马属动物的一种急性烈性传染病,以贫血、持续感染、反复发热为特征,终生持续感染,是马属动物最重要的传染病之一。反转录病毒前病毒基因组长末端重复序列(LTR)对病毒复制有重要的调控作用,影响到病毒的复制动力学、细胞嗜性、致病力等方面。 本研究利用PCR方法分四个片段扩增了从自然感染马分离的马传染性贫血病毒(简称马传贫)的前病毒DNA,将PCR产物克隆于pMD18-T载体,得到四个重组质粒P2.8、P2.4、P2.6、P1.2。经PCR、酶切鉴定后进行序列测定,分析、拼接得到马传染性贫血病毒野外分离株前病毒的全基因组序列,其基因组全长8268bp。通过DNAStar分析,此分离株与马传贫病毒L株(L-EIAV)、马传贫驴强毒株(DA-EIAV)、马传贫驴白细胞弱毒疫苗株(DLA-EIAV)的序列同源性分别为86.0%、85.8%和85.2%。 通过对EIAV分离株WH17的LTR与L株、DA和DLA株的LTR序列进行比较,发现其在在U3-R结合处多一个E-box基序,推测该基序的变化可能会起到促进转录作用,为此将EIAV强毒株(DLA-25)、驴白细胞弱毒株(DLA-118)、EIAV分离株WH17以及U3-R结合处的E-box基序点突变的LTR分别克隆到pCAT3-basic质粒中的报告基因氯霉素乙酰转移酶(CAT)的上游,获得一系列受不同LTR控制的CAT表达质粒。分别将含有不同来源LTR的CAT表达质粒转染驴胎皮肤细胞(FDD)、驴白细胞及接种EIAV弱毒的FDD及驴白细胞,结果显示:在驴白细胞Tat蛋白可以特异性地增强EIAV-DLALTR的启动子活性,分离株WH17LTR的U3-R结合处的E-box基序对Tat的反式激活作用并无明显影响,而在驴胎皮肤细胞中,LTR启动活性也没有检测到。结果提示:EIAV分离株WH17的LTR U3-R结合处的E-box基序没有起到促进转录的作用,LTR是病毒嗜性影响的因素之一。
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全文目录
目录 3-5 摘要 5-6 Abstract 6-7 文献综述 7-25 1.1 马传染性贫血病毒概述 7-12 1.1.1 EIAV的历史及分类地位 7-8 1.1.2 EIAV的形态和理化特性 8-9 1.1.3 国内外EIAV毒株及特性 9-10 1.1.4 EIAV的血凝性 10-11 1.1.5 EIAV的细胞嗜性 11 1.1.5 EIAV的致病性 11-12 1.2 马传染性贫血病毒的分子生物学 12-21 1.2.1 EIAV基因组结构 13-14 1.2.2 gag基因及其编码蛋白 14-15 1.2.3 pol基因及其编码蛋白 15-16 1.2.4 env基因及其编码产物 16-18 1.2.5 EIAV的其它小开放阅读框架及其编码产物 18-19 1.2.6 EIAV的非编码区-LTR 19-21 1.3 慢病毒与糖基化 21 1.4 EIAV的复制、蛋白质合成和形态发生 21-23 1.5 EIAV分子致病机制 23-24 1.6 EIAV感染的免疫控制 24-25 第二章 马传染性贫血病毒分离株的全基因组克隆和序列分析 25-42 2.1 研究目的和意义 25 2.2 材料和方法 25-28 2.2.1 毒株 25 2.2.2 实验动物 25 2.2.3 酶和主要试剂 25-26 2.2.4 引物设计 26 2.2.5 大肠杆菌感受态细胞制备(氯化钙法) 26-27 2.2.6 质粒的转化 27 2.2.7 质粒的少量制备(碱裂解法) 27 2.2.8 前病毒全基因的PCR扩增 27 2.2.9 基因的克隆与鉴定 27 2.2.10 序列测定和分析 27-28 2.3 结果 28-42 2.3.1 PCR扩增和重组质粒的鉴定 28 2.3.2 前病毒全基因组序列 28-35 2.3.3 分离株WH17与国内L株、DA、DLA株核苷酸和氨基酸比较 35-36 2.3.4 分离株WH17与国外毒株核苷酸和氨基酸序列比较 36-37 2.3.5 gag、pol和其编码的蛋白的比较结果 37 2.3.6 gp90序列分析 37-39 2.3.7 LTR序列分析 39-40 2.3.8 TAT的比较结果 40 2.3.9 S2蛋白的比较 40-41 2.3.10 REV蛋白的比较 41-42 第三章 马传染性贫血病毒分离株WH17LTR(长末端重复序列)启动子活性研究 42-51 3.1 研究目的与意义 42 3.2 材料和方法 42-46 3.2.1 载体和细胞 42 3.2.2 毒株 42 3.2.3 试剂和引物 42-43 3.2.4 PCR的扩增 43 3.2.5 E-box的点突变(N-191C-T) 43-44 3.2.6 重组质粒pLTR的构建 44 3.2.7 质粒的纯化 44-45 3.2.8 重组EIAV Tat瞬时表达与间接免疫荧光检测 45 3.2.9 PCDNA3.1-Tat转染FDD和健康驴白细胞 45 3.2.10 间接免疫荧光检测Tat的表达 45-46 3.2.11 重组质粒pLTR转染EIAV阴性健康驴白细胞和FDD细胞 46 3.2.12 CAT活性的检测 46 3.3 结果 46-49 3.3.1 重组质粒的鉴定 47 3.3.2 重组质粒的酶切鉴定 47 3.3.2 突变分子克隆的获得 47 3.3.3 PCDNA3.1-Tat的间接免疫荧光检测 47-48 3.3.4 CAT ELISA检测结果 48-49 3.2 讨论 49-51 讨论 51-54 结论 54-55 参考文献 55-62 致谢 62-63 附录 63
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 兽医基础科学 > 家畜微生物学(兽医病原微生物学) > 家畜病毒学
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